New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1533866 = | 159 (0.830) | 35 (0.210) | 15/138 | NT | 21.4% | coding (219/588 nt) | USA300HOU_RS07480 | hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 1533900 = | 120 (0.730) | coding (185/588 nt) | USA300HOU_RS07480 | hypothetical protein |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAA > USA300TCH1516_ALE/1533811‑1533989 | tataATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTc > 2:538187/1‑91 (MQ=255) tataATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTACAATTTc > 2:3448795/1‑91 (MQ=255) ataATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCt < 2:714665/91‑1 (MQ=255) ataATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCt > 1:1253526/1‑91 (MQ=255) ataATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCt > 2:2355110/1‑91 (MQ=255) ataATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCt > 1:2494620/1‑91 (MQ=255) aaTCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTaa < 1:814090/91‑1 (MQ=255) aTCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAAt > 1:556785/1‑91 (MQ=255) tCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATg > 1:2379943/1‑91 (MQ=255) tCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATg > 1:3682020/1‑91 (MQ=255) cAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGt > 1:755521/1‑91 (MQ=255) cAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGt > 1:3473971/1‑91 (MQ=255) aaaTATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGtt < 2:692222/91‑1 (MQ=255) aaTATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGttt > 2:2026597/1‑91 (MQ=255) tttCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCatg > 1:1008505/1‑91 (MQ=255) tCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCatgat < 1:3191015/91‑1 (MQ=255) tCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCatgat < 2:1111033/91‑1 (MQ=255) tCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCatgat > 1:2035251/1‑91 (MQ=255) tCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCatgat > 1:2142140/1‑91 (MQ=255) ttttgtagatacaaaaattaatcctcatgaaacattagaaattgcagaagcgtgacttcccacttctgcaattTCTAATGTTTCAtgatga < 1:21837‑M2/18‑1 (MQ=255) ttttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaaattgcagaagcgtgacttcccacttctgcaattTCTAATGTTTCAtgatga < 1:1101952‑M2/18‑1 (MQ=255) ttGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGAtt > 2:2419411/1‑91 (MQ=255) tATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAAt < 1:2029743/91‑1 (MQ=255) tATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAAt > 2:3840908/1‑91 (MQ=255) tATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAAt > 1:1902685/1‑91 (MQ=255) tCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAAtttt > 2:2573130/1‑91 (MQ=255) tCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAAtttt > 2:2127010/1‑91 (MQ=255) cATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAAttttt > 1:1588966/1‑91 (MQ=255) aTTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTg < 2:3383306/91‑1 (MQ=255) ttAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGt < 1:3584894/91‑1 (MQ=255) aaCTTTATATTACGCTTAGTAAATTGGATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTAt < 1:2010966/91‑1 (MQ=255) tttATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTa < 2:2799974/91‑1 (MQ=255) ttATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTAc < 1:1693601/91‑1 (MQ=255) tataTTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACa < 2:3200719/91‑1 (MQ=255) tatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACaaa > 1:1834745/1‑91 (MQ=255) tcatcatgaaacattagaAATTGCAGAAGTGGGAAGTCACGCTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACaaaa < 1:2109854‑M1/73‑1 (MQ=255) tACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAaatg < 1:3823034/91‑1 (MQ=255) aCGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAaatga > 1:897898/1‑91 (MQ=255) gCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAaatgaat > 1:2760988/1‑91 (MQ=255) aaacattagaAATTGCAGAAGTGGGAAGTCACGCTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGtt < 2:316949‑M1/81‑1 (MQ=255) aaacattagaAATTGCAGAAGTGGGAAGTCACGCTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGtt < 2:316924‑M1/81‑1 (MQ=255) aGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGttt > 1:2432494/1‑91 (MQ=255) tAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGc < 2:2074175/91‑1 (MQ=255) tAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGc < 1:3217335/91‑1 (MQ=255) tAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGc < 1:3564600/91‑1 (MQ=255) cattagaAATTGCAGAAGTGGGAAGTCACGCTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGc < 1:1561870‑M1/84‑1 (MQ=255) attagaAATTGCAGAAGTGGGAAGTCACGCTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGcc < 1:3030887‑M1/85‑1 (MQ=255) attagaAATTGCAGAAGTGGGAAGTCACGCTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGcc < 1:3030898‑M1/85‑1 (MQ=255) aaaTTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAAt > 2:3239356/1‑63 (MQ=255) aaaTTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGcc < 2:168793/91‑1 (MQ=255) aaaTTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGcc < 1:984299/91‑1 (MQ=255) aattgaattgCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCa > 1:2617824/1‑91 (MQ=255) tgaattgCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTACTTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAAtt > 2:1492221/1‑91 (MQ=255) gaattgCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAAttt < 2:1310929/91‑1 (MQ=255) AATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTc > 2:379539‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCg > 1:1809745‑M1/1‑91 (MQ=255) gcagaagtgggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCt > 1:95622‑M2/31‑91 (MQ=255) GCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCt < 2:1185231‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCt < 2:1188443‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCt < 2:1490586‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCt < 1:681184‑M1/91‑1 (MQ=255) cagaagtgggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTc > 1:3052352‑M2/30‑91 (MQ=255) cagaagtgggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTc > 2:2057373‑M2/30‑91 (MQ=255) agaagtgggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCa > 1:2409145‑M2/29‑91 (MQ=255) AGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCa > 2:1456560‑M1/1‑91 (MQ=255) AGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCa < 1:1176319‑M1/91‑1 (MQ=255) AGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGACATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTGGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCa > 2:3614783‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCAtt > 1:705299‑M1/1‑91 (MQ=255) AAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCAtt < 1:2397599‑M1/91‑1 (MQ=255) agtgggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTc > 2:3208255‑M2/26‑91 (MQ=255) AGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTc < 1:1573947‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTc > 1:250611‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCGTGACTTCCCACTTCCGCAAATTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAACTGAATGTTTGCCAATCTCGCCTCATTc < 2:362424‑M1/91‑1 (MQ=255) gtgggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCa > 2:330803‑M2/25‑91 (MQ=255) gtgggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCa > 2:846095‑M2/25‑91 (MQ=255) gtgggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCa > 2:194422‑M2/25‑91 (MQ=255) GCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCa < 1:2933775‑M1/91‑1 (MQ=255) GCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCa > 1:1431642‑M1/1‑91 (MQ=255) GCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCa > 1:1432450‑M1/1‑91 (MQ=255) tgggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGCTGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCAc > 1:3267718‑M2/24‑91 (MQ=255) gggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACt > 1:2270696‑M2/23‑91 (MQ=255) gggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACt > 2:3236782‑M2/23‑91 (MQ=255) gggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTCTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACt > 2:3414413‑M2/23‑91 (MQ=255) ggaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACtt > 2:2335211‑M2/22‑91 (MQ=255) gaagtcacgcttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACttt > 1:1991670‑M2/21‑91 (MQ=255) gACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACttt < 1:2700810/91‑1 (MQ=255) gACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACttt < 2:3659882/91‑1 (MQ=255) cTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTta < 2:300934/91‑1 (MQ=255) cccACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTtatat > 1:1114674/1‑91 (MQ=255) cccACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTtatat > 1:3671258/1‑91 (MQ=255) cACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAg < 2:3473971/91‑1 (MQ=255) cACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAg > 2:1888108/1‑91 (MQ=255) aCTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATAAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATACACTTTTATATAGt > 1:3499771/1‑91 (MQ=255) cttctgcaattTCTAATGTTTCATGATGATTACTTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATAGAGtt > 2:1565665‑M2/12‑91 (MQ=255) gcaattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCa > 1:834738‑M2/7‑91 (MQ=255) caattTCTAATGTTTTATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCAc < 1:2068166‑M2/86‑1 (MQ=255) caattTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCAc < 2:1866063‑M2/86‑1 (MQ=255) attTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTTTTTTCAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCAccc > 2:239978‑M2/4‑91 (MQ=255) attTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCAccc > 2:238283‑M2/4‑91 (MQ=255) tTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCaa > 1:1516103‑M2/2‑91 (MQ=255) | TATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAA > USA300TCH1516_ALE/1533811‑1533989 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |