| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2499443 = | 176 (0.920) | 16 (0.090) | 6/142 | NT | 10.1% | intergenic (‑20/‑163) | treP_2/USA300HOU_RS12875 | PTS system trehalose‑specific EIIBC component/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2499482 = | 129 (0.760) | intergenic (‑59/‑124) | treP_2/USA300HOU_RS12875 | PTS system trehalose‑specific EIIBC component/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
GCCATTGCATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAACACCTACACCATT > USA300TCH1516_ALE/2499353‑2499533 | gcatgtagtatagcaataaaaatgaatgcgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgg > 2:1166517‑M1/91‑91 (MQ=255)gcatgtagtatagcaataaaaatgaatgcgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgg > 1:3007575‑M1/91‑91 (MQ=255)gcatgtagtatagcaataaaaatgaatgcgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgg > 2:3493726‑M1/91‑91 (MQ=255) catgtagtatagcaataaaaatgaatgcgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgg > 2:3881883‑M1/90‑90 (MQ=255) catgtagtatagcaataaaaatgaatgcgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGa > 2:1266821‑M1/90‑91 (MQ=255) catgtagtatagcaataaaaatgaatgcgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGa < 2:2693177‑M1/2‑1 (MQ=255) tttGCATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAAc < 2:2625450/90‑1 (MQ=255) tgtagtatagcaataaaaatgaatgcgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAAc < 1:960090‑M1/4‑1 (MQ=255) aTTGCATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAAc < 2:3021386/91‑1 (MQ=255) aTTGCATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAAc < 2:3556475/91‑1 (MQ=255) tagtatagcaataaaaatgaatgcgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAACCg < 2:376156‑M1/6‑1 (MQ=255) tagtatagcaataaaaatgaatgcgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAACCg < 1:2216458‑M1/6‑1 (MQ=255) tagtatagcaataaaaatgaatgcgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAACCg < 1:1991964‑M1/6‑1 (MQ=255) tGCATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCg > 2:803496/1‑91 (MQ=255) gtatagcaataaaaatgaatgcgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAACCGGt < 2:1700226‑M1/8‑1 (MQ=255) cATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGt < 2:1951797/91‑1 (MQ=255) cATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGt > 1:2352202/1‑91 (MQ=255) cATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGt < 2:2515226/91‑1 (MQ=255) cATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGt > 2:628846/1‑91 (MQ=255) cATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGt > 1:1870951/1‑91 (MQ=255) cATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGt < 1:3175018/91‑1 (MQ=255) aTCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGtt > 1:2105285/1‑91 (MQ=255) aTCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGtt > 1:3799461/1‑91 (MQ=255) cTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTcc < 1:1438780/91‑1 (MQ=255) aaaTTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCAt < 2:2032069/91‑1 (MQ=255) aaaTTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATATCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATAGTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCAt < 2:1010863/91‑1 (MQ=255) aTTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCAttt < 2:1890139/91‑1 (MQ=255) tctcttctcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTAt < 2:1683283/91‑1 (MQ=255) tctcttctcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTAt < 1:1960916/91‑1 (MQ=255) tctcttctcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTAt < 1:114692/91‑1 (MQ=255) tcttctcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTc > 1:1061798/1‑91 (MQ=255) tcttctcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTc < 1:768359/91‑1 (MQ=255) cttctcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTcc < 2:2321120/91‑1 (MQ=255) cttctcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTcc > 2:1916478/1‑91 (MQ=255) cttctcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATACATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTcc < 1:3089425/91‑1 (MQ=255) ttctcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCa > 2:24277/1‑91 (MQ=255) ttctcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCa > 2:3198381/1‑91 (MQ=255) tctcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCAc > 1:3660901/1‑91 (MQ=255) tcCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACtt < 1:807829/91‑1 (MQ=255) ccGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACttt < 1:1562262/91‑1 (MQ=255) gCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCACTTATTCCACTTTAt < 2:3298205/91‑1 (MQ=255) cgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTg > 1:293874‑M1/63‑91 (MQ=255) cgctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTg > 2:1399691‑M1/63‑91 (MQ=255) tATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGt > 1:1738929/1‑91 (MQ=255) gctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGt > 1:3245451‑M1/62‑91 (MQ=255) gctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGt > 2:3631630‑M1/62‑91 (MQ=255) gctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGt > 2:446638‑M1/62‑91 (MQ=255) ctatcaaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTa > 1:222983‑M1/61‑91 (MQ=255) tCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTTTaa > 2:1571336/1‑91 (MQ=255) tCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTaa < 2:377320/91‑1 (MQ=255) cgcgTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAAc < 1:2474631/91‑1 (MQ=255) cgcgTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAAc > 2:3566196/1‑91 (MQ=255) gTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCgg < 1:1499160/91‑1 (MQ=255) aaaaatggtgtaggtgtttatataaaatgataatagagtgttgcaaatatttttgGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCgg > 1:1115872‑M1/56‑91 (MQ=255) aaaTTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCa < 1:3506380/91‑1 (MQ=255) aaaTTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCa < 1:3638798/91‑1 (MQ=255) aaTTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCaa < 1:2856111/91‑1 (MQ=255) aaTTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCaa < 2:34060/91‑1 (MQ=255) aTTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCaaa < 2:1919942/91‑1 (MQ=255) aTTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCaaa < 1:2346857/91‑1 (MQ=255) ttcttcTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCaaaaa > 1:895540/1‑91 (MQ=255) tcttctGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAat < 1:2734655/91‑1 (MQ=255) tcttctGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAat < 1:1177232/91‑1 (MQ=255) cttctGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTc < 1:3652310/83‑1 (MQ=255) cttctGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTc > 2:3652310/1‑83 (MQ=255) cttctGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAata > 2:798361/1‑91 (MQ=255) ttctGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAatat > 1:3528898/1‑91 (MQ=255) tctGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATAtt < 2:429372/91‑1 (MQ=255) gtgtttatataaaatgataatacagtgttgcaaatatttttgGAACCGATTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATAtt > 2:3119903‑M1/43‑91 (MQ=255) cttcGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATAttt < 2:143096/88‑1 (MQ=255) cGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCa < 2:5741/91‑1 (MQ=255) gATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAac < 1:2189082/91‑1 (MQ=255) gATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAac < 1:1371334/91‑1 (MQ=255) tGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACAct < 1:1819745/91‑1 (MQ=255) tGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACAct < 2:1572725/91‑1 (MQ=255) tGCTTAAAATTCATATATTTAGTCTCCTAATTAGAACCGGTGCCATTTAGTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACAct < 2:2945391/91‑1 (MQ=255) gCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACActc > 1:1307135/1‑91 (MQ=255) ataATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCtatt > 1:3820496/1‑91 (MQ=255) ataATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCtatt < 2:2188224/91‑1 (MQ=255) taATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCtatta < 1:2312908/91‑1 (MQ=255) aTTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATc < 1:3424788/91‑1 (MQ=255) cATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCAtt < 1:1428123/91‑1 (MQ=255) cATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCAtt > 2:2092307/1‑91 (MQ=255) cATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCAtt > 1:191953/1‑91 (MQ=255) atatatTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCAttt < 2:888724/91‑1 (MQ=255) tatatTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCAtttt > 1:121420/1‑91 (MQ=255) atatTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTta < 2:1515196/91‑1 (MQ=255) tatTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTtat < 2:2237188/91‑1 (MQ=255) tatTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTtat < 2:2713947/91‑1 (MQ=255) atTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTtata > 1:318574/1‑91 (MQ=255) cctcctAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAaca > 1:2599258/1‑91 (MQ=255) ctcctAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAccac > 1:3494101/1‑91 (MQ=255) ctAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCTGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAACACCTa < 2:3420306/91‑1 (MQ=255) ctAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAACACCTa < 1:2692041/91‑1 (MQ=255) ctAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAACACCTa > 2:1821840/1‑91 (MQ=255) ctAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAACACCTa < 1:425854/91‑1 (MQ=255) ctAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAACACCTa > 2:823608/1‑91 (MQ=255) tAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAACACCTACACCa > 2:2360743/1‑91 (MQ=255) tAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAACACCTACACCa < 1:614631/91‑1 (MQ=255) aGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAACACCTACACCAt > 1:591880/1‑91 (MQ=255) | GCCATTGCATCTAAATTCTCTTCTCCGCCTATCGCGTTCAAAATTTCTTCTGCGGATTGCTTATAATTCATATATTTAGCCTCCTAATTAGAACCGGTTCCATTTATTCCACTTTATTGTAACCGGTTCCAAAAATATTTGCAACACTCTATTATCATTTTATATAAACACCTACACCATT > USA300TCH1516_ALE/2499353‑2499533 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |