New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1442468 | 193 (1.010) | 14 (0.080) | 9/148 | NT | 7.2% | coding (838/1137 nt) | USA300HOU_RS07165 | TelA‑like protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1442491 | 182 (1.030) | coding (861/1137 nt) | USA300HOU_RS07165 | TelA‑like protein |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
TTCAATTTTGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATGCTGAAATGTTGAAACAAAATGCGATTGAAACTGCAACAGAAAATGAGCGT > USA300TCH1516_ALE/1442401‑1442581 | ttCAATTTTGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGa < 2:2310992/91‑1 (MQ=255) tCAATTTTGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAg < 1:3390169‑M2/91‑2 (MQ=255) aaTTTTGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAgct < 2:2275627‑M2/91‑4 (MQ=255) aaTTTTGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAgct > 2:2174194‑M2/1‑88 (MQ=255) aaTTTTGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGATTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACTACGAgct < 1:1939948‑M2/91‑4 (MQ=255) aTTTTGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAgctg > 2:2701660‑M2/1‑87 (MQ=255) aTTTTGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAgctg > 1:816195‑M2/1‑87 (MQ=255) ttttGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAgctgt > 2:1263870‑M2/1‑86 (MQ=255) ttttGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAgctgt < 1:2596774‑M2/91‑6 (MQ=255) ttttGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAgctgt < 1:528057‑M2/91‑6 (MQ=255) ttttGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAgctgt > 1:686581‑M2/1‑86 (MQ=255) ttttGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAgctgt < 2:1784128‑M2/91‑6 (MQ=255) ttttGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAgctgt < 1:1201368‑M2/91‑6 (MQ=255) ttGACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCa < 2:1016140/91‑1 (MQ=255) gACAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACt > 2:3239797/1‑91 (MQ=255) cAAGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGa < 1:3539906/91‑1 (MQ=255) aaGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGAt < 1:2761821/91‑1 (MQ=255) aGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATa > 2:570567/1‑91 (MQ=255) aGTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATa > 2:570565/1‑91 (MQ=255) gTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATAc > 2:3299366/1‑91 (MQ=255) gTATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATAc > 2:3318739/1‑91 (MQ=255) tATTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACa < 2:645520/91‑1 (MQ=255) aTTCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACaa < 1:1236142/91‑1 (MQ=255) ttCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAAc < 1:1816372/91‑1 (MQ=255) tCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGACACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACt < 1:3086591/91‑1 (MQ=255) tCCACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCCTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACt > 2:3808816/1‑91 (MQ=255) ccACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTa > 1:3044821/1‑91 (MQ=255) cACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTaa < 1:551926/91‑1 (MQ=255) cACTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTaa > 1:1420511/1‑91 (MQ=255) aCTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGTGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAAt > 2:77018/1‑91 (MQ=255) aCTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAAt > 2:590129/1‑91 (MQ=255) cTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATg < 1:3798067/91‑1 (MQ=255) cTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATg > 2:3867367/1‑91 (MQ=255) cTATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATg < 2:3849493/91‑1 (MQ=255) tATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGa < 1:2085593/91‑1 (MQ=255) tATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGa > 2:2892470/1‑91 (MQ=255) tATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGa > 2:3028696/1‑91 (MQ=255) tATGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGa < 1:3718751/91‑1 (MQ=255) aTGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGAt < 1:2320081/91‑1 (MQ=255) aTGGAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGAt < 2:2784603/91‑1 (MQ=255) gAAAAATCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATtta < 1:202377/91‑1 (MQ=255) aaaaTCAGATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACCGCGAAATGCACTTGCTGCACAACGAGCTGGCACTGATACAACTAATGATttatt > 2:3611213/1‑91 (MQ=255) aaaaTCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATttatt > 1:104469/1‑91 (MQ=255) aaaaTCAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATttatt > 2:1448037/1‑91 (MQ=255) cAAATGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAg > 1:608762/1‑91 (MQ=255) aaTGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCa > 2:2804550/1‑91 (MQ=255) aTGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCaa > 2:3341867/1‑91 (MQ=255) tGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCaaa > 1:3541511/1‑91 (MQ=255) tGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCaaa < 1:3433576/91‑1 (MQ=255) tGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCaaa > 1:1587330/1‑91 (MQ=255) tGGCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCaaa < 1:1322918/91‑1 (MQ=255) gCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATg < 2:3636693/91‑1 (MQ=255) gCCATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATg < 1:1694911/91‑1 (MQ=255) ccATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATGc < 2:2597552/91‑1 (MQ=255) ccATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATGc < 1:392018/91‑1 (MQ=255) cATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATGCt > 2:241744/1‑91 (MQ=255) cATTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATGCt < 1:1164084/91‑1 (MQ=255) aTTGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATGCTg > 1:2452228/1‑91 (MQ=255) ttGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATGCTGa > 2:3243997/1‑91 (MQ=255) tGCGCTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATGCTGaa < 2:1108674/91‑1 (MQ=255) gcgcTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATGCTGaaa > 2:2478835/1‑91 (MQ=255) cTTACATTAATGAGACAGCGTAATGCAGTTGCTGCACAACGAGCTGTCACTGATACAACTAATGATTTATTAACAGCAAATGCTGAAATGt > 2:3086915/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |