| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2588434 = | 219 (1.150) | 17 (0.100) | 8/142 | NT | 8.3% | intergenic (+17/+151) | yehR/gltB_2 | putative lipoprotein YehR/Glutamate synthase [NADPH] large chain |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2588483 = | 184 (1.090) | intergenic (+66/+102) | yehR/gltB_2 | putative lipoprotein YehR/Glutamate synthase [NADPH] large chain | |||||
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
TTAGTTTTGAAAAACTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAA > USA300TCH1516_ALE/2588344‑2588524 | gggaaattgaaagcagcggattttagcgttactgcaaataattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaag > 1:1860179‑M1/91‑91 (MQ=255) ggaaattgaaagcagcggattttagcgttactgcaaataattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGc < 2:154708‑M1/2‑1 (MQ=255) ggaaactgaaagcagcggattttagcgttactgcaaataattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGc > 2:3567887‑M1/90‑91 (MQ=255) gaaattgaaagcagcggattttagcgttactgcaaataattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGcc > 1:2392357‑M1/89‑91 (MQ=255) tttGAAAAACTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTc < 1:814123/91‑1 (MQ=255) attgaaagcagcggattttagcgttactgcaaataattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGCCCTc < 1:3546023‑M1/6‑1 (MQ=255) ttgaaagcagcggattttagcgttactgcaaataattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGCCCTCa < 1:2085749‑M1/7‑1 (MQ=255) ttGAAAAACTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCa > 2:3039753/1‑91 (MQ=255) ttGAAAAACTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCa > 1:3594035/1‑91 (MQ=255) tgaaagcagcggattttagcgttactgcaaataattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGCCCTCAg < 1:1010306‑M1/8‑1 (MQ=255) tgaaagcagcggattttagcgttactgcaaataattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGCCCTCAg > 2:261600‑M1/84‑91 (MQ=255) gAAAAACTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGTCCTCAGa > 1:1934980/1‑91 (MQ=255) gAAAAACTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGa > 1:3542356/1‑91 (MQ=255) aaaaaCTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑t > 1:1341934/1‑91 (MQ=255) aaaaaCTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑t < 1:3202476/91‑1 (MQ=255) aaaaCTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑Ta < 1:2146469/91‑1 (MQ=255) aaaCTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑Taa < 2:3629679/91‑1 (MQ=255) aCTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGa > 1:708928/1‑91 (MQ=255) ttGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑Ct < 1:1682976/91‑1 (MQ=255) aaaaGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAg > 2:1723565/1‑91 (MQ=255) aaaaGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAg > 1:2318083/1‑91 (MQ=255) aaaaGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAg > 1:653305/1‑91 (MQ=255) aaaaGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAg < 1:1760270/91‑1 (MQ=255) aaGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGt < 2:2505566/91‑1 (MQ=255) gCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTa < 1:2109240/91‑1 (MQ=255) cAATTAAGGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTAc < 1:1931707/91‑1 (MQ=255) cAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTAc < 2:842210/91‑1 (MQ=255) aaTTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACa < 1:1438245/91‑1 (MQ=255) aaTTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACa > 2:1276624/1‑91 (MQ=255) aaTTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACa > 1:1008278/1‑91 (MQ=255) aTTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGtttgta < 2:2771505/91‑5 (MQ=255) aTTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACaa < 2:1155504/91‑1 (MQ=255) ttAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACaaa > 1:2587489/1‑91 (MQ=255) ttAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACaaa < 2:3547977/91‑1 (MQ=255) ttAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACaaa < 1:146226/91‑1 (MQ=255) tAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAAc < 1:460537/91‑1 (MQ=255) gCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTa > 2:3819691/1‑91 (MQ=255) cacaGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTaa > 2:3519772/1‑91 (MQ=255) agagGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTc < 1:296312/91‑1 (MQ=255) gagGTTTACAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCa > 2:1881313/1‑91 (MQ=255) gagGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCa < 2:570813/91‑1 (MQ=255) gagGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCa > 2:1480415/1‑91 (MQ=255) gagGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCa < 1:3463549/91‑1 (MQ=255) ataattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaatGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCat > 2:60118‑M1/54‑91 (MQ=255) ataattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCat > 2:3456760‑M1/54‑91 (MQ=255) taattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGCCCTCAGAATATGAACT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCa > 1:3859404‑M1/53‑91 (MQ=255) ggTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCata > 2:2118882/1‑91 (MQ=255) gTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCATA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCatat > 1:3303891/1‑91 (MQ=255) aattttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCatat > 1:1176584‑M1/52‑91 (MQ=255) ttttatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTc > 2:1647862‑M1/50‑91 (MQ=255) ttAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTc < 1:3217857/91‑1 (MQ=255) tAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCt < 2:3502692/91‑1 (MQ=255) tAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCt > 1:2829757/1‑91 (MQ=255) tAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCt > 2:2667928/1‑91 (MQ=255) aaaagaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTg < 2:1706369/91‑1 (MQ=255) tatattagtagtggatgctggtcacacaagaacttcaagtattaaaGCCCTCATA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAGCCTTAATTCATATTCTGa > 1:1652776‑M1/47‑91 (MQ=255) aagaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAg > 2:72661/1‑91 (MQ=255) gaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAggg > 2:3767981/1‑91 (MQ=255) gaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAggg < 1:3056674/91‑1 (MQ=255) aaaaagaTAAAATGGACGACGAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGG‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGc < 2:3346479/91‑1 (MQ=255) aaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGc > 1:1465028/1‑91 (MQ=255) aaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGc < 2:2254781/91‑1 (MQ=255) aaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGc > 2:763303/1‑91 (MQ=255) aaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCt > 1:2091857/1‑91 (MQ=255) aaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCtt > 1:3875647/1‑91 (MQ=255) aagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCttt > 2:2001861/1‑91 (MQ=255) gaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTaa > 1:2765672/1‑91 (MQ=255) aTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAat > 1:2632065/1‑91 (MQ=255) tagaaTGGACGACAAAGAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAata < 2:434710/88‑1 (MQ=255) aaaTGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATAtt > 1:2899481/1‑91 (MQ=255) aaaTGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATAtt > 2:1741611/1‑91 (MQ=255) aaaTGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATAtt > 1:3767676/1‑91 (MQ=255) atgctggtcacacaagaacttcaaatattaaaGCCCTCAGAATATGA‑ATTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAatat > 2:1664935‑M1/33‑91 (MQ=255) tGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGa < 1:1708649/91‑1 (MQ=255) tGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGa < 1:817726/91‑1 (MQ=255) ggACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTCATATTTGaa > 1:3712884/1‑91 (MQ=255) gacgacAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAg < 1:2180180/91‑1 (MQ=255) acgacAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGt < 1:968060/91‑1 (MQ=255) cAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCtt > 1:1067623/1‑91 (MQ=255) cAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCtt < 2:2908129/91‑1 (MQ=255) aaTAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgt < 2:1347042/91‑1 (MQ=255) aTAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgtg < 1:3280271/91‑1 (MQ=255) aTAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgtg > 1:294908/1‑91 (MQ=255) tAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgtgt > 2:1626387/1‑91 (MQ=255) tAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgtgt < 2:232107/91‑1 (MQ=255) aGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgtgtg < 2:3166895/91‑1 (MQ=255) aGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgtgtg < 1:197807/91‑1 (MQ=255) aGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgtgtg > 1:2383629/1‑91 (MQ=255) tttATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGAc > 2:3424825/1‑91 (MQ=255) tataACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCa > 1:132051/1‑91 (MQ=255) taACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGc < 2:1321699/91‑1 (MQ=255) taACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGc < 2:2344875/91‑1 (MQ=255) aaCTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCa > 2:3643223/1‑91 (MQ=255) aCTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCAt < 1:1287600/91‑1 (MQ=255) ttAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATcc > 1:923585/1‑91 (MQ=255) aaaaaTGCCCTCAGA‑TAAGC‑CT‑ATCGTTACAAACATTAATTCTTATTATGAAGGCTTTAATATTTGAAGTGATAGTGTGACCATCATCCac > 2:1399182/1‑91 (MQ=255) aaaTGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCacta > 2:2438357/1‑91 (MQ=255) aTGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCactact < 1:1993206/91‑1 (MQ=255) tGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCActacta < 1:254222/91‑1 (MQ=255) GCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGATACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTaa < 1:3601960‑M1/91‑1 (MQ=255) | TTAGTTTTGAAAAACTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA‑TAAGA‑CT‑AAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAA > USA300TCH1516_ALE/2588344‑2588524 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |