| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2008942 = | 127 (0.670) | 12 (0.080) | 7/132 | NT | 9.9% | intergenic (+70/+121) | USA300HOU_RS10115/USA300HOU_RS10125 | hypothetical protein/Putative multidrug export ATP‑binding/permease protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2008991 = | 115 (0.730) | intergenic (+119/+72) | USA300HOU_RS10115/USA300HOU_RS10125 | hypothetical protein/Putative multidrug export ATP‑binding/permease protein | |||||
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCTTCA > USA300TCH1516_ALE/2008852‑2009032 | gaagaaGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAA > 1:286159‑M1/1‑91 (MQ=255)gaagaaGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAA < 2:2842287‑M1/91‑1 (MQ=255)gaagaaGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAA > 2:2777073‑M1/1‑91 (MQ=255)agcattcaaaacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacataga > 1:955165‑M1/91‑91 (MQ=255)agcattcaaaacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacataga > 1:1650491‑M1/91‑91 (MQ=255) aagaagACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAA > 1:2642200‑M1/1‑91 (MQ=255) agaagaCTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAA < 2:899493‑M1/91‑1 (MQ=255) gaCTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTCAATTTAAAAAAGC > 1:592224‑M1/1‑91 (MQ=255) gaCTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGC > 2:2673286‑M1/1‑91 (MQ=255) cTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAG > 2:432412‑M1/1‑91 (MQ=255) cTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAG < 2:2337534‑M1/91‑1 (MQ=255) cTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAG < 2:1702151‑M1/91‑1 (MQ=255) cTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAG > 1:1023432‑M1/1‑91 (MQ=255) aaacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAg < 1:2017764‑M1/9‑1 (MQ=255) tttGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGT > 1:1897250‑M1/1‑91 (MQ=255) tttGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGT > 1:885732‑M1/1‑91 (MQ=255) aacttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGt > 1:1502256‑M1/82‑91 (MQ=255) ttGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTA > 2:1579423‑M1/1‑91 (MQ=255) cttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTaa < 2:1152191‑M1/12‑1 (MQ=255) cttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTaa > 1:991647‑M1/80‑91 (MQ=255) cttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTaa < 2:348164‑M1/12‑1 (MQ=255) ttataaagtattagttgtttgacttcagtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAg > 1:3507711‑M1/79‑91 (MQ=255) gATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAG > 2:1049906‑M1/1‑91 (MQ=255) gATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAG < 1:213891‑M1/91‑1 (MQ=255) aTTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA > 1:3340211‑M1/1‑91 (MQ=255) aTTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGA > 1:3606899‑M1/1‑91 (MQ=255) tttATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGat < 2:127604/91‑1 (MQ=255) tttATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGat < 1:378417/91‑1 (MQ=255) ttATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGatt > 2:2691795/1‑91 (MQ=255) tataACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGatta < 1:126962/91‑1 (MQ=255) ataACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGattat < 1:2703398/91‑1 (MQ=255) aaCATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTAttt < 1:3285068/91‑1 (MQ=255) aaCATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTAttt < 1:895978/91‑1 (MQ=255) aCATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGattattat > 2:2037668/1‑89 (MQ=255) aCATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTAtttt > 1:2322738/1‑91 (MQ=255) aTTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCa > 1:2012461/1‑91 (MQ=255) aTTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCa > 1:471390/1‑91 (MQ=255) aaaCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAgattttcttaatt < 2:3526239‑M1/91‑14 (MQ=255) aaaCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTa > 2:595821/1‑91 (MQ=255) aaaCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTa < 2:3606899/91‑1 (MQ=255) aaCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTaa < 2:735775/91‑1 (MQ=255) aCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAg > 2:2544040/1‑91 (MQ=255) aCAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAg > 1:1339726/1‑91 (MQ=255) tttATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAttattttcttaattgaaaat < 2:743242‑M1/91‑21 (MQ=255) aTCAATTAATGCGACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtc < 1:2979994‑M2/91‑3 (MQ=255) cAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtctt < 2:191380‑M2/91‑5 (MQ=255) cAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtctt > 2:1878330‑M2/1‑87 (MQ=255) cAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtctt < 1:117864‑M2/91‑5 (MQ=255) gtacaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTa > 2:1300713‑M1/52‑91 (MQ=255) aaTTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAgattttcttaattgaaaataatctta < 2:754621‑M1/91‑27 (MQ=255) aaTTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAgattttcttaattgaaaataatctta < 1:3434125‑M1/91‑27 (MQ=255) aaTTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtctta > 2:3175691‑M2/1‑86 (MQ=255) aTTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttac > 2:1930862‑M2/1‑85 (MQ=255) ttAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttact > 1:1406935‑M2/1‑84 (MQ=255) ttAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttact > 1:1824736‑M2/1‑84 (MQ=255) ttAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttact > 1:2054963‑M2/1‑84 (MQ=255) acaatcttgaagagaaaatttgtaacaggatggtggggtcataacatagAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACt > 1:1854002‑M1/50‑91 (MQ=255) aaTGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAgattttcttaattgaaaataatcttactgc < 1:2807132‑M1/91‑31 (MQ=255) aaTGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttactgc > 1:2872053‑M2/1‑82 (MQ=255) aTGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttactgct < 1:1566463‑M2/91‑11 (MQ=255) aTGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttactgct < 2:3102990‑M2/91‑11 (MQ=255) acaATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAgattttcttaattgaaaataatcttactgctttttt < 2:958389‑M1/91‑37 (MQ=255) acaATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAgattttcttaattgaaaataatcttactgctttttt < 1:2596672‑M1/91‑37 (MQ=255) acaATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTc < 1:1485662/91‑1 (MQ=255) caATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAgattttcttaattgaaaataatcttactgctttttta < 2:180101‑M1/91‑38 (MQ=255) caATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCt < 1:2015763/91‑1 (MQ=255) aaTGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGAgattttcttaattgaaaataatcttactgcttttttaa < 1:24090‑M1/91‑39 (MQ=255) tGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATg > 2:2210358/1‑91 (MQ=255) gagaTAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGt < 1:1149618/91‑1 (MQ=255) agaTAAACTAATGTTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGtt < 2:3227381/91‑1 (MQ=255) gaTAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTa > 1:3872574/1‑91 (MQ=255) gaTAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTa < 2:385844/91‑1 (MQ=255) gaTAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTa < 1:3102313/91‑1 (MQ=255) tAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAATGCCCTTACTGATTTTTCTATGTTATg > 2:3356765/1‑91 (MQ=39) tAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATg > 2:822732/1‑91 (MQ=255) tAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATg < 1:3742151/91‑1 (MQ=255) aaCTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGAc < 2:237731/91‑1 (MQ=255) aaCTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGAc < 1:850711/91‑1 (MQ=255) aaTATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCcca < 2:2146857/91‑1 (MQ=255) atatTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCccac > 1:196581/1‑91 (MQ=255) tatTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCccacc < 1:2779079/91‑1 (MQ=255) atTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCccacca > 2:3001334/1‑91 (MQ=255) atTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCccacca < 2:703462/91‑1 (MQ=255) aaTCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCt < 1:2383751/91‑1 (MQ=255) aTCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTg > 1:69046/1‑91 (MQ=255) gAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACa > 2:1495272/1‑91 (MQ=255) aaattaaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACaa < 1:2673286/91‑1 (MQ=255) aattaacttTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACaaa > 1:3016471/1‑91 (MQ=255) ttaaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAAtt < 1:762407/91‑1 (MQ=255) taaattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAAttt < 2:3274875/91‑1 (MQ=255) aattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtc > 2:1315063/1‑91 (MQ=255) aattTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtc > 2:2294008/1‑91 (MQ=255) tttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtctc > 2:35592/1‑91 (MQ=255) tttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtctc > 2:1407411/1‑91 (MQ=255) tttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCCTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTtctc > 1:3362102/1‑91 (MQ=255) ttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttactgcttttttaaatttaatttcgagattcaatattagtttatctcatt < 1:3069384‑M2/91‑54 (MQ=255) ttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCtcttactgcttttttaaatttaatttcgagattcaatattagtttatctcatt < 1:3646059‑M2/91‑54 (MQ=255) ttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTctct < 2:496319/91‑1 (MQ=255) ttAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTctct < 1:432412/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTACTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCTTc < 2:2944748/91‑1 (MQ=255) | GAAGAAGACTTTGATTTATAACATTAAAACAATTTTATCAATTAATGCCACAATGAGATAAACTAATATTGAATCTCGAAATTAAATTTAAAAAAGCAGTAAGATTATTTTCAATTAAGAAAATCTCTTACTGCTTTTTCTATGTTATGACCCCACCATCCTGTTACAAATTTTCTCTTCA > USA300TCH1516_ALE/2008852‑2009032 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |