New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 668580 = | 197 (1.030) | 15 (0.080) | 9/152 | NT | 7.7% | coding (565/1011 nt) | adh | Alcohol dehydrogenase |
? | USA300TCH1516_ALE | 668601 = | 172 (0.950) | coding (586/1011 nt) | adh | Alcohol dehydrogenase |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
GGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTATGAAATTA > USA300TCH1516_ALE/668511‑668690 | gtgtTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAAATGTTGCCTTCGACATCAatga > 1:934556/1‑91 (MQ=255) tgtTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAatgat < 2:2047690/91‑1 (MQ=255) tttttGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAAtgatga < 1:1364122/91‑1 (MQ=255) tcaacatctttagaattaataatagcatcagcacctaattctttcgcgaatgctaatttatcatcATTGTTGCCTTCGACATCAAtgatga > 1:2004682‑M1/66‑91 (MQ=255) ttttGGTATAGGTGGATTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGACTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATgatgat > 1:3312508/1‑91 (MQ=255) ttGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATaa > 2:1484998/1‑91 (MQ=255) ttGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATaa < 2:3025899/91‑1 (MQ=255) gTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAAtt < 2:891251/91‑1 (MQ=255) tataGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTa < 2:183864/91‑1 (MQ=255) taGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGc > 2:592723/1‑91 (MQ=255) aGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCa < 1:2609365/91‑1 (MQ=255) aGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCa < 2:2355861/91‑1 (MQ=255) aGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCa < 1:3495070/91‑1 (MQ=255) gtggtTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCAtt > 2:2147093/1‑91 (MQ=255) gtggtTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCAtt > 2:2680751/1‑91 (MQ=255) ggtTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTcg < 2:3269118/91‑1 (MQ=255) gtTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTcgc > 2:2934306/1‑91 (MQ=255) gtTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTcgc > 1:626329/1‑91 (MQ=255) tttAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTcgcg < 2:618915/91‑1 (MQ=255) ttAGGTAACCTAGCTTTACAATACGCTAATGACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGCCACCCATGCTGGTAAATTAGCATTcgcgc > 2:2519539/1‑90 (MQ=255) ataatagcatcagcacctaattctttcgcgaatgctaatttatcatcattgatgtcgaaggcaacaatGATGATAAATTAGCATTCGCGaa > 1:29926‑M2/69‑91 (MQ=255) ataatagcatcagcacctaattctttcgcgaatgctaatttatcatcattgatgtcgaaggcaacaatGATGATAAATTAGCATTCGCGaa > 1:29942‑M2/69‑91 (MQ=255) ataatagcatcagcacctaattctttcgcgaatgctaatttatcatcattgatgtcgaaggcaacaatGATGATAAATTAGCATTCGCGaa > 1:1623831‑M2/69‑91 (MQ=255) aGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGaaa < 1:1433952/91‑1 (MQ=255) gTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGATAGa > 1:3009093/1‑91 (MQ=255) gTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGa > 1:2495489/1‑91 (MQ=255) tAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGGGAAAGaa > 2:3444701/1‑91 (MQ=255) tAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGaa < 2:3851158/91‑1 (MQ=255) tAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGaa < 2:2848668/91‑1 (MQ=255) tAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGaa < 2:1974288/91‑1 (MQ=255) aaCCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAAt > 1:1608654/1‑91 (MQ=255) aaCCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAAt < 1:3673308/91‑1 (MQ=255) aCCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAAtt > 1:575280/1‑91 (MQ=255) ccTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTa < 1:1680550/91‑1 (MQ=255) cTNGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTANGGGGGCTAANATTGTTGNCTTCGACATCAATGATGATANATTAGCATTCGCGAAAGAATTAg < 2:347027/91‑1 (MQ=255) cTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAg < 1:2730/91‑1 (MQ=255) aGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGt > 2:65416/1‑91 (MQ=255) gCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTg < 2:734133/91‑1 (MQ=255) cTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATGCGCGAAAGAATTAGGTGc > 1:1019463/1‑91 (MQ=255) ttACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTg > 2:2853758/1‑91 (MQ=255) ttACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTg > 1:3293068/1‑91 (MQ=255) aCAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGAt > 2:1425777/1‑91 (MQ=255) aCAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGAt > 2:1269430/1‑91 (MQ=255) aCAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGAt < 1:2010209/91‑1 (MQ=255) aaTATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGc < 1:1879359/91‑1 (MQ=255) atatGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCt < 1:1804752/91‑1 (MQ=255) tatGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCta > 2:3081329/1‑91 (MQ=255) gCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCtatta < 1:1296733/91‑1 (MQ=255) tAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTattatt < 2:1377033/91‑1 (MQ=255) gcgaatgctaatttatcatcattgatgtcgaaggcaacaatGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTaa > 1:2840279‑M2/42‑91 (MQ=255) aaaaCGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTaa > 2:475113/1‑91 (MQ=255) aaaCGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAAt < 2:3637792/91‑1 (MQ=255) aCGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTattatt > 1:3152174/1‑86 (MQ=255) aCGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTattatt < 2:3152174/86‑1 (MQ=255) cGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCt > 1:3102312/1‑91 (MQ=255) cGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCt > 2:1652494/1‑91 (MQ=255) ttATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTaa > 1:961519/1‑91 (MQ=255) tATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTaaa > 2:508592/1‑91 (MQ=255) aTGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAg > 2:1479235/1‑91 (MQ=255) aTGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAg < 1:3081329/91‑1 (MQ=255) ggggCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATg > 1:2205413/1‑91 (MQ=255) ggggCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATg < 1:2471139/91‑1 (MQ=255) gCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTg < 1:2178411/91‑1 (MQ=255) atcatcattgatgtcgaaggcaacaatGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTg > 1:3217981‑M2/28‑91 (MQ=255) cTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGa > 1:1140133/1‑91 (MQ=255) tAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGAt < 2:3642035/91‑1 (MQ=255) tAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGAt > 1:3248378/1‑91 (MQ=255) catcattgatgtcgaaggcaacaatGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGAt > 2:265285‑M2/26‑91 (MQ=255) atcattgatgtcgaaggcaacaatGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATc > 1:885267‑M2/25‑91 (MQ=255) aaaaTTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATc > 1:2299608/1‑91 (MQ=255) aaaaTTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATc < 2:1962814/91‑1 (MQ=255) aaaaTTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATc < 1:2145644/91‑1 (MQ=255) attgatgtcgaaggcaacaatGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAg > 1:3031147‑M2/22‑91 (MQ=255) ATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAg > 1:1258517‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAg < 1:3218733‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAg < 2:2023434‑M1/91‑1 (MQ=255) ATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATCATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAg < 1:2303801‑M1/91‑1 (MQ=255) GTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTg > 2:1918449‑M1/1‑91 (MQ=255) GTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTg > 1:3803530‑M1/1‑91 (MQ=255) GTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTg < 2:2252538‑M1/91‑1 (MQ=255) GTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTg > 1:3802357‑M1/1‑91 (MQ=255) ttgCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGc < 2:600082/91‑1 (MQ=255) ttgCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGc < 2:2495203/91‑1 (MQ=255) tgCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCa > 1:2835212/1‑91 (MQ=255) gCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTGGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAg < 1:3080052/91‑1 (MQ=255) gCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAg > 2:1000553/1‑91 (MQ=255) gCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAg > 2:1336387/1‑91 (MQ=255) gACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGCATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTa > 2:3751056/1‑91 (MQ=255) gACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTa < 1:370558/91‑1 (MQ=255) aCATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTAt > 2:3872155/1‑91 (MQ=255) aCATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTAt < 1:2540681/91‑1 (MQ=255) aCATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTAt < 2:3495281/91‑1 (MQ=255) cATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTATg < 1:3433016/91‑1 (MQ=255) aTCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTATGa < 2:2441955/91‑1 (MQ=255) caatGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTATGaaa < 2:1221069‑M2/87‑1 (MQ=255) caatGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTATGaaa > 1:2085806‑M2/5‑91 (MQ=255) atGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTATGAAAtt < 2:3470963‑M2/89‑1 (MQ=255) atGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTATGAAAtt < 2:2551366‑M2/89‑1 (MQ=255) atGATGATAAAGTAGCATGCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTATGAAAtt < 1:1192371‑M2/89‑1 (MQ=255) tGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCGGAAGTTATGAAATTa < 2:212567‑M2/90‑1 (MQ=255) | GGTGTTTTTGGTATAGGTGGTTTAGGTAACCTAGCTTTACAATATGCTAAAAACGTTATGGGGGCTAAAATTGTTGCCTTCGACATCAATGATGATAAATTAGCATTCGCGAAAGAATTAGGTGCTGATGCTATTATTAATTCTAAAGATGTTGATCCAGTTGCAGAAGTTATGAAATTA > USA300TCH1516_ALE/668511‑668690 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |