New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1535925 | 175 (0.920) | 9 (0.050) | 8/144 | NT | 5.3% | coding (711/1299 nt) | aroA | 3‑phosphoshikimate 1‑carboxyvinyltransferase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1535948 | 163 (0.950) | coding (688/1299 nt) | aroA | 3‑phosphoshikimate 1‑carboxyvinyltransferase |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
CAACATTATGAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTAAAATGTTTGAACAT > USA300TCH1516_ALE/1535858‑1536038 | cAACATTATGAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGaaa < 2:2816287/91‑1 (MQ=255) aCATTATGAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAat > 2:398764‑M2/1‑89 (MQ=255) cATTATGAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAatc > 2:2552727‑M2/1‑88 (MQ=255) cATTATGAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAatc > 2:1151209‑M2/1‑88 (MQ=255) aTTATGAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAatct < 1:509546‑M2/91‑5 (MQ=255) tATGAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAatctgc > 2:2029020‑M2/1‑85 (MQ=255) aTGAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAatctgca < 1:1389700‑M2/91‑8 (MQ=255) gAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAgg > 2:1635085/1‑91 (MQ=255) gAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAgg > 2:1796783/1‑91 (MQ=255) gAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAgg > 1:1462732/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAatct < 2:853940‑M2/85‑5 (MQ=255) aTTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAGCGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGtt < 1:3482189/91‑1 (MQ=255) aTTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGtt < 2:2917398/91‑1 (MQ=255) aTTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGtt > 2:3041721/1‑91 (MQ=255) ttGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGttt > 1:2037417/1‑91 (MQ=255) gTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTaa < 2:2181574/91‑1 (MQ=255) ttACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAAt < 2:742251/91‑1 (MQ=255) ttACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAAt < 1:679725/91‑1 (MQ=255) tACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGTTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATg < 1:3643818/91‑1 (MQ=255) aCATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCTAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGt < 2:3371684/91‑1 (MQ=255) aCATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGt > 1:3142935/1‑91 (MQ=255) aTCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTAt < 2:2343820/91‑1 (MQ=255) tCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATc < 1:1790415/91‑1 (MQ=255) cTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGaa < 1:2208113/91‑1 (MQ=255) ttCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAAt > 1:359721/1‑91 (MQ=255) ttCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAAt > 1:918194/1‑91 (MQ=255) ccTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTg > 1:3776495/1‑91 (MQ=255) cTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGc > 1:228276/1‑91 (MQ=255) tGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCt > 1:2308722/1‑91 (MQ=255) gtgtGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTc < 1:1041105/91‑1 (MQ=255) gtgATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAg < 2:462108/91‑1 (MQ=255) tgATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAgg < 1:2796357/91‑1 (MQ=255) tAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGt < 1:3590216/91‑1 (MQ=255) ctgtAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTAtt < 1:3010910/91‑1 (MQ=255) ctgcAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTAtt < 2:539130/91‑1 (MQ=255) ctgcAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTAtt > 2:1749987/1‑91 (MQ=255) tgcAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTa > 1:3099866/1‑91 (MQ=255) gcAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCt < 2:1558488/75‑1 (MQ=255) gcAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCt > 1:1558488/1‑75 (MQ=255) gcAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTaa > 2:2255185/1‑91 (MQ=255) gcAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTaa < 2:2725596/91‑1 (MQ=255) gcAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTaa > 1:2444236/1‑91 (MQ=255) caacaaTAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAAt > 2:3540862/1‑91 (MQ=255) caacaaTAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAAt < 2:1371316/91‑1 (MQ=255) aacaaTAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAAtt > 2:2150819/1‑91 (MQ=255) acaaTAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTg < 2:900497/91‑1 (MQ=255) caaTAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGa < 1:1108865/91‑1 (MQ=255) caaTAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGa < 1:3564780/91‑1 (MQ=255) aaTAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGAt > 1:2879962/1‑91 (MQ=255) aaTAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGAt < 1:2234904/91‑1 (MQ=255) aaTAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGCTGTATTAATTGAt > 1:3219330/1‑91 (MQ=255) tAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATaa > 1:1925635/1‑91 (MQ=255) tAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATaa > 1:1812770/1‑91 (MQ=255) tAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATaa < 1:1332047/91‑1 (MQ=255) tAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATaa > 1:1129742/1‑91 (MQ=255) aaaGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAAc < 2:276389/91‑1 (MQ=255) aaaGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAAc > 2:3701311/1‑91 (MQ=255) aaGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAAcc > 2:2734514/1‑91 (MQ=255) aaGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAAcc < 1:844086/91‑1 (MQ=255) aaGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAAcc > 1:2729988/1‑91 (MQ=255) gAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCt > 1:448338/1‑91 (MQ=255) aaCGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGt > 2:2819843/1‑71 (MQ=255) aaCGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGt < 1:2819843/71‑1 (MQ=255) aCGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTc < 1:2586871/91‑1 (MQ=255) aCGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTc > 1:531655/1‑91 (MQ=255) cGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCt > 1:1282656/1‑91 (MQ=255) cGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCt < 2:2506628/91‑1 (MQ=255) cTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGc < 2:252684/91‑1 (MQ=255) tGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCt > 2:789928/1‑91 (MQ=255) gCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCtt > 1:3630927/1‑91 (MQ=255) gCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCtt > 1:2463618/1‑91 (MQ=255) cAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTc > 2:3611824/1‑91 (MQ=255) cAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCAGCTTc > 2:3575249/1‑91 (MQ=255) aGATGAAATATCGCCAGGAACATGACAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCa < 1:3612128/91‑1 (MQ=255) gATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATGGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCaa < 2:969054/91‑1 (MQ=255) gATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGCTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCaa > 2:801576/1‑91 (MQ=255) aTGAAATATCGCCAGGAACATGAAAatctgcagcgttctttattgttgcagcacttatcacaccaggaagtgatgtaacaattcataatgt < 1:2496646‑M2/91‑67 (MQ=255) gAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTg < 1:2319697/91‑1 (MQ=255) aaaTATCGCCAGGAACATGAAAatctgcagcgttctttattgttgcagcacttatcacaccaggaagtgatgtaacaattcataatgttgg < 1:3366405‑M2/91‑70 (MQ=255) aaTATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGa < 2:550832/91‑1 (MQ=255) atatCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGaa < 1:1825667/91‑1 (MQ=255) tCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAatat > 2:2863508/1‑91 (MQ=255) tCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAatat < 2:3213513/91‑1 (MQ=255) cGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATAtt > 1:3756554/1‑91 (MQ=255) gCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTa > 1:274149/1‑91 (MQ=255) gCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTa < 2:2402523/91‑1 (MQ=255) gCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTa > 1:994556/1‑91 (MQ=255) ccAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTaa > 1:1430749/1‑91 (MQ=255) cAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTaaa > 1:3673283/1‑91 (MQ=255) cAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTaaa > 1:2224860/1‑91 (MQ=255) cAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTaaa < 1:2101774/91‑1 (MQ=255) cAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTaaa < 1:748510/91‑1 (MQ=255) aaCATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTAAAATGt > 2:1929127/1‑91 (MQ=255) tGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTAAAATGTTTGa < 2:3611475/91‑1 (MQ=255) tGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTAAAATGTTTGa < 2:3850532/91‑1 (MQ=255) tGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTAAAATGTTTGa < 2:2224860/91‑1 (MQ=255) gAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTAAAATGTTTGaa < 2:1213947/91‑1 (MQ=255) aaaaTCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTAAAATGTTTGAAc > 2:2529205/1‑91 (MQ=255) aaaaTCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTAAAAGGTTTGAAc < 2:1413034/91‑1 (MQ=255) aaTCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATAAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTAAAATGTTTGAACAt < 2:436815/91‑1 (MQ=255) | CAACATTATGAATTGTTACATCACTTCCTGGTGTGATAAGTGCTGCAACAATAAAGAACGCTGCAGATGAAATATCGCCAGGAACATGAAAATCTGCAGGTTTAATGTATCGAATTGCTTCAGGGGTTGTATTAATTGATAACCCTTCTGCTTCAATTGGAATATTAAAATGTTTGAACAT > USA300TCH1516_ALE/1535858‑1536038 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |