| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1292484 = | 124 (0.650) | 16 (0.110) | 11/128 | NT | 13.4% | intergenic (+38/‑348) | infB/rbfA | Translation initiation factor IF‑2/Ribosome‑binding factor A |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1292539 = | 108 (0.710) | intergenic (+93/‑293) | infB/rbfA | Translation initiation factor IF‑2/Ribosome‑binding factor A | |||||
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
TTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATT > USA300TCH1516_ALE/1292394‑1292574 | caccacaaaattttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaat < 1:954632‑M1/2‑1 (MQ=255) caccacaaaattttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaat > 1:1569628‑M1/90‑91 (MQ=255) caccacaaaattttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaat > 1:3469933‑M1/90‑91 (MQ=255) accacaaaattttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaata > 1:2357437‑M1/89‑91 (MQ=255) aaaGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATA > 2:849265‑M1/1‑91 (MQ=255) agaagGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATG > 1:2438375‑M1/1‑91 (MQ=255) agaagGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATG > 2:1165836‑M1/1‑91 (MQ=255) acaaaattttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGc < 2:352811‑M1/6‑1 (MQ=255) acaaaattttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGc > 1:1961502‑M1/86‑91 (MQ=255) caaaattttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCt < 2:3054872‑M1/7‑1 (MQ=255) caaaattttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCt < 1:210767‑M1/7‑1 (MQ=255) aagGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCT < 1:1729201‑M1/91‑1 (MQ=255) aagGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTGAAGATTGATATGCg < 2:422974‑M1/91‑2 (MQ=255) aaaattttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTc < 1:2909322‑M1/8‑1 (MQ=255) ggCGATGTTATTGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC > 2:18862‑M1/1‑91 (MQ=255) ggCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC > 1:579561‑M1/1‑91 (MQ=255) ggCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC > 1:2804237‑M1/1‑91 (MQ=255) ggCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC < 2:1981716‑M1/91‑1 (MQ=255) ggCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC > 1:1346187‑M1/1‑91 (MQ=255) ggCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCC < 1:1313070‑M1/91‑1 (MQ=255) gCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCC > 2:2004620‑M1/1‑91 (MQ=255) cGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCT < 1:165251‑M1/91‑1 (MQ=255) attttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCt < 1:1891996‑M1/11‑1 (MQ=255) ttttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCta > 2:2225281‑M1/80‑91 (MQ=255) gATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATGAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTA < 1:3875132‑M1/91‑1 (MQ=255) tttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCtat < 2:187173‑M1/13‑1 (MQ=255) tttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCtat > 1:993053‑M1/79‑91 (MQ=255) tttatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCtat < 1:931665‑M1/13‑1 (MQ=255) aTGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTAT > 1:187173‑M1/1‑91 (MQ=255) tGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATA > 1:3399396‑M1/1‑91 (MQ=255) tatacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCTATaa > 2:3262179‑M1/77‑91 (MQ=255) gTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAA > 2:2735656‑M1/1‑91 (MQ=255) gTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAA > 2:2805300‑M1/1‑91 (MQ=255) ttATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAA > 2:3865109‑M1/1‑91 (MQ=255) atacaaaatcatgtccatataacgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCTATaaa < 1:880539‑M1/16‑1 (MQ=255) tATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAat > 2:2640490/1‑91 (MQ=255) cGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATAtt < 1:3735078/91‑1 (MQ=255) cGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATAtt < 2:63009/91‑1 (MQ=255) gAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTg < 2:3645741/91‑1 (MQ=255) aGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCa > 2:2564504/1‑91 (MQ=255) gCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCAc > 2:1105190/1‑91 (MQ=255) gCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCAc < 2:2289068/91‑1 (MQ=255) gCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCAc < 1:1704819/91‑1 (MQ=255) gCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCAc < 1:1274060/91‑1 (MQ=255) aTTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACtt > 1:253075/1‑91 (MQ=255) tttGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACttt > 1:842022/1‑91 (MQ=255) tttGAAATGGTTGAAATTAAGCATTAATAAAATAAATTCCATGCTAAATGTATAGTAAAGATTGATATGCTCACATTATATTTTGCACttt < 2:3639152/91‑1 (MQ=255) ttGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACtttt > 2:2111932/1‑91 (MQ=255) tGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACttttt > 2:1783796/1‑91 (MQ=255) aaaTGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAgtagacacttaaaaa < 2:720975‑M1/91‑16 (MQ=255) aaaTGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTaa < 2:1399939/91‑1 (MQ=255) ggTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAgtgt < 2:2180054/91‑1 (MQ=255) ggTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAgtgt < 2:2433885/91‑1 (MQ=255) ttGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCt > 1:1028691/1‑91 (MQ=255) cgtaacttttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTa > 1:2625141‑M1/54‑91 (MQ=255) gAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTAc > 1:483655/1‑91 (MQ=255) gAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTAAAGTGTCTAc > 1:775299/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACt < 2:2397569‑M2/91‑2 (MQ=255) aaaTTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACt < 1:352811‑M2/91‑2 (MQ=255) aaaTTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACt > 1:2636270‑M2/1‑90 (MQ=255) aaTTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAgtagacacttaaaaagtgcaatatt < 2:112590‑M1/91‑26 (MQ=255) aaTTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACtt > 1:444891‑M2/1‑89 (MQ=255) aTTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACttt > 1:664168‑M2/1‑88 (MQ=255) tttaataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTtata > 1:3040406‑M1/47‑91 (MQ=255) aGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACtttatag > 1:3828417‑M2/1‑84 (MQ=255) cGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACtttataggg > 2:3240627‑M2/1‑82 (MQ=255) aataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAggg > 1:3287935‑M1/44‑91 (MQ=255) aataggtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAggg > 1:2162166‑M1/44‑91 (MQ=255) gTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACtttataggga < 2:1309943‑M2/91‑11 (MQ=255) ttaattaaATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAAgtagacacttaaaaagtgcaatatttatagggag < 1:3252719‑M1/91‑35 (MQ=255) taattaaATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACtttatagggagc < 2:179888‑M2/91‑13 (MQ=255) gtaatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCat > 2:2314937‑M1/39‑91 (MQ=255) ttaaATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACtttatagggagcata > 1:2857093‑M2/1‑76 (MQ=255) taatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCata > 2:493920‑M1/38‑91 (MQ=255) taatctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCata > 1:2315170‑M1/38‑91 (MQ=255) aaataaatTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTACGTGTCTACTTTATAGGGAGCATAtt > 1:3623006/1‑91 (MQ=255) ctattctaataaaaaaccaaaagctagtatcaaATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTT‑ATAGGGAGCATATTTGa > 2:1652863‑M1/34‑91 (MQ=255) aatTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATa > 1:1083270/1‑91 (MQ=255) atTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATAc < 1:193500/91‑1 (MQ=255) atTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATAc > 1:1232047/1‑91 (MQ=255) cAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGc > 2:3682914/1‑91 (MQ=255) aaGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCt > 2:3722181/1‑91 (MQ=255) aaGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCt > 2:3796964/1‑91 (MQ=255) aGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCtt < 2:205377/91‑1 (MQ=255) aGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCtt > 1:665214/1‑91 (MQ=255) gCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCttt < 1:2255305/91‑1 (MQ=255) gTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGtttt > 1:3420297/1‑91 (MQ=255) gTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGtttt > 2:1577005/1‑91 (MQ=255) tataGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGttttt > 2:1609845/1‑91 (MQ=255) ataGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGtttttt < 1:2038101/91‑1 (MQ=255) taGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTtta > 1:1386821/1‑91 (MQ=255) gTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGt < 2:2357656/83‑1 (MQ=255) gTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTttatt > 1:1493017/1‑91 (MQ=255) aaGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGa < 1:3361903/91‑1 (MQ=255) aGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGaa < 2:807156/91‑1 (MQ=255) gATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAAt > 1:1761094/1‑91 (MQ=255) gATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGAt > 2:581430/1‑91 (MQ=255) gATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGAt > 2:2834768/1‑91 (MQ=255) ATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGAtt < 2:1210883‑M1/91‑1 (MQ=255) ATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGAtt < 2:2912923‑M1/91‑1 (MQ=255) | TTAAAGAAGGCGATGTTATCGAAGCATTTGAAATGGTTGAAATTAAGCGTTAATTAAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATT > USA300TCH1516_ALE/1292394‑1292574 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |