New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1392266 = | 136 (0.710) | 19 (0.110) | 9/140 | NT | 12.9% | intergenic (+40/‑460) | alsT/glcT | Amino‑acid carrier protein AlsT/GlcA/glcB genes antiterminator |
? | USA300TCH1516_ALE | 1392308 = | 137 (0.820) | intergenic (+82/‑418) | alsT/glcT | Amino‑acid carrier protein AlsT/GlcA/glcB genes antiterminator |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGATTTATTTCC > USA300TCH1516_ALE/1392218‑1392398 | ttagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGtttt > 2:2434222‑M1/49‑91 (MQ=255) tagattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTa > 2:2816150‑M1/48‑91 (MQ=255) agattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaaaaccctgagattttcgctttaatttgaaaacctcagggtttTaa > 2:2064008‑M2/89‑91 (MQ=255) agattaactagtgtaatgatacagatgataattgagtacaaatttaaaaccctgagattttcgctttaatttgaaaacctcagggtttTaa > 2:2064002‑M2/89‑91 (MQ=255) ataaataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAAtt > 2:1743479/1‑91 (MQ=255) taaataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAAttt > 2:1467133/1‑91 (MQ=255) taaataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAAttt < 2:2177575/91‑1 (MQ=255) taaataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAAttt > 2:2453753/1‑91 (MQ=255) taaataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAAttt > 1:1646902/1‑91 (MQ=255) taaataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAAttt > 1:2649870/1‑91 (MQ=255) aataTTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGt > 1:3570200/1‑91 (MQ=255) atatTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTa < 1:3115398/91‑1 (MQ=255) atatTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAAGCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTa < 1:2954687/91‑1 (MQ=255) tatTTTTAATGTAACGTTTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTGAAGCGAAAATCTCAGGGATTTAAATTTGTAc < 2:3545072/91‑1 (MQ=255) tatTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTAc > 1:416444/1‑91 (MQ=255) tatTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTAc < 1:2746491/91‑1 (MQ=255) tatTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTAc < 2:2390246/91‑1 (MQ=255) atTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAGATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACt < 1:3110079/91‑1 (MQ=255) tttttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTc > 1:2423134/1‑91 (MQ=255) ttttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCa > 2:1094919/1‑91 (MQ=255) tttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCaa > 1:2643075/1‑91 (MQ=255) tttAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCaa > 2:542801/1‑91 (MQ=255) tAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAAtt < 1:1751292/91‑1 (MQ=255) tAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAAtt > 2:283425/1‑91 (MQ=255) aaTGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTa > 1:1160410/1‑91 (MQ=255) tGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTatc < 1:1678131/91‑1 (MQ=255) tGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTatc > 1:155337/1‑91 (MQ=255) gTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTatca < 1:831528/91‑1 (MQ=255) tAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTatcat < 1:989365/91‑1 (MQ=255) aaCGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTatcatc > 1:3818683/1‑91 (MQ=255) cGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTg < 2:3650305/91‑1 (MQ=255) gATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGt < 1:3232430/91‑1 (MQ=255) ttCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTAt < 2:2591659/91‑1 (MQ=255) cATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCGATTATCATCTGTATCa < 1:1498483/91‑1 (MQ=255) cATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCa > 2:788039/1‑91 (MQ=255) cATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCa > 2:921690/1‑91 (MQ=255) aTTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCAt > 1:2912186/1‑91 (MQ=255) aTTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCAt > 2:2430898/1‑91 (MQ=255) ttATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCAtt > 1:3475294/1‑91 (MQ=255) tatataAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTa > 2:1555491/1‑91 (MQ=255) atataAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTac < 2:2169302/91‑1 (MQ=255) tataAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTaca < 1:2195270/91‑1 (MQ=255) taAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACt > 1:1538610/1‑91 (MQ=255) aaaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAg < 2:3107335/91‑1 (MQ=255) aaaTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGt > 2:1695492/1‑91 (MQ=255) aTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAACTCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTa > 1:3258696/1‑91 (MQ=255) aTCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTa < 1:2156310/91‑1 (MQ=255) cAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAAt < 1:1070006/91‑1 (MQ=255) aaaTAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATGTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATc < 2:3831793/91‑1 (MQ=255) aaaTAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATc > 1:2693257/1‑91 (MQ=255) aaTAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCt < 1:2620440/91‑1 (MQ=255) taaaaccctgagattttcgctttaatttgaaaacctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTa > 2:1794681‑M2/45‑91 (MQ=255) taaaaccctgagattttcgctttaatttgaaaacctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTa > 1:1911442‑M2/45‑91 (MQ=255) tAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTaa > 2:85116/1‑91 (MQ=255) tAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATCATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTaa > 1:2070070/1‑91 (MQ=255) AAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAg > 2:3408739‑M1/1‑91 (MQ=255) AAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAg > 2:1061985‑M1/1‑91 (MQ=255) AACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGa > 2:3716895‑M1/1‑91 (MQ=255) accctgagattttcgctttaatttgaaaacctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGAt > 1:217227‑M2/41‑91 (MQ=255) CCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGAtt > 1:1424564‑M1/1‑91 (MQ=255) cctgagattttcgctttaatttgaaaacctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGAttt > 2:3393814‑M2/39‑91 (MQ=255) tcagGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTg < 1:1024363‑M1/87‑1 (MQ=255) ctgagattttcgctttaatttgaaaacctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTg > 1:122746‑M2/38‑91 (MQ=255) ctgagattttcgctttaatttgaaaacctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTg > 1:509558‑M2/38‑91 (MQ=255) CTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTg < 2:722777‑M1/91‑1 (MQ=255) CTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTg < 1:2825490‑M1/91‑1 (MQ=255) gagattttcgctttaatttgaaaacctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGAt > 1:2337114‑M2/36‑91 (MQ=255) GGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTa < 1:2975207‑M1/91‑1 (MQ=255) GGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTa > 1:1999403‑M1/1‑91 (MQ=255) GGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTa > 2:2643075‑M1/1‑91 (MQ=255) gTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATtat > 2:60927/1‑91 (MQ=255) ttCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGCTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGACTTGATtatata > 1:577231/1‑91 (MQ=255) tCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTatatat > 1:658993/1‑91 (MQ=255) cAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATAtt > 2:293397/1‑91 (MQ=255) aaTTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAAGTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTaa > 2:3197060/1‑91 (MQ=255) aTTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAat < 2:881852/91‑1 (MQ=255) tAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAatat < 2:3770626/91‑1 (MQ=255) aaaGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAAtata < 1:1094919/91‑1 (MQ=255) aaGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAg < 1:1819016/91‑1 (MQ=255) aGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGt > 1:3314010/1‑91 (MQ=255) aGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGt > 2:5051/1‑91 (MQ=255) gAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAg < 2:2686358/91‑1 (MQ=255) aaaaTCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAgg < 2:2230544/91‑1 (MQ=255) aTCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTg > 2:1332792/1‑91 (MQ=255) aTCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTg < 1:3860485/91‑1 (MQ=255) ctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTGTCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTgag < 2:410375‑M2/81‑1 (MQ=255) ctcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTgag < 2:2337114‑M2/81‑1 (MQ=255) tcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTgaga < 2:3028359‑M2/82‑1 (MQ=255) tcagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTgaga < 1:2047421‑M2/82‑1 (MQ=255) cagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGat > 1:2892942‑M2/9‑91 (MQ=255) cagggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGat < 1:1393144‑M2/83‑1 (MQ=255) agggtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGatt > 2:2402609‑M2/8‑91 (MQ=255) gtttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGatttat < 1:2476070‑M2/87‑1 (MQ=255) ttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGatttattt < 2:1988284‑M2/89‑1 (MQ=255) ttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGatttattt < 2:2961910‑M2/89‑1 (MQ=255) ttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGatttattt > 1:900185‑M2/3‑91 (MQ=255) ttTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGatttattt > 1:2557076‑M2/3‑91 (MQ=255) tTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGATTTATTTc > 2:1357430‑M2/2‑91 (MQ=255) tTAAATTTGTACCCAATTATCATCTGCATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAgaattactta > 2:1908473‑M2/2‑90 (MQ=255) tAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGATTTATTtcc > 2:3288721/1‑91 (MQ=255) | GATAAATAAATATTTTTAATGTAACGATTCATTATATAAAAATCAAATAAACCCTGAGGTTTTCAAATTAAAGCGAAAATCTCAGGGTTTTAAATTTGTACTCAATTATCATCTGTATCATTACACTAGTTAATCTAAGATTTGATTATATATTAATATAGTAAGGTTGAGATTTATTTCC > USA300TCH1516_ALE/1392218‑1392398 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |