New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1182690 = | 233 (1.220) | 18 (0.110) | 10/136 | NT | 8.7% | intergenic (+20/‑113) | USA300HOU_RS05900/yfnB | Antibacterial protein 3/Putative HAD‑hydrolase YfnB |
? | USA300TCH1516_ALE | 1182741 = | 179 (1.110) | intergenic (+71/‑62) | USA300HOU_RS05900/yfnB | Antibacterial protein 3/Putative HAD‑hydrolase YfnB |
Only 100 of 315 total aligned reads displayed.
GTAAATTATTTGGATTCTAATATAATAACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACATAGACAATATAGGAGATGGGGAAATTGGGATATAAAAATATTTTGATAGACTT > USA300TCH1516_ALE/1182651‑1182831 | gTAAATTATTTGGATTCTAATATAATAACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGtttattttat > 2:2357633/1‑91 (MQ=255) tgtatctaaatcttaacagaggctcaaatttctgcaaaTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTttattttatt > 2:279288‑M1/39‑91 (MQ=255) tatctaaatcttaacagaggctcaaatttctgcaaaTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTg > 2:1442606‑M1/37‑91 (MQ=255) aaTTATTTGGATTCTAATATAATAACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTg > 1:2771185/1‑91 (MQ=255) attattTGGATTCTAATATAATAACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGc > 2:3444558/1‑91 (MQ=255) ttattTGGATTCTAATATAATAACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCa < 2:454426/91‑1 (MQ=255) tattTGGATTCTAATATAATAACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAg > 1:1964390/1‑91 (MQ=255) ttGGATTCTAATATAATAACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGaaa > 2:3819406/1‑91 (MQ=255) aTTCTAATATAATAACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTg > 1:1623870/1‑91 (MQ=255) ttCTAATATAATAACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTAAGTTTATTTTCTTTGCATAAATTTGa > 2:3364413/1‑91 (MQ=255) aacagaggctcaaatttctgcaaaTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAg > 1:2157891‑M1/25‑91 (MQ=255) cTAATATAATAACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGc < 2:2474737/91‑1 (MQ=255) aatataataACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCct < 1:3506245/91‑1 (MQ=255) tataataACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAg > 2:526694/1‑77 (MQ=255) tataataACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCctct < 1:381601/91‑1 (MQ=255) ataataACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTg > 1:541523/1‑91 (MQ=255) ataataACTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTg > 1:1440631/1‑91 (MQ=255) taataaCTAATATTCTTTAAAATTAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGt < 2:3033335/91‑1 (MQ=255) taataaCTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGt < 1:671509/91‑1 (MQ=255) ctcaaatttctgcaaataaaataaactgagtgcataacattaaagtatgctcacccagtttattttaTTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGtt > 1:2158254‑M2/68‑91 (MQ=255) aataaCTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGtt > 2:2762584/1‑91 (MQ=255) aataaCTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGtt < 1:2431841/91‑1 (MQ=255) aataaCTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGtt < 1:469720/91‑1 (MQ=255) ataaCTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTa < 2:834192/91‑1 (MQ=255) ataaCTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTa < 2:1289635/91‑1 (MQ=255) aaCTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAg > 2:3162865/1‑91 (MQ=255) aaCTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAg > 1:860658/1‑91 (MQ=255) aCTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGa < 1:801637/91‑1 (MQ=255) cTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGAt < 1:2214778/91‑1 (MQ=255) cTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGAt < 2:194401/91‑1 (MQ=255) cTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGAt < 2:2183331/91‑1 (MQ=255) cTAATATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATCTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGAt > 2:3192569/1‑91 (MQ=255) aaTATTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTaa < 2:2600335/86‑1 (MQ=255) tatTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAg > 1:2257379/1‑91 (MQ=255) tgcaaataaaataaactgagtgcataacattaaagtatgctcacccagtttattttaTTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGa > 2:766849‑M2/58‑91 (MQ=255) atTCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCGTCTGTTAAGATTTAGa > 2:3718401/1‑91 (MQ=255) ttCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGAt < 2:408651/91‑1 (MQ=255) tCTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATa > 1:2347923/1‑91 (MQ=255) caaataaaataaactgagtgcataacattaaagtatgctcacccagtttattttaTTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATa > 2:1443145‑M2/56‑91 (MQ=255) cTTTAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATAc < 2:1231670/91‑1 (MQ=255) tttAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACa > 1:1879918/1‑91 (MQ=255) tttAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACa > 1:2665192/1‑91 (MQ=255) aataaaataaactgagtgcataacattaaagtatgctcacccagtttattttaTTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACa > 2:279358‑M2/54‑91 (MQ=255) ttAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACAt < 2:3310452/91‑1 (MQ=255) ttAAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACAt < 2:642853/91‑1 (MQ=255) AAAATAAACTGGGTGAGCATACTTTCATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACATAg > 1:3599757‑M1/1‑91 (MQ=255) AAATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACATAGa < 2:1374134‑M1/91‑1 (MQ=255) AATAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACATAGAc < 1:3283377‑M1/91‑1 (MQ=255) taaaatgagtgcataacattaaagtatgctcacccagtttattttaTTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACATAGACaa > 1:3067707‑M2/47‑91 (MQ=255) TAAACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACATAGACaa < 2:907929‑M1/91‑1 (MQ=255) AACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACATAGACAata < 2:3656596‑M1/91‑1 (MQ=255) AACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACATAGACAata < 1:2705328‑M1/91‑1 (MQ=255) AACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACATAGACAata < 1:3012786‑M1/91‑1 (MQ=255) AACTGGGTGAGCATACTTTAATGTTATGCACTCAGTTTATTTTATTTGCAGAAATTTGAGCCTCTGTTAAGATTTAGATACATAGACAata > 2:1995050‑M1/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |