| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1693755 = | 192 (1.010) | 12 (0.070) | 5/140 | NT | 7.0% | coding (1040/1158 nt) | hemN_1 | Oxygen‑independent coproporphyrinogen‑III oxidase‑like protein YqeR |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1693791 = | 153 (0.920) | coding (1004/1158 nt) | hemN_1 | Oxygen‑independent coproporphyrinogen‑III oxidase‑like protein YqeR | |||||
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
CCTCATTACCTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACA > USA300TCH1516_ALE/1693666‑1693845 | cTCATTACCTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGtt > 2:380562/1‑91 (MQ=255) cTCATTACCAATGACTTTCCCTCGATTTGTAAGTGCAATCGCATCGTTCTTTTCTACAATTAATTTCTCCTCTTTTAGATTATTTATTGtc > 1:662599/1‑90 (MQ=255) aaccttctttgactgagagaatggaagaagaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGtt > 2:2011935‑M1/89‑91 (MQ=255) aaccttctttgactgagagaatggaagaagaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGtt < 1:3192359‑M1/3‑1 (MQ=255) ccttctttgactgagagaatggaagaagaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTg > 1:2861157‑M1/87‑91 (MQ=255) ccttctttgactgagagaatggaagaagaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTg < 1:3831400‑M1/5‑1 (MQ=255) ccttctttgactgagagaatggaagaagaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTg > 1:79578‑M1/87‑91 (MQ=255) cATTACCTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTg > 1:235556/1‑91 (MQ=255) cttctttgactgagagaatggaagaagaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTGa > 1:3463843‑M1/86‑91 (MQ=255) aTTACCTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGa > 2:2535234/1‑91 (MQ=255) ttctttgactgagagaatggaagaagaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTGAc < 1:959047‑M1/7‑1 (MQ=255) ttctttgactgagagaatggaagaagaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTGAc < 2:1701466‑M1/7‑1 (MQ=255) ttACCTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGAc > 1:305008/1‑91 (MQ=255) ttACCTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGAc < 1:1397739/91‑1 (MQ=255) tctttgactgagagaatggaagaagaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTGAcc < 1:522471‑M1/8‑1 (MQ=255) ctttgactgagagaatggaagaagaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTGACCa < 1:1373265‑M1/9‑1 (MQ=255) ctttgactgagagaatggaagaagaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggctcaaaaagaaGTTTGACCa > 2:2842908‑M1/83‑91 (MQ=255) aCCTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCa > 2:3339165/1‑91 (MQ=255) cTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCaaa < 1:1118841/91‑1 (MQ=255) aTGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGa < 2:428103/91‑1 (MQ=255) gACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGaca > 2:1373677/1‑91 (MQ=255) gACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGaca > 2:1373265/1‑91 (MQ=255) cTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACt > 1:3401654/1‑91 (MQ=255) tttCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACtt < 2:1295307/91‑1 (MQ=255) ttCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACttt > 2:2684174/1‑91 (MQ=255) tCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTc < 2:1644479/91‑1 (MQ=255) tCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTc < 1:3725528/91‑1 (MQ=255) tCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTc < 1:2745020/91‑1 (MQ=255) tCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTc < 1:2637823/91‑1 (MQ=255) tCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCCACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTc > 1:3260060/1‑91 (MQ=255) cccTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCa > 1:301735/1‑91 (MQ=255) ccTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTAGAATTAATTCCTTCGCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACATTCaa > 1:3609882/1‑91 (MQ=255) ccTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCaa < 2:3483421/91‑1 (MQ=255) ctATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAg > 1:2099045/1‑91 (MQ=255) tGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTgg < 2:3428302/91‑1 (MQ=255) tGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTgg > 1:1732052/1‑91 (MQ=255) gTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGt > 2:3010238/1‑91 (MQ=255) gTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGATTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGt > 1:3113356/1‑91 (MQ=255) agaaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGt > 2:3470787‑M1/61‑91 (MQ=255) tAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTc < 1:3277337/91‑1 (MQ=255) tAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTc > 1:2593508/1‑91 (MQ=255) aaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCa > 2:117656‑M1/59‑91 (MQ=255) aaatgtttcttgggttgcgtttaaatgaaggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCa > 1:2912030‑M1/59‑91 (MQ=255) aaGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCa > 2:1898330/1‑91 (MQ=255) aaGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCa < 2:960699/91‑1 (MQ=255) aatgtttcttgggttgcgtttaaatgaagctgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCaa > 1:2158122‑M1/58‑91 (MQ=255) tGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAAc < 2:336755/91‑1 (MQ=255) cAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAActt > 2:2530222/1‑91 (MQ=255) aaTCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAActtc > 2:523398/1‑91 (MQ=255) aTCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTGATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAActtct > 1:3866763/1‑91 (MQ=255) tCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAActtctt > 1:1693376/1‑91 (MQ=255) cacaTCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCttt > 2:2654759/1‑91 (MQ=255) cacaTCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCttt > 2:2650635/1‑91 (MQ=255) acaTCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCtttt > 2:3831400/1‑91 (MQ=255) acaTCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCtttt < 2:136380/91‑1 (MQ=255) aTCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTg > 2:2303421/1‑91 (MQ=255) tCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGa < 2:183701/91‑1 (MQ=255) cGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGaa > 2:2574169/1‑91 (MQ=255) tCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACct < 2:3690474/91‑1 (MQ=255) cTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACcta < 2:471969/91‑1 (MQ=255) ttttCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGac < 2:3133227/53‑1 (MQ=255) ttttCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctac < 2:2428827/91‑1 (MQ=255) ttttCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTCAACctac > 1:1929863/1‑91 (MQ=255) ttCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctacta > 1:297418/1‑91 (MQ=255) tACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctactacta < 1:433329/91‑1 (MQ=255) tACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctactacta < 2:2099045/91‑1 (MQ=255) aCAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCtactactac < 1:2501180/91‑1 (MQ=255) cAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTactactact > 1:2009200/1‑91 (MQ=255) cAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTactactact < 1:821/91‑1 (MQ=255) aattaattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTc < 2:778493/91‑1 (MQ=255) attaattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTca < 2:3589613/91‑1 (MQ=255) attaattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTca > 1:2293967/1‑91 (MQ=255) attaattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTca > 2:898884/1‑91 (MQ=255) attaattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTca < 2:3589434/91‑1 (MQ=255) aggtgtgagtagtagtaggttcaaaaagaaGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTca > 1:2477907‑M1/31‑91 (MQ=255) ttagttCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTcac < 1:3133532/91‑1 (MQ=255) ttaattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTcac < 2:3083875/91‑1 (MQ=255) taattCTTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTcaca < 2:2033559/91‑1 (MQ=255) ttCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCt > 2:2508381/1‑91 (MQ=255) ccTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTc > 2:2420145/1‑91 (MQ=255) cTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCa > 1:3378961/1‑91 (MQ=255) ctctTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCAttt < 2:2305664/91‑1 (MQ=255) ctTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTaa > 1:2020813/1‑91 (MQ=255) ctTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTaa > 1:2021458/1‑91 (MQ=255) ttAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACg > 2:278955/1‑91 (MQ=255) ttAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACg > 2:17786/1‑91 (MQ=255) ttAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACg > 1:3789491/1‑91 (MQ=255) attattTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAAc < 2:652231/91‑1 (MQ=255) tatttattGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAAccc < 2:759532/91‑1 (MQ=255) atttattGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCa > 1:57967/1‑91 (MQ=255) atttattGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCa < 2:2368722/91‑1 (MQ=255) atttattGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCa < 1:3530615/91‑1 (MQ=255) tttattGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCaa > 1:1265865/1‑91 (MQ=255) tattGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGa < 1:1375026/91‑1 (MQ=255) ttGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGaaa > 1:1507141/1‑91 (MQ=255) ttGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGaaa > 1:1507464/1‑91 (MQ=255) ttGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGaaa > 1:1536169/1‑91 (MQ=255) ttGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGaaa > 1:288825/1‑91 (MQ=255) ttGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCGTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGaaa > 2:2946209/1‑91 (MQ=255) GTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACa > 1:217341‑M1/1‑91 (MQ=255) | CCTCATTACCTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACA > USA300TCH1516_ALE/1693666‑1693845 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |