| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2830200 | 148 (0.780) | 12 (0.070) | 8/138 | NT | 9.1% | intergenic (+28/+419) | icaC/lipA_2 | putative poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine export protein/Lipase 1 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2830235 | 112 (0.680) | intergenic (+63/+384) | icaC/lipA_2 | putative poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine export protein/Lipase 1 | |||||
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
TTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTA > USA300TCH1516_ALE/2830110‑2830290 | ttCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGT < 1:2714982‑M1/91‑1 (MQ=255)ttCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGT < 2:494101‑M1/91‑1 (MQ=255)cgaaaatatcatttctgtcccactcccattggcatttacgaagtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaaaattAAACACGCGGt > 2:637614‑M1/81‑91 (MQ=255) tCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTg < 1:998285/91‑1 (MQ=255) tataTCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTggg > 1:1054044/1‑91 (MQ=255) atatCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAGAACACGCGGTGGGc > 1:2321963/1‑91 (MQ=255) atatCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGc > 2:544249/1‑91 (MQ=255) tatCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCg < 2:2858103/91‑1 (MQ=255) cTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGaaa < 1:2846981/91‑1 (MQ=255) ttAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATc < 2:970171/91‑1 (MQ=255) atttctgtcccactcccattggcatttacgaagtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATc < 2:2295203‑M1/21‑1 (MQ=255) aGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAg > 2:1128234/1‑91 (MQ=255) aGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTCAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAg > 2:3805258/1‑91 (MQ=255) ggTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGt < 2:2019833/91‑1 (MQ=255) gTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCCATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGtt > 2:2776768/1‑91 (MQ=255) tttATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGttt > 2:178238/1‑91 (MQ=255) tttATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGttt < 2:3238265/91‑1 (MQ=255) tttATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGttt < 2:1578249/91‑1 (MQ=255) tttATTATTGGAAAACAACCACATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGttt < 1:687484/91‑1 (MQ=255) attGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATtg > 2:1480044/1‑91 (MQ=255) ttGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATtga < 2:904144/91‑1 (MQ=255) tGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATtgac < 1:529969/91‑1 (MQ=255) tGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATtgac > 2:229118/1‑91 (MQ=255) ggAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATtgact > 1:3348242/1‑91 (MQ=255) ggAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATtgact > 1:1462125/1‑91 (MQ=255) ggAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATtgact > 1:219439/1‑91 (MQ=255) aaaCAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATtgactgac < 2:2053038/91‑1 (MQ=255) ttggcatttacgaagtttaaatgtgcaattaggatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTgactgact > 1:3299408‑M1/53‑91 (MQ=255) acaacCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGTTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACtt > 2:363489/1‑91 (MQ=255) caacCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTgggcgaagtcagtcaattcaaactgatttc < 1:2281091‑M1/91‑31 (MQ=255) caacCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTc > 1:1617239/1‑91 (MQ=255) aacCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttc < 2:1120882‑M1/91‑32 (MQ=255) acCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAATACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGt > 2:3413010/1‑91 (MQ=255) cATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGttt > 1:2397539/1‑91 (MQ=255) cATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGttt > 1:3808896/1‑91 (MQ=255) cATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGttt > 2:3167170/1‑91 (MQ=255) cATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGttt < 2:3686745/91‑1 (MQ=255) cATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGttt > 1:1727903/1‑91 (MQ=255) cATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGttt > 1:3032233/1‑91 (MQ=255) ttacgaagtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGtttt > 1:1405170‑M1/46‑91 (MQ=255) atatAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGtttt > 1:2683495/1‑91 (MQ=255) tataAGTTGAACATTAATGCTTATTCATTATTAAGCTATATTAAAAACACGCGCTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTa > 1:3603918‑M2/1‑90 (MQ=255) tataAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgccca < 2:194485‑M1/91‑37 (MQ=255) tataAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGttttg > 2:1359134/1‑90 (MQ=255) tataAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTa > 1:1328332‑M2/1‑90 (MQ=255) tataAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTa > 2:2401813‑M2/1‑90 (MQ=255) tataAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTa > 1:1525891‑M2/1‑90 (MQ=255) tacgaagtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTa > 1:2295203‑M1/45‑91 (MQ=255) ataAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccac < 1:621955‑M1/91‑38 (MQ=255) cgaagtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTAcc > 1:2589770‑M1/43‑91 (MQ=255) aaaTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccg > 2:2467431‑M2/1‑87 (MQ=255) aaTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgc < 2:2254902‑M2/91‑6 (MQ=255) aaTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgc < 2:474905‑M2/91‑6 (MQ=255) gtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCgt > 2:755425‑M1/39‑91 (MQ=255) gtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCgt > 2:3822090‑M1/39‑91 (MQ=255) tGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtg > 1:3791503‑M2/1‑83 (MQ=255) gAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgt > 1:3380317‑M2/1‑82 (MQ=255) aaCATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtt < 1:2583690‑M1/91‑46 (MQ=255) aaCATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgtt > 1:89052‑M2/1‑81 (MQ=255) aCATTAATGTGTATTAGTTATTAAGCTATGTTAAATACGCGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGTATTGACTGACGTCGTTTTACCGCGTGttt < 2:2696758/91‑1 (MQ=255) aCATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgttt > 2:2985653‑M2/1‑80 (MQ=255) cATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttt < 1:1510545‑M1/91‑48 (MQ=255) aTTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTaa > 1:979/1‑91 (MQ=255) aTTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTaa > 1:2130278/1‑91 (MQ=255) ttAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAat < 2:1675053/91‑1 (MQ=255) aaTGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAatat < 2:313851/91‑1 (MQ=255) gCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGt > 1:751201/1‑91 (MQ=255) attaattattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTtata > 2:1264666/1‑91 (MQ=255) taattattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttttaacatagcttaa < 1:1748989‑M1/91‑61 (MQ=255) aattattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACat > 1:1444611/1‑91 (MQ=255) attattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACata < 1:1930194/91‑1 (MQ=255) ttattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACatat > 2:1373176/1‑91 (MQ=255) tattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACatata > 1:2643087/1‑91 (MQ=255) tattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACatata > 2:2937313/1‑91 (MQ=255) attaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACatatat < 1:592938/91‑1 (MQ=255) taaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTc > 2:3568543/1‑91 (MQ=255) aaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCt > 1:1830166/1‑91 (MQ=255) gCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTaa > 2:2162086/1‑91 (MQ=255) cTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgttt < 1:2334964‑M2/66‑12 (MQ=255) cTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAAt > 1:1272494/1‑91 (MQ=255) tGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGc > 1:1148092/1‑91 (MQ=255) gTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATCTTCTAATTGca > 1:3517380/1‑91 (MQ=255) tAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGcaca > 2:1179997/1‑91 (MQ=255) aaaaCACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAtt > 1:417299/1‑91 (MQ=255) aaaCACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttttaacatag < 1:2334801‑M1/66‑56 (MQ=255) aaaCACGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttttaacatag > 2:2334964‑M1/1‑11 (MQ=255) AAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAttt < 1:3703425‑M1/91‑1 (MQ=255) AAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAttt > 2:1115175‑M1/1‑91 (MQ=255) AAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAttt > 2:2643981‑M1/1‑91 (MQ=255) AAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAttt > 1:438207‑M1/1‑91 (MQ=255) cacGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgattttgcccaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttca > 2:3872502‑M1/1‑8 (MQ=255) cacGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttca > 1:2981846‑M1/1‑8 (MQ=255) cacGCGGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttca > 1:3791266‑M1/1‑8 (MQ=255) CGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACt < 1:3188622‑M1/91‑1 (MQ=255) CGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGGTATACAGATATTCTAATTGCACATTTAAACt > 1:2301031‑M1/1‑91 (MQ=255) gcgGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcaatt < 2:3825193‑M1/91‑87 (MQ=255) GCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACtt < 2:403604‑M1/91‑1 (MQ=255) GCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACtt > 2:1774881‑M1/1‑91 (MQ=255) cgGTaaaacgaagtcagtcaattcaaactgatttcgcccaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcaattt > 1:40230‑M1/1‑4 (MQ=255) TGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTa > 2:1314335‑M1/1‑91 (MQ=255) | TTCTATATCTTTAGGTTTATTATTGGAAAACAACCATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTA > USA300TCH1516_ALE/2830110‑2830290 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |