New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2150647 = | 195 (1.020) | 18 (0.110) | 13/136 | NT | 11.1% | intergenic (+310/+57) | agrA/scrK | Accessory gene regulator A/Fructokinase |
? | USA300TCH1516_ALE | 2150691 = | 124 (0.770) | intergenic (+354/+13) | agrA/scrK | Accessory gene regulator A/Fructokinase |
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
ATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACTATTGCAGCAAC > USA300TCH1516_ALE/2150601‑2150781 | ataaaATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTGTTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTta > 2:2939235/1‑91 (MQ=255) ataaaATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTta > 2:2938516/1‑91 (MQ=255) taaaATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTtat > 1:906762/1‑91 (MQ=255) aaaaTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTGTCCTACACTGTTTtata < 1:1189008/91‑1 (MQ=255) aaTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATaaa > 1:1051036/1‑91 (MQ=255) aaTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATaaa > 2:1522280/1‑91 (MQ=255) aaTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTACTACACTGTTTTATaaa < 2:944820/91‑1 (MQ=255) aTGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAAt > 2:1011350/1‑91 (MQ=255) ttacaagaggttgaacaagcattttaaataattcatttataaaacagtgtaggaaacaagttgaatcttgtgctacactgttttaaaaaac < 1:820848‑M2/7‑3 (MQ=255) ttacaagaggttgaacaagcattttaaataattcagttatAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATg > 2:851206‑M1/41‑91 (MQ=255) tGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATg > 1:3655719/1‑91 (MQ=255) cTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGaa < 1:479888/91‑1 (MQ=255) tataATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAat < 1:1646297/91‑1 (MQ=255) aaTTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAattat > 1:3199504/1‑91 (MQ=255) aaTTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAattat > 2:2782729/1‑91 (MQ=255) aTTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAattatt > 1:429783/1‑91 (MQ=255) tttCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTAttt < 2:2488784/91‑1 (MQ=255) tttCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTAttt < 2:1795451/91‑1 (MQ=255) tCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTaa < 2:752863/91‑1 (MQ=255) cTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTaaaa < 2:452164/91‑1 (MQ=255) tACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAAt > 1:1518665/1‑91 (MQ=255) aCTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATg < 2:646480/91‑1 (MQ=255) aCTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATg > 1:869034/1‑91 (MQ=255) tCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCt > 2:1930425/1‑91 (MQ=255) ccGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCtt > 1:2932005/1‑91 (MQ=255) cGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTg < 1:2925690/91‑1 (MQ=255) aaTCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCa > 2:3265835/1‑91 (MQ=255) ttaaataattcatttataaaacagtgtaggaaacaagttgaatcttgtgctacactgttttTTAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCaa > 1:814394‑M2/62‑91 (MQ=255) cTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAAcc > 2:771550/1‑91 (MQ=255) ttATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACct < 1:1011350/91‑1 (MQ=255) tATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctc > 1:973465/1‑91 (MQ=255) tATTTTGTATTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctc < 2:2436117/91‑1 (MQ=255) aTTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctct > 2:2548649/1‑91 (MQ=255) aTTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctct < 1:1759419/91‑1 (MQ=255) aTTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctct > 2:804817/1‑91 (MQ=255) aTTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctct < 2:2758719/91‑1 (MQ=255) aTTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACctct > 1:2051396/1‑91 (MQ=255) tttGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTTCACTGTTTTATAAATGAATTATGTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTg < 1:3071054/91‑1 (MQ=255) tttGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTg < 1:723258/91‑1 (MQ=255) tttGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACGTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTg < 2:540864/91‑1 (MQ=255) ttttAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAAt < 1:3560227/91‑1 (MQ=255) ttttAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAAt < 1:3560517/91‑1 (MQ=255) ttttAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAAt < 2:3235598/91‑1 (MQ=255) tataaaacattgtaggaaacaagttgaatcttgtgctacactgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGtt > 1:1947895‑M2/48‑91 (MQ=255) tAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGtt < 1:2235390/91‑1 (MQ=255) aaaaaaCAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTg < 2:2086558/91‑1 (MQ=255) tAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACTTCTTGTAATGTTgg < 2:1476221‑M1/90‑1 (MQ=255) aaaaaCAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTgg < 1:3031725/91‑1 (MQ=255) AAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCa > 1:3750738‑M1/1‑91 (MQ=255) AAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCa > 2:1162827‑M1/1‑91 (MQ=255) ACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCaaa > 2:1837387‑M1/1‑91 (MQ=255) ACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCaaa < 2:563324‑M1/91‑1 (MQ=255) cagtgtaggaaacaagttgaatcttgtgctacactgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAAc > 1:629170‑M2/41‑91 (MQ=255) CAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAAc > 1:2782657‑M1/1‑91 (MQ=255) agtgtaggaaacaagttgaatcttgtgctacactgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACt > 1:3470088‑M2/40‑91 (MQ=255) AGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACt > 2:3021326‑M1/1‑91 (MQ=255) gtgtaggaaacaagttgaatcttgtgctacactgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTa > 1:1914656‑M2/39‑91 (MQ=255) GTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTa > 1:3289810‑M1/1‑91 (MQ=255) TGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTAt < 1:2582667‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTAt < 2:2247280‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTAt < 2:3484915‑M1/91‑1 (MQ=255) TAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTa < 1:141373‑M1/91‑1 (MQ=255) aggaaacaagttgaatcttgtgctacactgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTaa > 1:2690136‑M2/35‑91 (MQ=255) ggaaacaagttgaatcttgtgctacactgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAAt > 2:221551‑M2/34‑91 (MQ=255) GCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAAt > 2:3332499‑M1/1‑91 (MQ=255) aaacaagttgaatcttgtgctacactgttttTTAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAg > 2:3397858‑M2/32‑91 (MQ=255) aaGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCa < 1:1127951/91‑1 (MQ=255) aGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCAc < 2:3800502/91‑1 (MQ=255) aTTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCa < 2:486514/91‑1 (MQ=255) aTTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCa < 2:2355314/91‑1 (MQ=255) aTTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCa < 1:3409830/91‑1 (MQ=255) ttCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCAt < 1:94929/91‑1 (MQ=255) tCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATa < 1:2368986/91‑1 (MQ=255) tCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATa < 1:344630/91‑1 (MQ=255) cAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATAc < 1:3330309/91‑1 (MQ=255) aaCTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACt < 2:2355724/91‑1 (MQ=255) aaCTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACt < 1:1856602/91‑1 (MQ=255) aaCTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACt < 2:304152/91‑1 (MQ=255) aaCTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTCGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACt > 1:2568677/1‑91 (MQ=255) aCTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACtt > 1:2399049/1‑91 (MQ=255) ttGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCg > 1:2834841/1‑91 (MQ=255) ttGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACATCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCg < 2:3594628/91‑1 (MQ=255) tGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGt < 1:1705061/91‑1 (MQ=255) gTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGtt < 2:91835/91‑1 (MQ=255) ttCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGt < 1:216358/91‑1 (MQ=255) tCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTc < 1:3828628/91‑1 (MQ=255) tCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTc > 1:3562987/1‑91 (MQ=255) tCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTc > 2:3882165/1‑91 (MQ=255) ccTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCa > 1:1287770/1‑91 (MQ=255) ctacactgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCAc > 1:1168839‑M2/13‑91 (MQ=255) tactctgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACt > 2:1320427‑M2/12‑91 (MQ=255) tacactgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACt > 2:2171118‑M2/12‑91 (MQ=255) acactgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACTa > 2:145389‑M2/11‑91 (MQ=255) actgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACTAtt < 1:336087‑M2/83‑1 (MQ=255) ctgttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACTATTg > 2:1871935‑M2/8‑91 (MQ=255) gttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACTATTgca < 1:67084‑M2/86‑1 (MQ=255) ttttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACTATTgcag > 2:3588809‑M2/5‑91 (MQ=255) tttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACTATTgcagc < 1:2939235‑M2/88‑1 (MQ=255) tttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACTATTgcagc > 1:1524454‑M2/4‑91 (MQ=255) ttATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACTATTgcagca > 1:2287431‑M2/3‑91 (MQ=255) | ATAAAATGCTATAATTTCCTACTCCGTGAATCTTATTTTGTTTTAAAAAACAGTGTAGCACAAGATTCAACTTGTTTCCTACACTGTTTTATAAATGAATTATTTAAAATGCTTGTTCAACCTCTTGTAATGTTGGCAAACTATTAATAGCACCATACTTCGTTGTCACTATTGCAGCAAC > USA300TCH1516_ALE/2150601‑2150781 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |