New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1945259 | 231 (1.210) | 16 (0.090) | 11/144 | NT | 6.8% | intergenic (‑840/‑124) | splA/USA300HOU_RS09665 | Serine protease SplA/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1945265 | 229 (1.340) | intergenic (‑846/‑118) | splA/USA300HOU_RS09665 | Serine protease SplA/hypothetical protein |
Only 100 of 334 total aligned reads displayed.
TACATCTCAAAATTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAATTATTATTATATTTTCATTGTA > USA300TCH1516_ALE/1945169‑1945349 | cATCTCAAAATTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAatt‑a < 1:1217350/91‑1 (MQ=255) aTCTCAAAATTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAatt‑at < 1:3261679/91‑1 (MQ=255) aTCTCAAAATTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAatt‑at > 2:2282457/1‑91 (MQ=255) aTCTCAAAATTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAatt‑at < 2:2423665/91‑1 (MQ=255) tctcAAAATTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAatt‑att > 1:827898/1‑91 (MQ=255) tcAAAATTCTCGTCAACAATCTTGCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCGAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCt < 2:2959579/91‑1 (MQ=255) tcAAAATTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATagaata < 1:398794‑M1/91‑7 (MQ=255) cAAAATTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTa < 1:928449‑M2/91‑2 (MQ=255) cAAAATTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTa > 2:3089973‑M2/1‑90 (MQ=255) cAAAATTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAACT‑ATTCTa < 2:618108‑M2/91‑2 (MQ=255) aaaaTTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATagaataat < 1:982632‑M1/91‑9 (MQ=255) aaTTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTattt < 2:154221‑M2/91‑5 (MQ=255) ctcATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTatttttta < 2:2281521‑M2/91‑9 (MQ=255) ctcATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTatttttta < 1:145672‑M2/91‑9 (MQ=255) catcaACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATagaataattttttaac < 2:1420473‑M1/91‑17 (MQ=255) catcaACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGt > 1:1670522/1‑91 (MQ=255) atcaACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGtt > 1:1050027/1‑91 (MQ=255) atcaACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGtt > 1:254028/1‑91 (MQ=255) tcaACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATagaataattttttaacat < 2:70523‑M1/91‑19 (MQ=255) aTCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAatagat > 2:1207964/1‑91 (MQ=255) tCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAatagata > 2:1425280/1‑91 (MQ=255) cTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAatagatag > 2:2548256/1‑91 (MQ=255) cTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATAGAATAttttttaacatagttttgt > 1:3224806‑M2/1‑72 (MQ=255) tttCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAGAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGt < 2:2998428/91‑1 (MQ=255) ttCACATCCAACATTTTTTCTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGtt < 2:2257161/91‑1 (MQ=255) tCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTa > 1:3114150/1‑91 (MQ=255) tCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATG‑TAAAAAAAT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTaa < 2:1344422/91‑1 (MQ=255) cacaTCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTaa < 1:2061562/91‑1 (MQ=255) cacaTCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTaa < 2:45404/91‑1 (MQ=255) cacaTCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTaa < 1:3581786/91‑1 (MQ=255) acaTCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAAt < 2:1083143/91‑1 (MQ=255) caTCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATa < 1:72593/91‑1 (MQ=255) aTCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATAc < 1:1437896/91‑1 (MQ=255) ccAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACAt > 1:3642861/1‑91 (MQ=255) cAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACAtt < 2:214052/91‑1 (MQ=255) cAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACAtt < 2:2665409/91‑1 (MQ=255) aaCATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACAttt > 1:2570642/1‑91 (MQ=255) aCATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACAtttt > 2:3318595/1‑91 (MQ=255) cATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACAttttt < 1:3820299/91‑1 (MQ=255) aTTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTg > 2:1726744/1‑91 (MQ=255) tttttACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGa < 2:847759/91‑1 (MQ=255) ttttACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGat > 1:175336/1‑91 (MQ=255) ttttACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGat > 1:2906555/1‑91 (MQ=255) tttACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGata > 1:2829966/1‑91 (MQ=255) ttACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGatat > 2:3262762/1‑91 (MQ=255) tACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATAtt < 1:771065/91‑1 (MQ=255) tACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATAtt > 1:3834309/1‑91 (MQ=255) tACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATAtt < 2:1959189/91‑1 (MQ=255) aCTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATAttt > 1:481794/1‑91 (MQ=255) cTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTa > 2:3596805/1‑91 (MQ=255) ttAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGt > 1:2858011/1‑91 (MQ=255) tAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGtt < 2:283925/91‑1 (MQ=255) tAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGtt > 1:1979837/1‑91 (MQ=255) gTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTaa < 2:3642861/91‑1 (MQ=255) tttttATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAAt < 1:2332282/91‑1 (MQ=255) tttttATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAAt < 1:785616/91‑1 (MQ=255) ttttATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAAta > 2:3848369/1‑90 (MQ=255) tataATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGtt > 2:1572991/1‑91 (MQ=255) taATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCt > 2:1457484/1‑91 (MQ=255) taATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCt > 1:3570679/1‑91 (MQ=255) taATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCt < 2:3820470/91‑1 (MQ=255) cAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTaa > 2:2583636/1‑91 (MQ=255) aaaaCAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTaaa > 1:2743729/1‑91 (MQ=255) aaaCAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTTATATTTAGTTAATTGTTATTTTaaaa < 2:2218035/91‑1 (MQ=255) aaaCAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTaaaa > 1:3531512/1‑91 (MQ=255) acaacaAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTaaaaaa > 1:3739047/1‑91 (MQ=255) aacaaAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTTATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAatt > 2:3732113/1‑91 (MQ=255) aacaaAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAatt > 2:2930761/1‑91 (MQ=255) caaAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAattat > 1:3431678/1‑91 (MQ=255) aaaCTATGTTAAAAAATtattctattttttaacatagttttgttgttttgaattataaaaactaaagtaaaaatgttggatgtgaaagatt > 1:1528702‑M1/1‑17 (MQ=255) aaaCTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAattatta < 1:3283668/91‑1 (MQ=255) aaaCTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAattatta > 2:1142500/1‑91 (MQ=255) aaaCTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAattatta < 1:1234387/91‑1 (MQ=255) aaCTATGTTAAAAAATT‑ATTCTattttttaacatagttttattgttttgaattataaaaactaaagcaaaaatgttggatgtgaaagattg < 2:3598591‑M2/91‑70 (MQ=255) aaCTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAattattat > 2:2393605/1‑91 (MQ=255) aCTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAattattatt > 1:1147030/1‑91 (MQ=255) aCTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAattattatt < 1:1865323/91‑1 (MQ=255) aCTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTT‑AAAAAttattatta < 1:1361189/91‑1 (MQ=255) aCTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAATTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAActtattatt > 2:3374114/1‑91 (MQ=255) cTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAAttattatta < 2:2642076/91‑1 (MQ=255) cTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAAttattatta < 2:1814749/91‑1 (MQ=255) tATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAATAATtattattat < 1:2995077/91‑1 (MQ=255) tATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAATtattattat < 2:2737922/91‑1 (MQ=255) tATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAATtattattat < 1:625243/91‑1 (MQ=255) aTGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAATTATTATtata > 1:1091616/1‑91 (MQ=255) aTGTTAAAAAATG‑ATTCTattttttaacatagttttgttgttttgaattataaaaactaaagtaaaaatgttggatgtgaaagattgttga < 1:2976906‑M2/91‑74 (MQ=255) tGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAATTATTATTatat < 2:2514859/91‑1 (MQ=255) gTTAAAAAATT‑ATTCTattttttaacatagttttgttgttttgaattataaaaactaaagtaaaaatgttggatgtgaaagattgttgatg < 1:223746‑M2/91‑76 (MQ=255) tAAAAAATagaataattttttaacatagttttgttgttttgaattataaaaactaaagtaaaaatgttggatgtgaaagattgttgatgag < 1:79235‑M1/91‑84 (MQ=255) aaaaaaTT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAATTATTATTATATTTTc > 1:2661166/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAATTATTATTATATTTTc < 1:2109387/91‑1 (MQ=255) aaaaaTagaataattttttaacatagttttgttgttttgaattataaaaactaaagtaaaaatgttggatgtgaaagattgttgatgagaa > 2:2617538‑M1/1‑6 (MQ=255) aaaaTagaataattttttaacatagttttgttgttttgaattataaaaactaaagtaaaaatgttggatgtgaaagatcgttgatgagaat < 1:2985185‑M1/91‑87 (MQ=255) aaTagaataattttttaacatagttttgttgttttgaattataaaaactaaagtaaaaatgttggatgtgaaagattgttgatgagaattt < 2:1654445‑M1/91‑89 (MQ=255) aaTagaataattttttaacatagttttgttgttttgaattataaaaactaaagtaaaaatgttggatgtgaaagattgttgatgagaattt > 1:3656862‑M1/1‑3 (MQ=255) aaTT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAATTATTATTATATTTTCATTg < 2:3494405/91‑1 (MQ=255) aaTT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAATTATTATTATATTTTCATTg > 2:351844/1‑91 (MQ=255) att‑attCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAATTATTATTATATTTTCATTGt > 2:483251/1‑91 (MQ=255) tagaataattttttaacatagttttgttgttttgaattataaaaactaaagtaaaaatgttggatgtgaaagattgttgatgagaattttg > 1:2387813‑M1/1‑1 (MQ=255) tagaataattttttaacatagttttgttgttttgaattataaaaactaaagtaaaaatgttggatgtgaaagattgttgatgagaattttg > 2:1156971‑M1/1‑1 (MQ=255) | TACATCTCAAAATTCTCATCAACAATCTTTCACATCCAACATTTTTACTTTAGTTTTTATAATTCAAAACAACAAAACTATGTTAAAAAATT‑ATTCTATTTTTTAGTTAATAGATAGTTAATACATTTTTGATATTTAGTTAATTGTTCTTTTAAAAAATTATTATTATATTTTCATTGTA > USA300TCH1516_ALE/1945169‑1945349 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |