New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1844653 = | 241 (1.260) | 19 (0.110) | 11/142 | NT | 8.7% | intergenic (+50/+153) | mrcA/isdH | Penicillin‑binding protein 1A/Iron‑regulated surface determinant protein H |
? | USA300TCH1516_ALE | 1844699 = | 186 (1.100) | intergenic (+96/+107) | mrcA/isdH | Penicillin‑binding protein 1A/Iron‑regulated surface determinant protein H |
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
ATGATATTAAATCACATTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAACCAATCAATAGTTT > USA300TCH1516_ALE/1844563‑1844744 | atGATATTAAATCACATTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTaaaa < 2:2791708/91‑1 (MQ=255) tgtatgattaactttgtagacaatgtgaaagcaattaatttataaactattgattggtttaatggctttcctttagagtaaataaaaagaa > 1:76026‑M1/90‑91 (MQ=255) tGATATTAAATCACATTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTaaaaa > 2:3472851/1‑91 (MQ=255) atatTAAATCACATTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAAca < 2:145947/91‑1 (MQ=255) atatTAAATCACATTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAAca > 2:2182378/1‑91 (MQ=255) tatTAAATCACATTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAAcag > 1:621490/1‑91 (MQ=255) atgattaactttgtagacaatgtgaaagcaattaatttataaactattgattggtttaatggctttcctttagagtaaataaaaagAAcag < 2:2364579‑M1/5‑1 (MQ=255) atTAAATCACATTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAAcagc > 1:3738252/1‑91 (MQ=255) aaaTCACATTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGt > 1:3138425/1‑91 (MQ=255) aaaTCACATTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGt < 1:1161215/91‑1 (MQ=255) cacaTTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATCAAAAACAGCAGTAAGa > 2:3714459/1‑91 (MQ=255) ccaTTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGat < 2:3842093/90‑1 (MQ=255) acaTTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGat < 2:1596578/91‑1 (MQ=255) caTTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGatt > 2:1225828/1‑91 (MQ=255) aTTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGatta > 1:2496287/1‑91 (MQ=255) ttGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGattatt > 1:1211203/1‑91 (MQ=255) tGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTAttt > 2:3000344/1‑91 (MQ=255) aaaTCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCaa > 2:1047913/1‑91 (MQ=255) aaaTCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCaa < 1:3568866/91‑1 (MQ=255) aaaTCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCaa < 2:3748244/91‑1 (MQ=255) aaaTCGAAAAAAGCGCTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAACTATTAAAAACAGCAGTAAGCTTATTTTCaa > 2:3868446/1‑91 (MQ=255) aTCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAAtt < 1:2058252/91‑1 (MQ=255) cGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAg < 2:2715506/91‑1 (MQ=255) cGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAAAAAAAAAAAAAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAg < 2:2418180/91‑1 (MQ=37) aaaaaaGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAATTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGAGTATTTTCAATTAGaa < 1:3308765/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGaa > 1:1306703/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGaa > 1:2747538/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGaa < 1:1725276/91‑1 (MQ=255) aaaGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAAt > 2:1309392/1‑91 (MQ=255) aGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAAttt < 2:2909129/91‑1 (MQ=255) aGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAAttt < 1:2542524/91‑1 (MQ=255) gCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTGAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTtc < 1:2205598/91‑1 (MQ=255) gCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTtc > 2:207232/1‑91 (MQ=255) gCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTtc > 1:1436992/1‑91 (MQ=255) cGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTtct > 1:1125208/1‑91 (MQ=255) gTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTCACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTtctc > 2:2218428/1‑91 (MQ=255) gTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTtctc > 1:476318/1‑91 (MQ=255) ttAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCa > 2:3011096/1‑91 (MQ=255) ttAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCa < 2:840279/91‑1 (MQ=255) atttataaactattgattggtttaatggctttcctttagagtaaataaaaagAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCAc > 2:621264‑M1/53‑91 (MQ=255) aaTTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCAct < 2:1518026/91‑1 (MQ=255) aaTTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCAct < 2:2057506/91‑1 (MQ=255) ttataaactattgattggtttaatggctttcctttagagtaaataaaaagAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCActg > 1:1007955‑M1/51‑91 (MQ=255) ttataaactattgattggtttaatggctttcctttagagtaaataaaaagAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCActg > 2:2674040‑M1/51‑91 (MQ=255) ttGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCActgc < 1:2933840/91‑1 (MQ=255) gATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCActgctg > 1:1921050/1‑91 (MQ=255) aTGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGt < 1:1554222/91‑1 (MQ=255) aTGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGt < 2:2005484/91‑1 (MQ=255) cTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCt < 1:1183016/91‑1 (MQ=255) tattgattggtttaatggctttcctttagagtaaataaaaagAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCtt > 1:125673‑M1/43‑91 (MQ=255) tattgattggtttaatggctttcctttagagtaaataaaaagAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCtt > 1:2260507‑M1/43‑91 (MQ=255) tCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCtt > 2:2551940/1‑91 (MQ=255) tCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCtt > 2:247721/1‑91 (MQ=255) cACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCttt > 1:3052612/1‑91 (MQ=255) cACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCttt > 2:450540/1‑91 (MQ=255) attgattggtttaatggctttcctttagagtaaataaaaagAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCttt > 1:2431676‑M1/42‑91 (MQ=255) attgattggtttaatggctttcctgtagagtaaataaaaagAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCttt > 2:3617724‑M1/42‑91 (MQ=255) ttgattggtttaatggctttcctttagagtaaataaaaagAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCtttt > 1:2784757‑M1/41‑91 (MQ=255) cTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGCAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCATTGCTGTTCttttt > 1:3880500/1‑91 (MQ=255) ttttAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTtttat < 1:3644644/91‑1 (MQ=255) tttAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTtttatt < 1:1595556/91‑1 (MQ=255) ttAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAACATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTtttattt > 1:3094330/1‑91 (MQ=255) tAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTtttattta > 2:3264611/1‑91 (MQ=255) aaaGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTAc > 2:507335/1‑91 (MQ=255) aGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTActc > 2:1914155/1‑91 (MQ=255) aGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTActc > 2:2599387/1‑91 (MQ=255) gTAACCACATCAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTActct < 1:3708811/91‑1 (MQ=255) tAACCACGACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTa < 2:3435259/91‑1 (MQ=255) tAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTa < 1:1633418/91‑1 (MQ=255) aaCCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTaa < 1:1478471/91‑1 (MQ=255) aaCCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTaa < 2:2496287/91‑1 (MQ=255) aCCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGCAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTaaa > 2:3502066/1‑91 (MQ=255) acaacaATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGa < 2:3524520/91‑1 (MQ=255) caacaaTGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGaa > 2:3106795/1‑91 (MQ=255) caacaaTGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGCaa > 2:1613683/1‑91 (MQ=255) aacaaTGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGaaa < 1:1872200/91‑1 (MQ=255) acaaTGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAg < 2:735392/91‑1 (MQ=255) acaaTGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAg < 1:845926/91‑1 (MQ=255) acaaTGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAg < 1:2224995/91‑1 (MQ=255) acaaTGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAg > 1:2865860/1‑91 (MQ=255) acaaTGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAg < 2:1338598/91‑1 (MQ=255) aTGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCa > 1:340889/1‑91 (MQ=255) aTGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCa > 2:166517/1‑91 (MQ=255) tGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCAt < 1:3743976/91‑1 (MQ=255) gAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCAtt > 1:71710/1‑91 (MQ=255) aaTCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTa > 2:2743541/1‑91 (MQ=255) aaTCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTa > 2:1848623/1‑91 (MQ=255) aTCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTaa > 2:1317455/1‑91 (MQ=255) aTCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTaa < 1:3240065/91‑1 (MQ=255) ccAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAAc < 2:2411142/91‑1 (MQ=255) cAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAAcc > 1:2660782/1‑91 (MQ=255) tatTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAACcaatc > 1:410297/1‑91 (MQ=255) tatTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAACcaatc < 1:2354032/91‑1 (MQ=255) atTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAACcaatca > 1:67873/1‑91 (MQ=255) ttAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAACcaatcaa > 2:1876716/1‑91 (MQ=255) ttAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAACcaatcaa > 1:1070650/1‑91 (MQ=255) aaaaCAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAACCAATCAATAg > 1:3522728/1‑91 (MQ=255) aaaaCAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAACCAATCAATAg > 1:236730/1‑91 (MQ=255) aaaaCAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAACCAATCAATAg < 1:1981905/91‑1 (MQ=255) aaaCAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAACCAATCAATAGt > 2:1772788/1‑91 (MQ=255) | ATGATATTAAATCACATTTGTTAAATCGAAAAAAGCGTTAATTGATGCTCACTTTTTAAAGTAACCACAACAATGAATCCAAATATTAAAAACAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAGAAAATTTCTCACTGCTGTTCTTTTTATTTACTCTAAAGGAAAGCCATTAAACCAATCAATAGTTT > USA300TCH1516_ALE/1844563‑1844744 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |