| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1404075 = | 167 (0.880) | 18 (0.100) | 13/148 | NT | 11.2% | intergenic (+213/‑279) | ysdC_1/trpE | Putative aminopeptidase YsdC/Anthranilate synthase component 1 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1404118 = | 132 (0.750) | intergenic (+256/‑236) | ysdC_1/trpE | Putative aminopeptidase YsdC/Anthranilate synthase component 1 | |||||
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
GGAATTAGCACGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGA > USA300TCH1516_ALE/1403985‑1404165 | atttcattaatctcggtgttagttcacatcatccactaactttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagac > 1:2797733‑M1/91‑91 (MQ=255) tttcattaatctcggtgttagttcacatcatccactaactttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagaca < 2:220136‑M1/2‑1 (MQ=255) gAATTAGCACGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCA < 2:2595403‑M1/91‑1 (MQ=255) ttcattaatctcggtgttagttcacatcatccactaactttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagacac > 1:3347131‑M1/89‑91 (MQ=255) aaTTAGCACGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCAC < 1:364795‑M1/91‑1 (MQ=255) tcattaatctcggtgttagttcacatcatccactaactttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagacatc > 1:2152319‑M1/88‑89 (MQ=255) tcattaatctcggtgttagttcacatcatccactaactttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagacacc > 1:1397287‑M1/88‑91 (MQ=255) ttAGCACGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCA < 1:3384951‑M1/91‑1 (MQ=255) ttAGCACGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCA < 2:2727001‑M1/91‑1 (MQ=255) cattaatctcggtgttagttcacatcatccactaactttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagacacca < 2:2375754‑M1/5‑1 (MQ=255) cattaatctcggtgttagttcacatcatccactaactttctcttgctacctttaattaactactacatcttgtctaaataaaaagacacca < 2:2953310‑M1/5‑1 (MQ=255) attaatctcggtgttagttcacatcatccactaactttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagacaccac < 1:2427870‑M1/6‑1 (MQ=255) aGCACGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACg < 1:1693611/91‑1 (MQ=255) cACGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGt > 1:2472582/1‑91 (MQ=255) aCGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACagta < 2:2645693‑M1/91‑5 (MQ=255) aCGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTa < 2:596427/91‑1 (MQ=255) cGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTaa > 2:449918/1‑91 (MQ=255) ccATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAAcg < 2:1055855/91‑1 (MQ=255) ccATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAAcg < 1:1308646/91‑1 (MQ=255) atatCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAAcgcg < 2:1406692/91‑1 (MQ=255) atatCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAAcgcg < 1:3535772/91‑1 (MQ=255) atatCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAAcgcg < 1:3863280/91‑1 (MQ=255) tatCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGt < 2:3425605/91‑1 (MQ=255) atCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTc < 1:527231/91‑1 (MQ=255) tCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTcc > 2:1945663/1‑91 (MQ=255) cTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCt < 1:440225/91‑1 (MQ=255) tgtgAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAGAGTGAACATGAGTTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTa < 2:2266043/91‑1 (MQ=255) tgtgAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTa < 1:2198471/91‑1 (MQ=255) tgtgAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTa < 1:2064486/91‑1 (MQ=255) gtgAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTAc < 1:1602717/91‑1 (MQ=255) tgAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACa > 2:1293859/1‑91 (MQ=255) aaTTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAgg < 2:1145866/91‑1 (MQ=255) atcatccactatctttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaagagaCACCACA‑TAACGCGTCCTTACAGGtata > 2:2969858‑M1/64‑91 (MQ=255) atcatccactaactttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagaCACCACA‑TAACGCGTCCTTACAGGtata > 1:2540023‑M1/64‑91 (MQ=255) tcatccactaactttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagaCACCACA‑TAACGCGTCCTTACAGGTatat > 2:525286‑M1/63‑91 (MQ=255) tcatccactaactttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagaCACCACA‑TAACGCGTCCTTACAGGTatat > 2:3748040‑M1/63‑91 (MQ=255) gACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTatat < 2:421323/91‑1 (MQ=255) aCTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATg < 1:626333/91‑1 (MQ=255) aCTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATg < 2:3636937/91‑1 (MQ=255) aCTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATg > 1:1117969/1‑91 (MQ=255) tttGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACataacgcatatacctgtaaggacgcgt < 1:1032847‑M1/91‑28 (MQ=255) ttGTAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATACGCGt < 1:3057281/91‑1 (MQ=255) tGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGtt < 1:93880/91‑1 (MQ=255) tGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTACATGCGtt > 1:1943116/1‑91 (MQ=255) tGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTAAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTGTATGCGtt > 2:3375444/1‑91 (MQ=255) ggAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACataacgcatatacctgtaaggacgcgttac < 1:769509‑M1/91‑31 (MQ=255) ggAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTa > 1:2727480/1‑91 (MQ=255) gAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACataacgcatatacctgtaaggacgcgttacc < 2:799244‑M1/91‑32 (MQ=255) aaaaCAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATg > 2:3255286‑M2/1‑90 (MQ=255) aaaCAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgt < 1:1191225‑M2/91‑3 (MQ=255) tttctgttgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagaCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtgg > 1:3830459‑M1/51‑91 (MQ=255) aCAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtgg < 2:2427870‑M2/91‑5 (MQ=255) aCAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtgg > 2:2265378‑M2/1‑87 (MQ=255) aCAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtgg < 2:1772539‑M2/91‑5 (MQ=255) aaTTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtggtg > 2:3697961‑M2/1‑85 (MQ=255) aTTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGACACCACataacgcatatacctgtaaggaggcgttaccgtggtgc < 1:3304603‑M1/91‑39 (MQ=255) ttGAATGAGTTTTGAAAGTGAGCATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTAt < 1:3117224/83‑1 (MQ=255) ttGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTAt > 2:3117224/1‑83 (MQ=255) ttGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTc < 1:2911337/91‑1 (MQ=255) gAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTCACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCtt > 2:3883890/1‑91 (MQ=255) tgctacctttaattaactactacattttgtctaaataaaaagaCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCttt > 2:188221‑M1/44‑91 (MQ=255) aaTGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACGGGTATATGCGTTATGTGGTGTCttt > 1:3020203/1‑91 (MQ=255) aTGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCtttt > 1:1266514/1‑91 (MQ=255) tGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCttttt < 1:284094/91‑1 (MQ=255) aGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTtttat > 2:3696073/1‑91 (MQ=255) tGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGa < 1:1265196/91‑1 (MQ=255) aaGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACaa < 2:1603905/91‑1 (MQ=255) aaGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACaa < 1:3428379/91‑1 (MQ=255) aaGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACaa < 1:45416/91‑1 (MQ=255) aaGTGAACATGAATGATGTTAACTAAGGTGGCACCACataacgcatatacctgtaaggacgcgttaccgtggtgccaccttagttaacata < 2:714406‑M1/91‑55 (MQ=255) gTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACaaaa < 1:3562558/91‑1 (MQ=255) gTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACaaaa < 1:709024/91‑1 (MQ=255) tGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAAt > 1:3403123/1‑91 (MQ=255) aaCATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATgt < 2:329380/91‑1 (MQ=255) aaCATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATgt < 1:1841495/91‑1 (MQ=255) aTTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGtt < 1:297142/91‑1 (MQ=255) tATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGttaa > 1:1963132/1‑91 (MQ=255) tATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGttaa < 2:2121794/91‑1 (MQ=255) aTGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGttaat < 1:980198/91‑1 (MQ=255) tGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGttaatt < 2:2093725/91‑1 (MQ=255) tGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGttaatt < 2:1444483/91‑1 (MQ=255) tGTTAACTAAGGTGGCACAACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACATAATGTAGTAGttgatt > 2:1120338/1‑91 (MQ=255) tAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTaaa > 1:2356913/1‑91 (MQ=255) tAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTaaa > 2:3514322/1‑91 (MQ=255) aaGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACGGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAg < 2:3020203/91‑1 (MQ=255) aGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGc > 1:2621012/1‑91 (MQ=255) ggTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCa < 1:2233639/91‑1 (MQ=255) gTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCaa < 1:368076/91‑1 (MQ=255) tGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAAc < 1:1010762/91‑1 (MQ=255) ggCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACa > 1:831398/1‑91 (MQ=255) gCACCACGGTAACGCGTCCTTACTTGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTAAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTTGCAACAg < 2:3614221/91‑1 (MQ=255) gCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATgtggtgtcaccttagttaacataattcatgttcactttcaaaactcattcaat < 2:1398595‑M2/91‑54 (MQ=255) gCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAg < 2:1789068/91‑1 (MQ=255) gCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAg < 2:516999/91‑1 (MQ=255) gCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAg < 1:507961/91‑1 (MQ=255) gCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGGAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAg > 1:3501610/1‑91 (MQ=255) caccacataacgcatatacctgtaaggacgcgttaccgtggtgccaccttagttaacataattcatgttcactttcaaaactcattcaatt > 2:2815141‑M1/1‑6 (MQ=255) caccacataacgcatatacctgtaaggacgcgttaccgtggtgccaccttagttaacataattcatgttcactttcaaaactcattcaatt > 1:189318‑M1/1‑6 (MQ=255) caccacataacgcatatacctgtaaggacgcgttaccgtggtgccaccttagttaacataattcatgttcactttcaaaactcattcaatt > 2:1830061‑M1/1‑6 (MQ=255) CACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGa > 2:1708074‑M1/1‑91 (MQ=255) | GGAATTAGCACGCCATATCTTGTGAATTGGACTTTGGAAAACAATTGAATGAGTTTTGAAAGTGAACATGAATTATGTTAACTAAGGTGGCACCACGGTAACGCGTCCTTACAGGTATATGCGTTATGTGGTGTCTTTTTATTTAGACAAAATGTAGTAGTTAATTAAAGGTAGCAACAGA > USA300TCH1516_ALE/1403985‑1404165 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |