New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 811545 = | 153 (0.800) | 11 (0.060) +CAT |
9/154 | NT | 7.4% | intergenic (+387/‑279) | nrdF/fecD_1 | Ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta/Fe(3+) dicitrate transport system permease protein FecD |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2665005 | 134 (0.700) | intergenic (+240/+198) | pitA_2/USA300TCH1516_02535 | L‑methionine sulfoximine/L‑methionine sulfone acetyltransferase/hypothetical protein |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
AGGCGGAAAGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATTAGTAGTTTT > USA300TCH1516_ALE/811456‑811635 | aGGCGGAAAGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCcaca < 1:1174873/91‑1 (MQ=255) ggCGGAAAGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACAt < 2:909238/91‑1 (MQ=255) ggCGGAAAGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACAt < 1:662446/91‑1 (MQ=255) gCGGAAAGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATg < 2:323943/91‑1 (MQ=255) gCGGAAAGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATg < 2:323767/91‑1 (MQ=255) cGGAAAGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGa < 1:495492/91‑1 (MQ=255) cGGAAAGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGa < 1:3754965/91‑1 (MQ=255) gAAAGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGTCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGt > 1:255728/1‑91 (MQ=255) aaaGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGtt < 2:1428537/91‑1 (MQ=255) aaGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGttt > 2:2060544/1‑91 (MQ=255) aaGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGtaa < 1:1123380/91‑3 (MQ=255) aGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTGCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGtaaa < 1:3782068/91‑4 (MQ=255) tgtgtacttaaaaatatgaatacatgagtaaaactcatgcataagaaatactttttctatagaaattagtatttcttatgCATGAGTTTTa > 1:1271228‑M1/81‑91 (MQ=255) cAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACt < 2:697736/91‑1 (MQ=255) cAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACt < 2:1498964/91‑1 (MQ=255) cAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACt < 2:2563275/91‑1 (MQ=255) aaTATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTAtt < 1:3038736/91‑1 (MQ=255) tatTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTcc < 2:3042172/91‑1 (MQ=255) tatTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTcc > 1:408948/1‑91 (MQ=255) tatTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTcc < 1:1008904/91‑1 (MQ=255) tatTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTcc < 1:2272269/91‑1 (MQ=255) tatTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTcc < 2:3775258/91‑1 (MQ=255) atTGTGCAAGTTCGGGCTGGGCCCCAACAGAAAGAAAGACTTTTTCCTTTAGAAATTATCGCTTCCGCATGAGTTTTACTCATGTATTCCt < 2:487340/91‑1 (MQ=25) atTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCt > 2:2893307/1‑91 (MQ=255) atTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCt < 1:3301404/91‑1 (MQ=255) atTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCt < 2:3849308/91‑1 (MQ=255) atTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCt > 2:1238836/1‑91 (MQ=255) atTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCt > 2:1137612/1‑91 (MQ=255) gtgCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTAtt > 2:3432636/1‑91 (MQ=255) gtgCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTAtt > 2:3681510/1‑91 (MQ=255) gtgCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTAtt > 2:3432148/1‑91 (MQ=255) gCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTAtttt < 1:3440729/91‑1 (MQ=255) cAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTAttttt < 1:1786156/91‑1 (MQ=255) aGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTaa > 1:352977/1‑91 (MQ=255) aGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTaa < 2:691002/91‑1 (MQ=255) aGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTaa > 2:782465/1‑91 (MQ=255) gTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAg < 2:1306520/91‑1 (MQ=255) tCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTa < 1:3718267/91‑1 (MQ=255) cgggcgggGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTac > 1:3504108/1‑91 (MQ=255) gcgggGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTAcaca > 1:106393/1‑91 (MQ=255) gcgggGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTAcaca > 1:3834520/1‑91 (MQ=255) ggggCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACAtt < 1:840953/91‑1 (MQ=255) ggggCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACAtt < 1:3218822/91‑1 (MQ=255) ggggCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACAtt < 2:652319/91‑1 (MQ=255) gggCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTa < 2:2810536/91‑1 (MQ=255) gggCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTCCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATAAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTa > 2:2212036/1‑91 (MQ=255) ggCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAg < 1:62548/91‑1 (MQ=255) ggCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAg > 2:2003205/1‑91 (MQ=255) ctcatgtataagaaatactaatttctaaagaaaaagtatttcttataCATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTCTTAAGTGCACATTAGc < 1:2011164‑M1/44‑1 (MQ=255) cccAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGcct < 2:1008642/91‑3 (MQ=255) ccAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGcctc < 1:1284679/91‑4 (MQ=255) ccAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGa > 2:571170/1‑91 (MQ=255) atgtataagaaatactaatttctaaagaaaaagtatttcttataCATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAATACACATTAGCtgt < 1:253972‑M1/47‑2 (MQ=255) atgtataagaaatactaatttctaaagaaaaagtatttcttataCATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTCTTAAGTGCACATtagcagc < 2:3084559‑M1/47‑4 (MQ=255) tgtataagaaatactaatttctaaagaaacagtatttcttataCATGAGTTTTACTAATGTATTACTATTCTTAAGTGCACATTAGCagag < 1:3501390‑M1/48‑1 (MQ=255) cAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGcctca > 1:2237747/1‑87 (MQ=255) aaCATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAgg > 2:3063708/1‑91 (MQ=255) tataagaaatactaatttctaaagaaaaagtatttcttataCATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAATACACATTagctgtgtt < 2:2362339‑M1/50‑5 (MQ=255) aCATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACCCATTAGCTGAGGc > 2:3804147/1‑91 (MQ=255) tAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTaa > 1:3139931/1‑91 (MQ=255) agacatactaatttctatagaaaaagtatttcttatgCATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGCGGCTAAt < 2:3439228‑M1/54‑1 (MQ=255) gaaatactaatttctatagaaaaagtatttcttatgCATGAGTTTTACTCATGTATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGGCTAATg < 1:1464682‑M1/55‑1 (MQ=255) aaatactaatttctaaagaaaaagtatttcttatgCATGAGTTGCACTCATGCATTCCTATTTTTAAGTACACAATAGCTGTGGCTAAtga < 2:1013956‑M1/56‑2 (MQ=255) aGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGt < 2:966635/91‑1 (MQ=255) atactaatttctatagaaaaagtatttcttatgCATGAGTTTTACTCATGTATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGGCTAAtgtat < 1:285522‑M1/58‑3 (MQ=255) aaCTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGa < 2:1098976/91‑1 (MQ=255) tttttCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAAcc > 1:1191298/1‑91 (MQ=255) tttttCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAAcc > 2:2788412/1‑91 (MQ=255) tttttCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAAcc < 1:1926947/91‑1 (MQ=255) ttttCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCa < 2:2108146/91‑1 (MQ=255) ttttCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCa < 1:3432390/91‑1 (MQ=255) ttttCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCa < 2:3644794/91‑1 (MQ=255) ttttCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCa > 2:1675293/1‑91 (MQ=255) ttttCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCa < 2:1481619/91‑1 (MQ=255) tttCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCac < 1:1218778/91‑1 (MQ=255) ttCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCact > 2:2703365/1‑91 (MQ=255) tCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCacta < 2:3013669/91‑1 (MQ=255) tCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCacta < 1:2961249/91‑1 (MQ=255) ccTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCactac < 1:3251979/91‑1 (MQ=255) cTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCactact < 2:3565590/91‑1 (MQ=255) tttAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACtt > 1:3671372/1‑91 (MQ=255) ttAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTa < 1:3030229/91‑1 (MQ=255) gAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTaatc < 1:1965906/91‑1 (MQ=255) aaTTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTaatcaa > 2:3756869/1‑91 (MQ=255) tATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAatcaatca > 2:3170514/1‑91 (MQ=255) tATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAatcaatca > 1:3589468/1‑91 (MQ=255) tCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCAtt < 2:1835511/91‑1 (MQ=255) cACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATta > 2:160768/1‑91 (MQ=255) cACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATta > 1:169884/1‑91 (MQ=255) cACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATta > 2:2629254/1‑91 (MQ=255) aCTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATtag < 2:2440926/91‑1 (MQ=255) aCTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATtag < 1:2793458/91‑1 (MQ=255) aCTTCCACATGAGTTTCACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATtag < 2:3704378/91‑1 (MQ=255) cTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATtagt < 2:3410283/91‑1 (MQ=255) ttCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATtagta > 2:2257067/1‑91 (MQ=255) ttCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATtagta > 2:2573724/1‑91 (MQ=255) cacaTGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATTAGTAGtt < 2:1652208/91‑1 (MQ=255) cacaTGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATTAGTAGtt > 1:36680/1‑91 (MQ=255) caTGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATTAGTAGtttt < 1:3360209/91‑1 (MQ=255) caTGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATTAGTAGtttt > 2:3588578/1‑91 (MQ=255) | AGGCGGAAAGTCAGCTAACAATATTGTGCAAGTTCGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAAAACTTTTTCCTTTAGAAATTATCACTTCCACATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGAGGCTAATGTTAAGAACCACTACTTAATCAATCATTAGTAGTTTT > USA300TCH1516_ALE/811456‑811635 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |