New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1182136 = | 210 (1.100) | 12 (0.070) | 8/140 | NT | 6.6% | intergenic (‑154/‑209) | USA300TCH1516_01103/USA300HOU_RS05895 | tRNA‑Arg/Antibacterial protein 3 |
? | USA300TCH1516_ALE | 1182166 = | 156 (0.940) | intergenic (‑184/‑179) | USA300TCH1516_01103/USA300HOU_RS05895 | tRNA‑Arg/Antibacterial protein 3 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAA > USA300TCH1516_ALE/1182076‑1182256 | cTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttc < 1:1896228/91‑1 (MQ=255) cTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttc < 2:163432/91‑1 (MQ=255) tagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttct > 1:2960744‑M1/60‑91 (MQ=255) tATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttct < 2:2808675/91‑1 (MQ=255) tATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttct > 2:1253285/1‑91 (MQ=255) tATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttct > 1:3533109/1‑91 (MQ=255) aTTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttctt < 2:2309622/91‑1 (MQ=255) tATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttttc < 1:2348355/91‑1 (MQ=255) tATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttttc < 1:3679969/91‑1 (MQ=255) tATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttttc < 1:1601355/91‑1 (MQ=255) tCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTtctc > 2:3870929/1‑91 (MQ=255) tCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTtctc > 2:2466914/1‑91 (MQ=255) tCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATATCTTTtctc > 1:3711437/1‑91 (MQ=255) tatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagaaatacagttttgaatgcctaactgtatttCTTTTCTCttt < 2:621549‑M2/11‑1 (MQ=255) aaaaaGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCttt < 2:2855967/91‑1 (MQ=255) aaaGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTaa > 1:1808500/1‑91 (MQ=255) aGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTaaaa < 1:231918/91‑1 (MQ=255) ggTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAAt > 1:2297752/1‑91 (MQ=255) gTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATa < 2:3094619/91‑1 (MQ=255) caacatcttatactgtacttaactgtattttaaagagaaaagaaatacagttaggcattcaaaactgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACa > 1:2990385‑M2/73‑91 (MQ=255) cAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAg < 1:3547609/91‑1 (MQ=255) aaTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGt > 2:140676/1‑91 (MQ=255) aaTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGt > 2:1694136/1‑91 (MQ=255) aaTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGt < 2:1722367/91‑1 (MQ=255) aaTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGt > 1:1013654/1‑91 (MQ=255) aaTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGt > 1:1984694/1‑91 (MQ=255) aaTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGt > 2:1315678/1‑91 (MQ=255) aaTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGCTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGt > 1:699648/1‑91 (MQ=255) aTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGtt < 2:2474230/91‑1 (MQ=255) gACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGt < 2:1897684/91‑1 (MQ=255) gACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGt < 1:2925139/91‑1 (MQ=255) gACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGt > 2:3437964/1‑91 (MQ=255) cTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTAc < 2:4598/91‑1 (MQ=255) tAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACAt > 2:1193711/1‑91 (MQ=255) tAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACAt < 1:1118267/91‑1 (MQ=255) aaaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACAtt > 1:1176265/1‑91 (MQ=255) aaTACGAATTCAGGCTACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTACTTTTCTCTTTAAAGTACAGTTAAGTACATta > 1:3316878/1‑91 (MQ=255) aaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATta < 1:868023/91‑1 (MQ=255) aaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATta > 2:3295250/1‑91 (MQ=255) aaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATta > 2:2287995/1‑91 (MQ=255) aTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATtat > 2:2361563/1‑91 (MQ=255) tACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATtata > 2:2166818/1‑91 (MQ=255) aCGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATaa < 1:3349631/91‑1 (MQ=255) cGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAg < 1:1861261/91‑1 (MQ=255) cGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAg < 1:992945/91‑1 (MQ=255) cGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAg > 2:1874588/1‑91 (MQ=255) cGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACACTTAAGTACATTATAAg > 2:2981235/1‑91 (MQ=255) gAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGa < 2:2651547/91‑1 (MQ=255) aaTTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAt > 2:380910/1‑91 (MQ=255) aaTTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAt < 1:2811800/91‑1 (MQ=255) ttCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAtgt > 2:148837/1‑91 (MQ=255) ttCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAtgt > 1:3727024/1‑91 (MQ=255) ggCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTtgtg < 1:3144187/91‑1 (MQ=255) ggCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTtgtg < 1:116397/91‑1 (MQ=255) cAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCg > 1:3002048/1‑91 (MQ=255) aaCTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCgg < 1:3584744/91‑1 (MQ=255) cTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGAt > 1:3630046/1‑91 (MQ=255) aaTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaa > 1:2671460/1‑91 (MQ=255) aaTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaa > 1:1426787/1‑91 (MQ=255) aaTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaa > 1:1045245/1‑91 (MQ=255) aTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaac < 2:902063/91‑1 (MQ=255) aTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaac < 2:1543337/91‑1 (MQ=255) ttGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaaca > 2:1615333/1‑91 (MQ=255) ttGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaaca > 1:1976085/1‑91 (MQ=255) ttGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaaca > 1:329121/1‑91 (MQ=255) gaaaagAAATACAGTTAGGCATTCAAAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaacaa < 1:287066‑M1/85‑1 (MQ=255) gtgtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaacaaa > 1:1970757/1‑91 (MQ=255) gtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACTGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACt > 2:114295/1‑91 (MQ=255) ttAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTa > 1:48277/1‑91 (MQ=255) ttAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTa < 1:661570/91‑1 (MQ=255) AAATACAGTTTTGAATGCCTGACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAt < 2:1680568‑M1/91‑1 (MQ=255) AAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAt < 1:381699‑M1/91‑1 (MQ=255) AAATACAGGTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAt < 2:1755002‑M1/91‑1 (MQ=255) aatacagttaggcattcaaaactgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAtt > 2:588987‑M2/30‑91 (MQ=255) atacagttaggcattcaaaactgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTg > 1:449219‑M2/29‑91 (MQ=255) ATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTg < 1:136950‑M1/91‑1 (MQ=255) CAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTAt > 2:3737240‑M1/1‑91 (MQ=255) GTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCa > 1:2272675‑M1/1‑91 (MQ=255) GTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCa > 1:1407033‑M1/1‑91 (MQ=255) TTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCaa > 2:2873365‑M1/1‑91 (MQ=255) ttGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTTAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAat > 2:3634810/1‑91 (MQ=255) ttGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAat > 1:3883495/1‑91 (MQ=255) ttGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAat < 2:181139/91‑1 (MQ=255) ttGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTGAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAACTGAATCAAat > 2:2722399/1‑91 (MQ=255) aaTGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAattta > 1:1718145/1‑91 (MQ=255) aaTGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAattta > 1:1259461/1‑91 (MQ=255) tGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAatttatt < 1:464283/91‑1 (MQ=255) tGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAatttatt < 2:2280784/91‑1 (MQ=255) ccTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTAtttt > 1:2009619/1‑91 (MQ=255) cTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTa < 1:3798545/91‑1 (MQ=255) aactgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTaaa > 1:1112758‑M2/11‑91 (MQ=255) ctgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAAt > 2:765950‑M2/9‑91 (MQ=255) ctgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTAAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAAt < 2:824457‑M2/83‑1 (MQ=255) tgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATa > 2:2133424‑M2/8‑91 (MQ=255) atttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATaaca > 1:3238933‑M2/5‑91 (MQ=255) atttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATaaca < 2:2416864‑M2/87‑1 (MQ=255) ttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATaacaac < 1:2330341‑M2/89‑1 (MQ=255) cttttctCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTATTTGTATCAAATTTATTTTAAAATaacaacaa < 2:2960744/91‑1 (MQ=255) cttttctCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATaacaacaa > 1:2536146/1‑91 (MQ=255) cttttctCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATaacaacaa > 1:595017/1‑91 (MQ=255) | CTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAA > USA300TCH1516_ALE/1182076‑1182256 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |