| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1114106 | 137 (0.720) | 17 (0.110) | 11/126 | NT | 13.8% | intergenic (+35/+47) | USA300HOU_RS05510/mntH_1 | hypothetical protein/Divalent metal cation transporter MntH |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1114131 | 104 (0.700) | intergenic (+60/+22) | USA300HOU_RS05510/mntH_1 | hypothetical protein/Divalent metal cation transporter MntH | |||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
CATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAG > USA300TCH1516_ALE/1114042‑1114221 | cATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCa < 2:391436‑M2/91‑2 (MQ=255) aTAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaa < 1:3845283‑M2/91‑3 (MQ=255) tctatttaatcgttcaaacattccaagaactacaaagttaaaaatAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACa > 1:882913‑M1/46‑91 (MQ=255) aaGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaaca < 2:1873259‑M2/91‑5 (MQ=255) aGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacat < 1:1835326‑M2/91‑6 (MQ=255) atttaatcgttcaaacattccaagaactacaaagttaaaaatAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACAttt > 2:2423032‑M1/43‑91 (MQ=255) aCGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacatttt > 1:548319‑M2/1‑83 (MQ=255) ttaatcgttcaaacattccaagaactacaaagttaaaaatAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTa > 2:2358117‑M1/41‑91 (MQ=255) cGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacatttta < 2:3762838‑M2/91‑10 (MQ=255) gATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaa > 2:1428977‑M2/1‑81 (MQ=255) aTGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaat < 1:2189346‑M2/91‑12 (MQ=255) tGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacagtttaatg < 2:3447385‑M2/91‑13 (MQ=255) aGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggt < 2:2617647‑M2/91‑15 (MQ=255) gttcaaacattccaagaactacaaagttaaaaatAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTAAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGtt > 2:1657841‑M1/35‑91 (MQ=255) gTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggtt < 1:921816‑M2/91‑16 (MQ=255) gTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggtt < 2:1993652‑M2/91‑16 (MQ=255) ttcaaacattccaagaactacaaagttaaaaatAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGttt > 1:702538‑M1/34‑91 (MQ=255) ttcaaacattccaagaactacaaagttaaaaatAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGttt > 2:2746260‑M1/34‑91 (MQ=255) tataTTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggttt > 2:3728176‑M2/1‑75 (MQ=255) tataTTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggttt > 1:2219970‑M2/1‑75 (MQ=255) atTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAt > 2:1932914/1‑91 (MQ=255) ttATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAttt < 1:1737818/91‑1 (MQ=255) ttATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAttt > 2:1313893/1‑91 (MQ=255) ttATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAttt > 2:2883173/1‑91 (MQ=255) cATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTaa > 1:48872/1‑91 (MQ=255) tAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACtt > 1:2442082/1‑91 (MQ=255) tAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACtt > 1:2882334/1‑91 (MQ=255) aaTATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACttt < 2:280542/91‑1 (MQ=255) atatGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTg < 2:281348/91‑1 (MQ=255) atatGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTg < 2:3014089/91‑1 (MQ=255) atatGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTg < 2:419322/91‑1 (MQ=255) atatGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTg < 2:3865932/91‑1 (MQ=255) tatGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGt < 1:1433163/91‑1 (MQ=255) tGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGCTTTATTTTTAACTTTGTAg > 1:1630972/1‑91 (MQ=255) gTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACTACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGt < 1:3272791/91‑1 (MQ=255) gTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGt < 1:3508917/91‑1 (MQ=255) gTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGt > 1:626251/1‑91 (MQ=255) ttCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGtt > 2:838201/1‑91 (MQ=255) tCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTc > 1:271001/1‑91 (MQ=255) cATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCt < 1:3843996/91‑1 (MQ=255) cATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCt < 2:3281843/91‑1 (MQ=255) cATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCt < 1:3320395/91‑1 (MQ=255) gCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGa > 1:3564716/1‑91 (MQ=255) gCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGa < 1:2099231/91‑1 (MQ=255) aaaGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATg > 1:3721356/1‑91 (MQ=255) aaaGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATg < 1:2146090/91‑1 (MQ=255) aaaGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATg > 2:3795058/1‑91 (MQ=255) aaaGAAAAACCACTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATg > 1:2988713/1‑91 (MQ=255) aGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGaa > 2:906568/1‑87 (MQ=255) aGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGtt < 1:2361498/91‑1 (MQ=255) aaaaaCCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTg > 1:1035023/1‑91 (MQ=255) AAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTTACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGaa > 2:3182135‑M1/1‑91 (MQ=255) AAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGaa < 2:3423292‑M1/91‑1 (MQ=255) AACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAAc < 2:1197774‑M1/91‑1 (MQ=255) AACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAAc < 2:3173472‑M1/91‑1 (MQ=255) AACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAAc > 1:1431389‑M1/1‑91 (MQ=255) AACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAAc < 2:1400982‑M1/91‑1 (MQ=255) AACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAAc < 1:3578102‑M1/91‑1 (MQ=255) aCCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggtttttcttttgctatgaacatattaatgataaatatact < 2:218395‑M2/91‑53 (MQ=255) ACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGt < 1:1289484‑M1/84‑1 (MQ=255) ACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACg > 2:809910‑M1/1‑91 (MQ=255) ACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACg > 1:1463771‑M1/1‑91 (MQ=255) cATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggtttttcttttgctatgaacatattaatgataaatatactca < 1:2743089‑M2/91‑55 (MQ=255) cATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggtttttcttttgctatgaacatattaatgataaatatactca < 1:281851‑M2/91‑55 (MQ=255) CATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGAt > 2:710522‑M1/1‑91 (MQ=255) aTTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggtttttcttttgctatgaacatattaatgataaatatactcat < 2:1094726‑M2/91‑56 (MQ=255) ATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGAtt > 2:1946705‑M1/1‑91 (MQ=255) ttAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggtttttcttttgctatgaacatattaatgataaatatactcatc < 1:229962‑M2/91‑57 (MQ=255) ttAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggtttttcttttgctatgaacatattaatgataaatatactcatc < 1:230623‑M2/91‑57 (MQ=255) ATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAg > 1:845632‑M1/1‑91 (MQ=255) ATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAg < 1:3468786‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGa > 2:640168‑M1/1‑91 (MQ=255) TGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGa > 2:3103264‑M1/1‑91 (MQ=255) TTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGacc < 2:387444‑M1/91‑2 (MQ=255) TTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACa < 2:595421‑M1/91‑1 (MQ=255) aaGTTGTTAATTATTAGATACAACCaacattttaatggtttttcttttgctatgaacatattaatgataaatatactcatcgtccttatgt < 1:3147130‑M2/91‑67 (MQ=255) aaGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAtt < 1:1897816/91‑1 (MQ=255) aaGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAtt < 2:543891/91‑1 (MQ=255) tttgttAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTa < 2:3319924/90‑1 (MQ=255) gttgttAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTa < 1:1002146/91‑1 (MQ=255) gttgttAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTa < 2:1531798/91‑1 (MQ=255) ttgttAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTaa > 2:1307066/1‑91 (MQ=255) tgttAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTaaa > 2:114644/1‑91 (MQ=255) tAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATa > 1:3649112/1‑91 (MQ=255) attattAGATACAACCaacattttaatggtttttcttttgctatgaacatattaatgataaatatactcatcgtccttatgtgttgtttct < 1:911693‑M2/91‑76 (MQ=255) attaGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAg > 1:2416721/1‑91 (MQ=255) taGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaa < 2:1246966/91‑1 (MQ=255) aGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaat < 1:1903497/91‑1 (MQ=255) aTACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaataa > 2:3641644/1‑91 (MQ=255) tACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaataat > 1:1789765/1‑91 (MQ=255) tACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaataat > 1:1180403/1‑91 (MQ=255) tACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaa < 2:1541339/87‑1 (MQ=255) tACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaa > 1:1541339/1‑87 (MQ=255) caaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaataataa < 2:2532470/91‑1 (MQ=255) aaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaataataat > 1:1987303/1‑91 (MQ=255) aaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaataataat > 2:1585073/1‑91 (MQ=255) accaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAt < 2:948722/68‑1 (MQ=255) accaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAt > 1:948784/1‑68 (MQ=255) ccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAAtaataataa < 1:3431229/91‑1 (MQ=255) caacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAg < 1:2532727/91‑1 (MQ=255) | CATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAG > USA300TCH1516_ALE/1114042‑1114221 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |