New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1072018 = | 174 (0.910) | 11 (0.070) | 6/126 | NT | 7.7% | intergenic (‑490/+315) | USA300HOU_RS05290/folD | Pesticidal crystal protein Cry22Aa/Bifunctional protein FolD protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 1072073 = | 129 (0.860) | intergenic (‑545/+260) | USA300HOU_RS05290/folD | Pesticidal crystal protein Cry22Aa/Bifunctional protein FolD protein |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
GTCTATATAAAATTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAGT > USA300TCH1516_ALE/1071984‑1072162 | gTCTATATAAAATTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGa < 2:1435563/91‑1 (MQ=255) gTCTATATAAAATTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGa < 1:3828868/91‑1 (MQ=255) tatataAAATTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCg > 2:2017297/1‑91 (MQ=255) atataAAATTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGa < 2:3462438/91‑1 (MQ=255) tataAAATTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGCTCGAt > 2:3146380/1‑91 (MQ=255) tataAAATTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGAt > 2:2115223/1‑91 (MQ=255) tataAAATTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGAt < 1:109357/91‑1 (MQ=255) ataAAATTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGAtt > 1:2439490/1‑91 (MQ=255) taAAATTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTa > 2:1187365/1‑91 (MQ=255) aaaTTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAAt > 1:3206588/1‑91 (MQ=255) aaaTTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAAt > 1:2930542/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATg > 2:908623/1‑91 (MQ=255) gttgAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTccc < 1:462289/91‑1 (MQ=255) ttgAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCa < 2:3803928/91‑1 (MQ=255) tgAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAg > 1:1136582/1‑91 (MQ=255) tgAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAg > 1:373706/1‑91 (MQ=255) gAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTACCTTCAAAGCCTTCATTTCTTCAATTTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGa < 2:3606525/91‑1 (MQ=37) aGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGAt > 2:2965868/1‑91 (MQ=255) gCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGAtt > 1:202873/1‑91 (MQ=255) gCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGAtt < 1:2381147/91‑1 (MQ=255) agaaCAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGGTTTTTc > 1:765265/4‑91 (MQ=255) gTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCt > 1:642669/1‑91 (MQ=255) tACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCtt < 1:3723218/91‑1 (MQ=255) aCAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGGTCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTg < 2:2212293/91‑1 (MQ=255) cAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGt > 1:559171/1‑91 (MQ=255) cAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGACTTTTCTTGt < 1:1955963/91‑1 (MQ=255) aaaGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGtt > 1:2613234/1‑91 (MQ=255) aaGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTa > 2:2292988/1‑91 (MQ=255) aaGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTa > 1:2807062/1‑91 (MQ=255) aaGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTa > 1:2152072/1‑91 (MQ=255) aaGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTa > 1:1380831/1‑91 (MQ=255) aaGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAACGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTa > 1:3267737/1‑91 (MQ=255) aGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTAt < 2:391926/91‑1 (MQ=255) aGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTAt > 1:2998325/1‑91 (MQ=255) gTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTAtt > 1:2226192/1‑91 (MQ=255) gTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTAtt > 2:2974237/1‑91 (MQ=255) gTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTAtt > 2:1467097/1‑91 (MQ=255) gTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTAtt > 2:1387627/1‑91 (MQ=255) tGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTc > 1:1421604/1‑91 (MQ=255) gAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTg > 1:867600/1‑57 (MQ=255) gAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTg < 2:867600/57‑1 (MQ=255) TGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCattgc < 2:2261350‑M1/91‑1 (MQ=255) TGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCattgc < 1:91271‑M1/91‑1 (MQ=255) TGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCattgc < 1:2178762‑M1/91‑1 (MQ=255) GCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCattgca > 1:1812103‑M1/1‑91 (MQ=255) CTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCattgcaa < 1:1597362‑M1/91‑1 (MQ=255) CTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCattgcaattgc > 1:2550039‑M1/1‑91 (MQ=255) CTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCattgcaattgc > 2:3745993‑M1/1‑91 (MQ=255) CTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCattgcaattgc > 2:655036‑M1/1‑91 (MQ=255) ttcaaagtagacattgaataaatgaaggctttgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCattgcaattgca > 1:3429281‑M2/46‑91 (MQ=255) TTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTAttcattgcaattaca < 2:1300427‑M1/91‑4 (MQ=255) TTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCattgcaattgca < 1:2899188‑M1/91‑1 (MQ=255) TCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCAttgcaattgcaa < 2:1383437‑M1/91‑1 (MQ=255) TCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCAttgcaattgcaa < 1:2733214‑M1/91‑1 (MQ=255) caaagtagacattgaataaatgaaggctttgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCaaa > 2:3325620‑M2/44‑91 (MQ=255) AAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCaaaa < 1:514899‑M1/91‑1 (MQ=255) AAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAaat > 1:3659092‑M1/1‑91 (MQ=255) agtagacattgaataaatgaaggctttgaagggagcatttGATTGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAaata > 2:2989228‑M2/41‑91 (MQ=255) agtagacattgaataaatgaaggctttgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAaata > 1:2710835‑M2/41‑91 (MQ=255) AGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAaata > 2:1226656‑M1/1‑91 (MQ=255) gtagacattgaataaatgaaggctttgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAaataa > 2:2565243‑M2/40‑91 (MQ=255) gtagacattgaataaatgaaggctttgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAaataa > 1:683668‑M2/40‑91 (MQ=255) tagacattgaataaatgaaggctttgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAaataat > 1:2257493‑M2/39‑91 (MQ=255) ccTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAaataat > 2:3285210/1‑91 (MQ=255) ccTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAaataat > 1:1273734/1‑91 (MQ=255) ccTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAaataat < 1:3368998/91‑1 (MQ=255) ccTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAaataat > 2:2661496/1‑91 (MQ=255) cTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAataata > 2:2788473/1‑91 (MQ=255) ttCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAatat < 2:739030/91‑1 (MQ=255) cATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCGAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATAttt > 2:3417373/1‑91 (MQ=255) aTTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTa > 2:1001306/1‑91 (MQ=255) tttATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTaa > 1:3599072/1‑91 (MQ=255) ttATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAAt > 1:149945/1‑91 (MQ=255) ttATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAAt < 2:2099175/91‑1 (MQ=255) ttATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAAt > 1:3803901/1‑91 (MQ=255) tATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAAtg > 2:2488298/1‑91 (MQ=255) tATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAAtg > 1:186477/1‑91 (MQ=255) aTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAAtgt < 2:1645060/91‑1 (MQ=255) tCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCACTTGCAAAATAATATTTAATGTgg > 1:1724285/1‑91 (MQ=255) cAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTggg > 2:1760411/1‑91 (MQ=255) cAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTggg > 1:822867/1‑91 (MQ=255) aTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGtt < 2:1570786/91‑1 (MQ=255) tGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTa > 2:3575868/1‑91 (MQ=255) aCTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGa < 1:1387627/91‑1 (MQ=255) ctttgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGAc < 2:729419‑M2/74‑1 (MQ=255) tttgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACt < 1:1107982‑M2/75‑1 (MQ=255) tttgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACt > 2:686440‑M2/17‑91 (MQ=255) ttgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACtt < 1:3089762‑M2/76‑1 (MQ=255) tgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACttt > 1:2943533‑M2/15‑91 (MQ=255) tgaagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACttt > 2:253697‑M2/15‑91 (MQ=255) aagggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTttat < 2:489521‑M2/79‑1 (MQ=255) agggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTttatt > 2:2239925‑M2/12‑91 (MQ=255) ggagcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGactttataaa < 2:1823025‑M2/82‑4 (MQ=255) agcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATAttt < 2:2062468‑M2/57‑1 (MQ=255) agcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTaaaa > 2:1901802‑M2/8‑91 (MQ=255) agcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTaaaa < 2:3771577‑M2/84‑1 (MQ=255) agcatttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTaaaa > 2:3027651‑M2/8‑91 (MQ=255) catttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACt > 2:2510871‑M2/6‑91 (MQ=255) tttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCa < 1:1665827‑M2/88‑1 (MQ=255) ttGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAg > 2:1720616‑M2/3‑91 (MQ=255) | GTCTATATAAAATTGTTGAGCCAAGTACAAAGTGAAATGCTCCCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAGT > USA300TCH1516_ALE/1071984‑1072162 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |