| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2830200 | 148 (0.780) | 12 (0.070) | 8/138 | NT | 9.1% | intergenic (+28/+419) | icaC/lipA_2 | putative poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine export protein/Lipase 1 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2830235 | 112 (0.680) | intergenic (+63/+384) | icaC/lipA_2 | putative poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine export protein/Lipase 1 | |||||
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
ATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTC > USA300TCH1516_ALE/2830145‑2830325 | atatAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGtttt > 1:2683557/1‑91 (MQ=255) tataAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGttttg > 2:1359089/1‑90 (MQ=255) tataAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTa > 2:2401813‑M2/1‑90 (MQ=255) tataAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTa > 1:1525891‑M2/1‑90 (MQ=255) tacgaagtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTa > 1:2295203‑M1/45‑91 (MQ=255) cgaagtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTAcc > 1:2589804‑M1/43‑91 (MQ=255) cgaagtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTAcc > 1:3387296‑M1/43‑91 (MQ=255) cgaagtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTAcc > 1:2589744‑M1/43‑91 (MQ=255) cgaagtttaaatgggcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTAcc > 1:2335633‑M1/43‑91 (MQ=255) aaaTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccg > 2:2467431‑M2/1‑87 (MQ=255) aaaTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccg > 1:40230‑M2/1‑87 (MQ=255) aaTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgc < 2:3825193‑M2/91‑6 (MQ=255) aaTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgc < 2:2254902‑M2/91‑6 (MQ=255) aaTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgc < 2:474905‑M2/91‑6 (MQ=255) aTTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcg > 1:2291108‑M2/1‑85 (MQ=255) gtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCgt > 2:3822090‑M1/39‑91 (MQ=255) gtttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCgt > 2:755425‑M1/39‑91 (MQ=255) tttaaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCgtg > 1:3661495‑M1/38‑91 (MQ=255) tGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtg > 1:2981846‑M2/1‑83 (MQ=255) tGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtg > 1:3791503‑M2/1‑83 (MQ=255) taaatgtgcaattagaatatatgtataacaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGtt > 1:1488568‑M1/36‑91 (MQ=255) aCATTAATGTGTATTAGTTATTAAGCTATGTTAAATACGCGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGTATTGACTGACGTCGTTTTACCGCGTGttt < 2:2696758/91‑1 (MQ=255) aCATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgttt < 2:1571330‑M2/91‑12 (MQ=255) aCATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgttt > 2:2985653‑M2/1‑80 (MQ=255) aaggtgcatttagaatatatgtatactaatattAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGACTTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTa > 2:3369472‑M1/34‑91 (MQ=255) aTTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTaa < 1:209554/91‑1 (MQ=255) aTTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTaa > 2:1119043/1‑91 (MQ=255) tAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAata > 1:2812052/1‑91 (MQ=255) gCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGt > 1:751201/1‑91 (MQ=255) gCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGt > 2:2023667/1‑91 (MQ=255) tattaattattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTtat > 1:978687/1‑91 (MQ=255) ttaattattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATAc > 2:1285804/1‑91 (MQ=255) aattattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACat > 1:1444611/1‑91 (MQ=255) ttattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACatat > 2:1373176/1‑91 (MQ=255) ttattaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACatat > 2:917769/1‑91 (MQ=255) attaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACatatat > 2:2919506/1‑91 (MQ=255) attaaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACatatat < 1:592938/91‑1 (MQ=255) taaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTc > 2:3568543/1‑91 (MQ=255) taaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTc > 2:3568699/1‑91 (MQ=255) aaGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCt > 1:3341120/1‑91 (MQ=255) aGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTa > 2:3808926/1‑91 (MQ=255) gCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTaa < 1:1725823/91‑1 (MQ=255) gCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTaa > 2:624359/1‑91 (MQ=255) cTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgttt > 2:2334801‑M2/1‑55 (MQ=255) cTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgttt < 1:2334801‑M2/66‑12 (MQ=255) cTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAAt > 1:1272494/1‑91 (MQ=255) tGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGc < 2:3204521/91‑1 (MQ=255) tGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGc < 1:990675/91‑1 (MQ=255) tGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGc > 1:1148092/1‑91 (MQ=255) tGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGc < 1:1080039/91‑1 (MQ=255) gTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATCTTCTAATTGca > 1:3517380/1‑91 (MQ=255) ttAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGcac < 1:614830/91‑1 (MQ=255) tAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGcaca < 2:2800343/91‑1 (MQ=255) aaaaaCACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAt < 1:525778/91‑1 (MQ=255) aaaaCACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAtt > 1:417299/1‑91 (MQ=255) aaaaCACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAtt < 1:1248888/91‑1 (MQ=255) AAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAttt < 1:3703425‑M1/91‑1 (MQ=255) AAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAttt > 1:178238‑M1/1‑91 (MQ=255) AAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAttt > 2:2643981‑M1/1‑91 (MQ=255) AAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACAttt > 2:1115175‑M1/1‑91 (MQ=255) AACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTa < 1:435142‑M1/91‑1 (MQ=255) CGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACt > 2:1148092‑M1/1‑91 (MQ=255) CGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACt > 1:2299145‑M1/1‑91 (MQ=255) CGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACt < 1:1295101‑M1/91‑1 (MQ=255) CGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGGTATACAGATATTCTAATTGCACATTTAAACt > 1:2301031‑M1/1‑91 (MQ=255) GCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACtt > 1:2225190‑M1/1‑91 (MQ=255) GCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACtt > 2:1774881‑M1/1‑91 (MQ=255) GCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACtt < 2:403604‑M1/91‑1 (MQ=255) ggTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcaattta < 2:2111584‑M2/91‑54 (MQ=255) tGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcaatttata < 2:194485‑M2/91‑56 (MQ=255) gggCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTaa > 2:836731/1‑91 (MQ=255) ggCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTaaa < 2:1591856/91‑1 (MQ=255) ggCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTaaa < 2:391197/91‑1 (MQ=255) gAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTaccgcgtgtttttaacatagcttaataattaatacgcattaatgttcaatttatatggtt < 2:1121718‑M2/91‑61 (MQ=255) aTCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCaa > 1:1615940/1‑91 (MQ=255) aTCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCaa < 1:3186907/91‑1 (MQ=255) aTCAGTTTGAATTGACTGACTTCGCCCccgcgtgtttttaacatagcttaataattaataagcattaatgttcaatttatatggttgttt < 2:713168‑M2/91‑64 (MQ=255) aGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATgg < 1:1528367/91‑1 (MQ=255) tttGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGa < 1:3203590/91‑1 (MQ=255) tttGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGa < 2:3089332/91‑1 (MQ=255) tGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGt < 1:2004842/91‑1 (MQ=255) aaTTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTgg > 1:1668725/1‑91 (MQ=255) aTTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTggg > 1:2109971/1‑91 (MQ=255) aTTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTggg < 1:1929551/91‑1 (MQ=255) aTTGACTCACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTggg < 1:1930685/91‑1 (MQ=255) actgactTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAg > 2:799293/1‑91 (MQ=255) actgactTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAg > 1:3595280/1‑91 (MQ=255) tgactTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGaa > 1:2141146/1‑91 (MQ=255) tgactTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGaa > 1:2937404/1‑91 (MQ=255) tgactTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGaa > 1:3119544/1‑91 (MQ=255) gactTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGaaa > 2:513827/1‑91 (MQ=255) actTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAAt < 2:3315440/91‑1 (MQ=255) ctTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATg > 1:140277/1‑91 (MQ=255) ctTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATg < 2:1687249/91‑1 (MQ=255) ttCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGa > 2:3450913/1‑91 (MQ=255) ttCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGa > 1:2756248/1‑91 (MQ=255) cGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGata < 1:2532818/91‑1 (MQ=255) gTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGatat > 1:2667711/1‑91 (MQ=255) tttACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATAttt < 1:3805258/91‑1 (MQ=255) tACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTc > 2:3410495/1‑91 (MQ=255) | ATATAAATTGAACATTAATGCTTATTAATTATTAAGCTATGTTAAAAACACGCGGTGGGCGAAATCAGTTTGAATTGACTGACTTCGTTTTACCGCGTGTTTAATATTGTTATACATATATTCTAATTGCACATTTAAACTTCGTAAATGCCAATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTC > USA300TCH1516_ALE/2830145‑2830325 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |