| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2150647 = | 195 (1.020) | 18 (0.110) | 13/136 | NT | 11.1% | intergenic (+310/+57) | agrA/scrK | Accessory gene regulator A/Fructokinase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2150691 = | 124 (0.770) | intergenic (+354/+13) | agrA/scrK | Accessory gene regulator A/Fructokinase | |||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
TTTTTAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGG > USA300TCH1516_ALE/2150557‑2150736 | tttttAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTaaa > 2:1455323/1‑91 (MQ=255)ttgctgcaatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttata < 2:3455767‑M1/1‑1 (MQ=255)ttgctgcaatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttata < 1:95594‑M1/1‑1 (MQ=255) tgctgcaatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttataa > 1:2286904‑M1/90‑91 (MQ=255) gctgcaatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttataaa < 1:2939235‑M1/3‑1 (MQ=255) ttAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTaaaaaa < 2:2457063/91‑1 (MQ=255) tgcaatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAAc < 1:67084‑M1/5‑1 (MQ=255) aaCAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACa > 1:91835/1‑91 (MQ=255) caatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAg > 2:1871935‑M1/85‑91 (MQ=255) aCAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAg < 2:2460591/91‑1 (MQ=255) aatagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAgt < 2:674339‑M1/8‑1 (MQ=255) aatagtgacaacgaagtatggtgctatgaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaggaattcatttatAAAACAgt > 2:2536539‑M1/84‑91 (MQ=255) tagtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAgtgt > 2:145389‑M1/82‑91 (MQ=255) aaaTATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAgtgt < 1:3717440/91‑1 (MQ=255) agtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAGTGTa > 2:2171118‑M1/81‑91 (MQ=255) gtgacaacgaagtatggtgctattaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcagttatAAAACAGTGTAg < 2:3702361‑M1/12‑1 (MQ=255) atatACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAg > 1:422620/1‑91 (MQ=255) aCTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGcaca > 1:3618614/1‑91 (MQ=255) aCTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGcaca > 2:2645015/1‑91 (MQ=255) aCTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGcaca > 1:3114841/1‑91 (MQ=255) aCTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGcaca < 2:920480/91‑1 (MQ=255) tAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAg < 2:382931/91‑1 (MQ=255) aaTTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGAt > 1:573143/1‑91 (MQ=255) tttGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAgttga < 1:1865275/91‑5 (MQ=255) tttGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAgttga < 1:1866791/91‑5 (MQ=255) tttGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTc < 2:769228/91‑1 (MQ=255) ttGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCa < 1:1909739/91‑1 (MQ=255) ttGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCa > 1:486514/1‑91 (MQ=255) gAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAAc < 2:156913/91‑1 (MQ=255) aaaTTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACt < 1:1687594/91‑1 (MQ=255) aaaTTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACt < 1:24221/91‑1 (MQ=255) aaaTTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACt < 2:254101/91‑1 (MQ=255) aaaTTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACt < 1:3372481/91‑1 (MQ=255) aaTTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTAAACtt > 2:3138008/1‑91 (MQ=255) aTTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTg < 1:3279194/91‑1 (MQ=255) aTTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTg < 2:1055008/91‑1 (MQ=255) ttGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGt < 2:2380756/91‑1 (MQ=255) gACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGttt > 1:109139/1‑91 (MQ=255) cAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTcc < 2:3854081/91‑1 (MQ=255) cAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTcc < 1:290933/91‑1 (MQ=255) attaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTcc > 2:221551‑M1/59‑91 (MQ=255) ttaatagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCt > 1:2690136‑M1/58‑91 (MQ=255) aGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCt < 1:3016551/91‑1 (MQ=255) aGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCt < 1:260918/91‑1 (MQ=255) gTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTa < 1:2033895/91‑1 (MQ=255) ttCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTaca < 2:1119534/91‑1 (MQ=255) ttCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTaca < 1:271882/91‑1 (MQ=255) atagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAGTGTAGTACAAGATTCAACTTGTTTCCTaca > 2:2822698‑M1/55‑91 (MQ=255) tagtttgccaacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTacac > 2:3297281‑M1/54‑91 (MQ=255) cATAAATGAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTg < 1:1943917/91‑1 (MQ=255) cATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTg < 1:117819/91‑1 (MQ=255) ataaataaAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGt < 1:2093899/91‑1 (MQ=255) ataaataaAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGt > 1:1325398/1‑91 (MQ=255) ataaataaAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGt < 1:767861/91‑1 (MQ=255) aaataaaATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGttt < 2:1763204/91‑1 (MQ=255) aataaaATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGtttt > 2:2801526/1‑91 (MQ=255) aataaaATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGtttt > 2:3644960/1‑91 (MQ=255) ataaaATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTta > 2:2938699/1‑91 (MQ=255) aacattacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttatAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACAATGTTTtata > 1:1947895‑M1/45‑91 (MQ=255) aaTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATaaa < 1:2788526/91‑1 (MQ=255) aaTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATaaa > 2:1522280/1‑91 (MQ=255) aaTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATaaa > 1:1051036/1‑91 (MQ=255) aaTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTACTACACTGTTTTATaaa < 2:944820/91‑1 (MQ=255) aTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAAt > 2:1011350/1‑91 (MQ=255) ttacaagaggttgaacaagcattttaaataattcagttatAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATg > 2:851206‑M1/41‑91 (MQ=255) aaTTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAattat > 2:2782657/1‑91 (MQ=255) tttCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTAttt < 2:461817/91‑1 (MQ=255) ggttgaacaagcattttaaataattcatttaaAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTAttt > 1:1184365‑M1/33‑91 (MQ=255) ttgaacaagcattttaaataattcatttaaAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTaa > 1:814394‑M1/31‑91 (MQ=255) tCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTaa < 2:752863/91‑1 (MQ=255) cTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAGAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACATTGTTTTATAAATGAATGATTTaaaa > 2:3371158/1‑91 (MQ=255) cTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTaaaa > 1:466765/1‑91 (MQ=255) tACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAAt > 1:1518666/1‑91 (MQ=255) tACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAAt > 1:3399869/1‑91 (MQ=255) cTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGc < 1:1536591/91‑1 (MQ=255) cTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGc > 1:2407123/1‑91 (MQ=255) tCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCt > 2:1930425/1‑91 (MQ=255) ccGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCtt > 1:2932005/1‑91 (MQ=255) cGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTg < 1:2925690/91‑1 (MQ=255) gTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGt < 1:3811303/91‑1 (MQ=255) gTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGt < 2:3536160/91‑1 (MQ=255) aaTCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCa > 2:3265745/1‑91 (MQ=255) tCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAAc > 1:3241385/1‑91 (MQ=255) tCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAAc > 1:3661859/1‑91 (MQ=255) cTTATATTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAAcc < 2:183423/91‑1 (MQ=255) ttATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACct < 1:1011350/91‑1 (MQ=255) tATTTTGTATTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctc < 2:2436117/91‑1 (MQ=255) aTTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctct > 1:2051396/1‑91 (MQ=255) aTTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctct < 1:1759419/91‑1 (MQ=255) aTTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctct < 1:1455323/91‑1 (MQ=255) tttGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTg < 1:723258/91‑1 (MQ=255) tttGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTg < 2:540966/91‑1 (MQ=255) tttGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTg < 2:602301/91‑1 (MQ=255) tttGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTg > 2:228857/1‑91 (MQ=255) gttttttAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTaa < 1:820848‑M1/84‑1 (MQ=255) ttttAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAAt < 1:3561468/91‑1 (MQ=255) ttttAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAAt < 2:310313/91‑1 (MQ=255) ttttAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAAt < 1:3560227/91‑1 (MQ=255) tAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGtt < 1:2235390/91‑1 (MQ=255) aaaaaaCAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTg < 2:2086558/91‑1 (MQ=255) | TTTTTAACAAAATATACTAAATTTGAAATTGACAGTTTCCATAAATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGG > USA300TCH1516_ALE/2150557‑2150736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |