New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1279936 = | 200 (1.050) | 20 (0.150) +TTTGAAAATTATACGCAATATTAAC |
9/110 | NT | 13.4% | intergenic (+29/‑233) | cdsA/USA300HOU_RS06360 | Phosphatidate cytidylyltransferase/Putative zinc metalloprotease |
? | USA300TCH1516_ALE | 1279975 = | 177 (0.930) | intergenic (+68/‑194) | cdsA/USA300HOU_RS06360 | Phosphatidate cytidylyltransferase/Putative zinc metalloprotease |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
ACCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTT > USA300TCH1516_ALE/1279846‑1280026 | aCCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAaga < 1:2442640/91‑1 (MQ=255) ccGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAagag > 1:2484846/1‑91 (MQ=255) cGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAgagg < 2:91628/91‑1 (MQ=255) aTTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATGTTATTAATACAATCTTAATGCTGAAAACAAACCAATAAACGTAAAgaggag < 2:856339/91‑1 (MQ=255) tttGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGt > 1:3773478/1‑91 (MQ=255) tttGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGt < 2:1806679/91‑1 (MQ=255) aattttcaaagttaatattgtgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGt > 1:1564299‑M1/86‑91 (MQ=255) aattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGt > 2:238319‑M1/86‑91 (MQ=255) ttGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGtt > 2:2023352/1‑91 (MQ=255) attttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGtt < 1:978625‑M1/7‑1 (MQ=255) gACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGc > 1:2853621/1‑91 (MQ=255) aCAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCt > 1:818013/1‑91 (MQ=255) aCAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCt > 1:861371/1‑91 (MQ=255) aCAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCt < 1:2122331/91‑1 (MQ=255) cAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTg > 2:1583670/1‑91 (MQ=255) aGCTTTATGTTTGTGTTACCATTCTTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTga > 1:3755578/1‑91 (MQ=255) cTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTgaga > 1:1328027/1‑91 (MQ=255) cTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTgaga > 1:1327833/1‑91 (MQ=255) ttATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATa > 1:1425778/1‑91 (MQ=255) ttATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATa > 1:2537010/1‑91 (MQ=255) aTGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAt > 2:378385/1‑91 (MQ=255) aTGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAt < 1:3528462/91‑1 (MQ=255) aTGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAt < 1:3528431/91‑1 (MQ=255) aTGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAt > 1:1094379/1‑91 (MQ=255) tGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAAtt > 2:1695663/1‑91 (MQ=255) tttGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTa > 2:330917/1‑91 (MQ=255) ttGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTaa < 1:907906/91‑1 (MQ=255) attgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttctaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTaa > 2:3417542‑M1/70‑91 (MQ=255) attgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTaa > 2:2101984‑M1/70‑91 (MQ=255) tgtgTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAAt < 1:1013645/91‑1 (MQ=255) tgtTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCTATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGa < 1:3270547/91‑1 (MQ=255) ccATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAAtctc > 2:1054177/1‑91 (MQ=255) ccATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAAtctc > 1:1088631/1‑91 (MQ=255) ccATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCCGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAAtctc > 1:2504049/1‑91 (MQ=255) aattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCa > 2:3059570‑M1/61‑91 (MQ=255) attttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAg > 2:759785‑M1/60‑91 (MQ=255) attattAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAg < 2:39356/91‑1 (MQ=255) attattAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAg < 1:1227972/91‑1 (MQ=255) attattAAATATTTTATTAATACAATCTTAACGCTGAGAACAAAGCAATAAACGTAAGGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAg < 1:3092759/91‑1 (MQ=255) ttttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataattttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGa > 1:2698517‑M1/59‑91 (MQ=255) ttttcaaagttaatattgcgtataattttcaaagttaatattgcgtataagtttcaaaAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGa > 2:3189327‑M1/59‑91 (MQ=255) ttattaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGa < 1:444609/91‑1 (MQ=255) ttattaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGa > 1:2437802/1‑91 (MQ=255) tattaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGaa > 1:3850496/1‑91 (MQ=255) tattaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGaa > 1:1626345/1‑91 (MQ=255) tattaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGaa > 1:218748/1‑91 (MQ=255) attaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAAc > 1:2804574/1‑91 (MQ=255) ttaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACt > 2:2000045/1‑91 (MQ=255) ttaAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACt > 1:203362/1‑91 (MQ=255) taAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTc > 2:557734/1‑91 (MQ=255) taAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTc < 1:155248/91‑1 (MQ=255) aaaTATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTcc > 1:724418/1‑91 (MQ=255) aaaTATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTcc < 2:763167/91‑1 (MQ=255) aaTATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGCAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCt > 2:3833512/1‑91 (MQ=255) atatTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCtt > 2:1731693/1‑91 (MQ=255) tatTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCttt < 2:3018115/91‑1 (MQ=255) atTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCtttt > 2:323983/1‑91 (MQ=255) ttttATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTg < 2:3787454/91‑1 (MQ=255) tttATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGa < 2:288962/91‑1 (MQ=255) ttattaATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGaa > 1:505403/1‑91 (MQ=255) aTACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATtat > 1:2242296/1‑91 (MQ=255) aCAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATAc > 1:1189190/1‑91 (MQ=255) aaTCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGc < 1:1907696/91‑1 (MQ=255) aaTCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATAAATCTCATAACTCCTTTTGAAAATTATACGc < 2:2541229/91‑1 (MQ=255) aTCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCa > 2:348594/1‑91 (MQ=255) tCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCaa < 2:1939788/91‑1 (MQ=255) ttAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAata > 1:392380/1‑91 (MQ=255) tAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAatat < 2:159795/91‑1 (MQ=255) tAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTCGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAatat > 1:3261076/1‑91 (MQ=255) aaTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATCtt > 1:1794429/1‑91 (MQ=255) aaTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATAtt < 2:2078193/91‑1 (MQ=255) aaTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATAtt > 2:2612284/1‑91 (MQ=255) aTGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTa > 1:1074981/1‑91 (MQ=255) gCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAACTATACGCAATATTAAc > 2:3705764/1‑91 (MQ=255) tGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACtt > 1:3366029/1‑91 (MQ=255) tGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACtt < 2:1088632/91‑1 (MQ=255) gagaACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACttt < 1:1363146/91‑1 (MQ=255) aCAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGaaa < 2:3692060/91‑1 (MQ=255) aaaTCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAAt < 2:2753551/91‑1 (MQ=255) aaaTCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAAt < 1:1880979/91‑1 (MQ=255) tCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATtat > 2:87766/1‑91 (MQ=255) tCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATtat > 2:86342/1‑91 (MQ=255) cAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATtata > 1:1688938/1‑91 (MQ=255) tAAACGTCAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGc < 2:3444000/91‑1 (MQ=255) aaaCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCtt > 2:815970/1‑50 (MQ=255) aaaCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCa > 2:1423918/1‑91 (MQ=255) aaaCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCa > 1:2431969/1‑91 (MQ=255) aaaCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCa < 1:704484/91‑1 (MQ=255) aaCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCaa < 2:2112792/91‑1 (MQ=255) aaCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCaa > 1:2356254/1‑91 (MQ=255) aCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAat < 2:1407784/91‑1 (MQ=255) aCGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAat < 2:1189190/91‑1 (MQ=255) cGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATGAACTTTGAAAATTATACGCAata < 2:2105763/91‑1 (MQ=255) gTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAatat < 2:1860482/91‑1 (MQ=255) tAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATAtt < 2:2244958/91‑1 (MQ=255) aaaGAGGAGTTGCTGCGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTa > 2:494062/1‑91 (MQ=255) aaaGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTa > 2:2639347/1‑91 (MQ=255) aaGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTaa < 2:3084075/91‑1 (MQ=255) gaggagTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACt > 2:3349776/1‑91 (MQ=255) aggagTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACtt > 1:3077011/1‑91 (MQ=255) | ACCGATTTGACAGCTTTATGTTTGTGTTACCATTATTAAATATTTTATTAATACAATCTTAATGCTGAGAACAAATCAATAAACGTAAAGAGGAGTTGCTGAGATAATTTAATGAATCTCAGAACTCCTTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTTTGAAAATTATACGCAATATTAACTT > USA300TCH1516_ALE/1279846‑1280026 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |