| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1292484 = | 124 (0.650) | 16 (0.110) | 11/128 | NT | 13.4% | intergenic (+38/‑348) | infB/rbfA | Translation initiation factor IF‑2/Ribosome‑binding factor A |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1292539 = | 108 (0.710) | intergenic (+93/‑293) | infB/rbfA | Translation initiation factor IF‑2/Ribosome‑binding factor A | |||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
AAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAATTTTGTGGTGGC > USA300TCH1516_ALE/1292449‑1292629 | aaataaatTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTACGTGTCTACTTTATAGGGAGCATAtt > 1:3623232/1‑91 (MQ=255) aataaatTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATAttt < 1:2863019/91‑1 (MQ=255) ataaatTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTg > 2:46994/1‑91 (MQ=255) aatTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATa > 2:22147/1‑91 (MQ=255) atTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATAc > 1:1232288/1‑91 (MQ=255) atTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATAc < 1:193500/91‑1 (MQ=255) ttACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACt > 1:2356048/1‑91 (MQ=255) aCAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGTTATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAg > 2:3216681/1‑91 (MQ=255) cAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGc < 2:2373274/91‑1 (MQ=255) aaGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCt < 2:1838793/91‑1 (MQ=255) aaGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCt > 2:3722181/1‑91 (MQ=255) aaGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCt > 2:3796964/1‑91 (MQ=255) aaGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCt > 2:521930/1‑91 (MQ=255) aaGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCt < 1:133214/91‑1 (MQ=255) aaGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCt > 2:784900/1‑91 (MQ=255) aGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGGGCATATTTGATACTAGCtt < 1:751205/91‑1 (MQ=255) aGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCtt > 1:665214/1‑91 (MQ=255) gCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCttt < 1:2255305/91‑1 (MQ=255) cTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCtttt < 1:108194/91‑1 (MQ=255) aaaGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGt < 1:2004620/91‑1 (MQ=255) aGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGttt > 2:325327/1‑91 (MQ=255) gTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGtttt > 1:3827491/1‑91 (MQ=255) gTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGtttt > 2:2777753/1‑91 (MQ=255) ataGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGtttttt < 1:3271272/91‑1 (MQ=255) aGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTttat > 1:924212/1‑91 (MQ=255) gTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGt > 1:2357656/1‑83 (MQ=255) gTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTttatt > 1:1493017/1‑91 (MQ=255) ttAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTttatta < 1:3308978/91‑1 (MQ=255) tatcaaatatgctccctataaagtagacacttaaaaagtgcaatatttatagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGaa > 1:2136026‑M2/62‑91 (MQ=255) gATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAAt > 1:1761094/1‑91 (MQ=255) tcaaatatgctccctataagtagacacttaaaaagtgcaatatttatagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAg > 2:1652863‑M2/59‑91 (MQ=255) gATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGAt > 1:839973/1‑91 (MQ=255) gATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGAt > 1:419288/1‑91 (MQ=255) gATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGAt > 2:581430/1‑91 (MQ=255) ATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGtttttt > 2:1502100‑M1/1‑78 (MQ=255) ATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGAtt < 1:3464046‑M1/91‑1 (MQ=255) ATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGAtt < 1:1402169‑M1/91‑1 (MQ=255) ATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTCATTAGAATAGAtt < 1:3402255‑M1/91‑1 (MQ=255) tatgctccctataaagtagacacttaaaaagtgcaatatttatagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTa > 1:2315170‑M2/55‑91 (MQ=255) ATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTAc < 2:1147325‑M1/91‑1 (MQ=255) TGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAg > 1:950250‑M1/1‑80 (MQ=255) GCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCt > 1:2295649‑M1/1‑91 (MQ=255) CTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGGGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTa > 2:1152585‑M1/1‑91 (MQ=255) ccctataaagtagacacttaaaaagtgcaatatttatagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTAtt > 1:2162822‑M2/49‑91 (MQ=255) ccctataaagtagacacttaaaaagtgcaatatttatagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTAtt > 1:539447‑M2/49‑91 (MQ=255) CCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTAtt > 1:3865109‑M1/1‑91 (MQ=255) CCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTAtt > 2:3402581‑M1/1‑91 (MQ=255) CCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTAtt > 2:2139700‑M1/1‑91 (MQ=255) CCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTAtt > 2:3695249‑M1/1‑91 (MQ=255) CCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTa > 2:2037184‑M1/1‑91 (MQ=255) CTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTaa < 1:1294390‑M1/91‑1 (MQ=255) CTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTaa > 2:253392‑M1/1‑91 (MQ=255) CTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTaa > 2:2829419‑M1/1‑91 (MQ=255) tataaagtagacacttaaaaagtgcaatatttatagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTaaa > 1:3040406‑M2/46‑91 (MQ=255) ATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTaaaa < 2:2236282‑M1/91‑1 (MQ=255) ATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTaaaa < 2:302781‑M1/91‑1 (MQ=255) ATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTaaaa < 2:1319708‑M1/91‑1 (MQ=255) aaagtagacacttaaaaagtgcaatatttatagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAACAGt > 1:1110356‑M2/43‑91 (MQ=255) AATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGtt < 2:860087‑M1/91‑1 (MQ=255) AATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGtt < 1:1084347‑M1/91‑1 (MQ=255) agtagacacttaaaaagtgcaatatttatagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTa > 1:1582291‑M2/41‑91 (MQ=255) ATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTa < 2:162188‑M1/91‑1 (MQ=255) ATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTa < 1:1529096‑M1/91‑1 (MQ=255) tagacacttaaaaagtgcaatatttatagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACg > 1:2625141‑M2/39‑91 (MQ=255) atTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCt > 2:2018212/1‑50 (MQ=255) atTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCt < 1:2018212/50‑1 (MQ=255) ttGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGt < 2:3182387/91‑1 (MQ=255) gCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTta > 2:1661494/1‑91 (MQ=255) cACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTtat > 2:2391607/1‑91 (MQ=255) cTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTGATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTatat > 2:3052016/1‑91 (MQ=255) ttttAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATgg < 1:2777753/91‑1 (MQ=255) tttAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGa < 1:1384610/91‑1 (MQ=255) tttAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGa < 1:483287/91‑1 (MQ=255) ttAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGAc < 2:2292847/91‑1 (MQ=255) ttAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGAc < 1:1860434/91‑1 (MQ=255) aGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATg > 1:416442/1‑91 (MQ=255) aGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATg > 1:2502464/1‑91 (MQ=255) aGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATg > 2:814050/1‑91 (MQ=255) aGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATg < 1:1165836/91‑1 (MQ=255) gtgtCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGa > 2:2835229/1‑91 (MQ=255) cTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGAtttt > 2:3281260/1‑91 (MQ=255) aCTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGt > 1:3419629/1‑91 (MQ=255) cTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGAttttata < 1:1356847/91‑4 (MQ=255) cTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGta < 2:835498/91‑1 (MQ=255) tttatagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGtat < 1:880539‑M2/75‑1 (MQ=255) tatagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATaa > 2:214690‑M2/15‑91 (MQ=255) atagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATaaa > 2:1206749‑M2/14‑91 (MQ=255) atagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATaaa > 1:993065‑M2/14‑91 (MQ=255) atagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATaaa < 2:187173‑M2/78‑1 (MQ=255) tagggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATaaaa > 1:3526983‑M2/13‑91 (MQ=255) gggagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTGCCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAAtt < 2:1579372‑M2/81‑1 (MQ=255) gagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAAtttt > 2:2008227‑M2/9‑91 (MQ=255) gagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAAtttt > 1:980894‑M2/9‑91 (MQ=255) gagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAAtttt > 2:645633‑M2/9‑91 (MQ=255) gagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAAtttt > 2:3678144‑M2/9‑91 (MQ=255) gagcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAAtttt < 1:2909322‑M2/83‑1 (MQ=255) agcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAATTTtg < 1:210767‑M2/84‑1 (MQ=255) gcatatTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAATTTtgt < 2:1761094‑M2/85‑1 (MQ=255) tTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAATTTTGtggtgg < 2:1882587‑M2/90‑1 (MQ=255) ttGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAATTTTGTGGTGGc > 2:416731/1‑91 (MQ=255) | AAATAAATTACAAGCTAAAAGTATAGTTAAGATTGATATGCTCCCTATAAATATTGCACTTTTTAAGTGTCTACTTTATAGGGAGCATATTTGATACTAGCTTTTGGTTTTTTATTAGAATAGATTACCTATTAAAAGTTACGTTATATGGACATGATTTTGTATAAAATTTTGTGGTGGC > USA300TCH1516_ALE/1292449‑1292629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |