| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1182136 = | 210 (1.100) | 12 (0.070) | 8/140 | NT | 6.6% | intergenic (‑154/‑209) | USA300TCH1516_01103/USA300HOU_RS05895 | tRNA‑Arg/Antibacterial protein 3 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1182166 = | 156 (0.940) | intergenic (‑184/‑179) | USA300TCH1516_01103/USA300HOU_RS05895 | tRNA‑Arg/Antibacterial protein 3 | |||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
AAAATGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAT > USA300TCH1516_ALE/1182046‑1182226 | aaaaTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTa < 1:1965156/91‑1 (MQ=255) gttgttattttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagaa < 1:2328209‑M1/2‑1 (MQ=255) aaaTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTaa < 1:1145283/91‑1 (MQ=255) aaaTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTaa < 2:2930838/91‑1 (MQ=255) ttgttattttaaaataaatttgatagaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagaaa > 1:3602697‑M1/89‑91 (MQ=255) aaTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCACTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTaaa < 2:2949584/91‑1 (MQ=255) aaTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTaaa < 2:826865/91‑1 (MQ=255) aaTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTaaa < 2:2599350/91‑1 (MQ=255) aaTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTaaa > 1:459778/1‑91 (MQ=255) tgttattttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAAt < 1:120137‑M1/4‑1 (MQ=255) tgttattttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAAt < 2:2416864‑M1/4‑1 (MQ=255) aTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAAt < 2:2767426/91‑1 (MQ=255) aTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGCGTTAAAt > 1:1942367/1‑91 (MQ=255) ttattttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATAc > 1:905286‑M1/86‑91 (MQ=255) gTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATAc < 1:2531002/91‑1 (MQ=255) tttATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACa < 2:1541029/91‑1 (MQ=255) tttATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACa > 2:19990/1‑91 (MQ=255) tttATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACa < 1:2267662/91‑1 (MQ=255) tattttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACa > 2:2133424‑M1/85‑91 (MQ=255) ttATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAg > 1:824457/1‑91 (MQ=255) tataTTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGt < 1:3469465/91‑1 (MQ=255) tttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGtt > 1:1112758‑M1/82‑91 (MQ=255) atatTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGtt > 2:2330341/1‑91 (MQ=255) tttttCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTg > 2:2324417/1‑91 (MQ=255) tttCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCGATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGaa < 2:3833671/91‑1 (MQ=255) ttCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAAt < 1:3663474/91‑1 (MQ=255) tCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATg < 2:3674905/91‑1 (MQ=255) tCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATg < 2:3732627/91‑1 (MQ=255) aCTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGcc < 2:451944/91‑1 (MQ=255) tattatAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACCAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTa > 1:3079830/1‑91 (MQ=255) attatAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTaa > 1:3527232/1‑91 (MQ=255) tataGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACt < 2:3796296/91‑1 (MQ=255) tataGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACt < 2:1558103/91‑1 (MQ=255) ataGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTg > 1:742979/1‑91 (MQ=255) taGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGt < 2:672596/91‑1 (MQ=255) gagCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAt < 2:1490820/91‑1 (MQ=255) caattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAt > 2:2300499‑M1/64‑91 (MQ=255) caattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAt > 1:449219‑M1/64‑91 (MQ=255) agCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtt > 1:2082882/1‑91 (MQ=255) aattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtt > 2:588987‑M1/63‑91 (MQ=255) attagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAttt > 2:3178792‑M1/62‑91 (MQ=255) cTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttc < 1:1896228/91‑1 (MQ=255) tATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttct > 2:1253285/1‑91 (MQ=255) tATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttct < 2:122222/91‑1 (MQ=255) tATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttttc < 2:546565/91‑1 (MQ=255) tATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttttc < 1:2348355/91‑1 (MQ=255) tCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTtctc > 2:2466914/1‑91 (MQ=255) tCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATATCTTTtctc > 1:3711846/1‑91 (MQ=255) aaaaaGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCttt < 1:1376726/91‑1 (MQ=255) aaaGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTaa > 1:1808500/1‑91 (MQ=255) aGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTaaaa < 2:1769248/91‑1 (MQ=255) ggTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAAt > 1:2297752/1‑91 (MQ=255) ggTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAAt > 1:1277489/1‑91 (MQ=255) gTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATa < 2:3094619/91‑1 (MQ=255) tCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACa > 1:1848472/1‑91 (MQ=255) tCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACa > 1:3244037/1‑91 (MQ=255) cAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAg < 1:3547609/91‑1 (MQ=255) aaTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGt > 1:1013654/1‑91 (MQ=255) aaTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGt < 2:1722367/91‑1 (MQ=255) aTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGtt < 2:2474230/91‑1 (MQ=255) tAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTa > 1:2873365/1‑91 (MQ=255) gACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGt > 2:3437964/1‑91 (MQ=255) gACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGt < 1:65538/91‑1 (MQ=255) gACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGt < 2:1897101/91‑1 (MQ=255) gACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGt < 1:367435/91‑1 (MQ=255) aaTACGAATTCAGGCTACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTACTTTTCTCTTTAAAGTACAGTTAAGTACATta > 1:3316878/1‑91 (MQ=255) aaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATta < 2:3593036/91‑1 (MQ=255) aaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATta > 2:3295250/1‑91 (MQ=255) aTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATtat > 2:2361563/1‑91 (MQ=255) tACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATtata > 1:382397/1‑91 (MQ=255) tACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATtata > 2:2166818/1‑91 (MQ=255) cGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAg > 2:1874588/1‑91 (MQ=255) cGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAg < 1:992945/91‑1 (MQ=255) cGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACACTTAAGTACATTATAAg > 2:2981235/1‑91 (MQ=255) gAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGa > 2:1796644/1‑91 (MQ=255) gAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGa < 2:2651547/91‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGa < 2:2691338/91‑1 (MQ=255) aaTTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAt < 1:2811800/91‑1 (MQ=255) aTTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATta < 1:676275/84‑1 (MQ=255) ttCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAtgt > 1:3793608/1‑91 (MQ=255) ttCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAtgt > 2:148837/1‑91 (MQ=255) tgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACAGTATAAGAtgttg > 1:2990385‑M1/20‑91 (MQ=255) cAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAtgttg > 2:2275775/1‑91 (MQ=255) aGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAtgttgt > 2:777863/1‑91 (MQ=255) ggCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTtgtg > 2:935630/1‑91 (MQ=255) ggCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTtgtg < 1:3687799/91‑1 (MQ=255) ggCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTtgtg < 1:116397/91‑1 (MQ=255) tAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaa < 2:1601664/91‑1 (MQ=255) aaTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaa > 1:2671460/1‑91 (MQ=255) aaTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaa > 1:1426787/1‑91 (MQ=255) aaTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaa > 1:1045245/1‑91 (MQ=255) aTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaac < 2:1406128/91‑1 (MQ=255) aTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaac < 2:902063/91‑1 (MQ=255) ttGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaaca > 2:1615422/1‑91 (MQ=255) ttGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaaca > 1:1976173/1‑91 (MQ=255) tgtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaacaaac < 1:3150903/91‑1 (MQ=255) gtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACTGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACt > 2:114295/1‑91 (MQ=255) ttAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTa > 1:48277/1‑91 (MQ=255) ttAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTa > 1:1696303/1‑91 (MQ=255) AAATACAGTTTTGAATGCCTGACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAt < 2:1680568‑M1/91‑1 (MQ=255) | AAAATGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAT > USA300TCH1516_ALE/1182046‑1182226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |