New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1539773 | 162 (0.850) | 10 (0.060) | 8/148 | NT | 5.8% | coding (373/450 nt) | ndk | Nucleoside diphosphate kinase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1539799 | 177 (1.010) | coding (347/450 nt) | ndk | Nucleoside diphosphate kinase |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
ATGCATCACGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCAATAATAT > USA300TCH1516_ALE/1539710‑1539889 | aTGCATCACGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACc > 2:754741‑M2/1‑90 (MQ=255) tGCATCACGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCTTTTTATTTTAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACcg < 2:3625339‑M2/91‑3 (MQ=255) tGCATCACGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACcg < 1:24324‑M2/91‑3 (MQ=255) aTCACGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACcgtga < 1:2486527‑M2/91‑6 (MQ=255) aTCACGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACcgtga > 2:1654509‑M2/1‑86 (MQ=255) tCACGTGGTGAAGCATAGCTATTAATTTCATTTTCATTAAGCCATATATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACcgtgaa > 1:1154177‑M2/1‑85 (MQ=255) tCACGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACcgtgaa > 1:414945‑M2/1‑85 (MQ=255) aCGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATg > 2:2884280/1‑91 (MQ=255) cGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGa < 1:918085/91‑1 (MQ=255) cGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGa < 2:2608628/91‑1 (MQ=255) cGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGa < 1:3841066/91‑1 (MQ=255) tggtgAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGata > 1:834505/1‑91 (MQ=255) gtgAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATAtt > 2:1233150/1‑91 (MQ=255) gtgAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATAtt > 2:2382437/1‑91 (MQ=255) gAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTc > 1:2227080/1‑91 (MQ=255) atgCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAACCTGAACCGTGAATGATATTTCt > 2:3129555/3‑91 (MQ=255) aTAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCa < 2:808370/91‑1 (MQ=255) gCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACa < 1:3151760/91‑1 (MQ=255) cTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAg > 2:3393438/1‑91 (MQ=255) tAGTGATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGt < 1:3230020/91‑1 (MQ=255) tAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGt < 2:1429494/91‑1 (MQ=255) tAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGt < 1:131056/91‑1 (MQ=255) aGTAATTTCATTTTCATTAAACCATTGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGtt < 1:3597119/91‑1 (MQ=255) gTAATTTCATTTTCATTATACCATAGACTAATTTCACTTTCAGCAGACTCTAATGAACCTGAACCGTGAATGATACTGCTACCAACAGttc > 2:1320620/1‑90 (MQ=255) gTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTa > 2:584918/1‑91 (MQ=255) gTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTa > 2:2510511/1‑91 (MQ=255) tAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTaa < 1:111497/91‑1 (MQ=255) aaTTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTaaa < 1:2696867/91‑1 (MQ=255) tttcattttcatTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAAcc > 1:2873834/1‑91 (MQ=255) tcattttcattAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTa > 1:3441372/1‑91 (MQ=255) attttcattAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGCATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTcaa > 1:1319314/1‑91 (MQ=255) attAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACct > 1:1338640/1‑91 (MQ=255) ttAAACCATAGATTAATGTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACctc < 2:3240508/91‑1 (MQ=255) tAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACctct > 2:393034/1‑91 (MQ=255) aaaCCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTa < 2:1693484/91‑1 (MQ=255) aaaCCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTa > 2:1563491/1‑91 (MQ=255) aaCCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTaa < 1:2662520/91‑1 (MQ=255) aaCCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTaa < 1:2176078/91‑1 (MQ=255) aaCCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTaa < 2:3822257/91‑1 (MQ=255) aCCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAAt > 1:1380389/1‑91 (MQ=255) aCCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAAt < 1:2908168/91‑1 (MQ=255) aCCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAAt < 2:2741641/91‑1 (MQ=255) ccATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACcgtgaaattaatctatggtttaatgaaaatgaaattactagctatgc < 2:3831519‑M2/91‑48 (MQ=255) acggaGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAAtt < 1:1484261/87‑1 (MQ=255) aTAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGa < 1:1974034/91‑1 (MQ=255) tAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGAt > 1:3646513/1‑91 (MQ=255) gATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATcc > 1:3145961/1‑91 (MQ=255) aTTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAAt > 2:1046948/1‑74 (MQ=255) aTTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAAt < 1:1046948/74‑1 (MQ=255) ttAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACcgtgaaattaatctatggtttaatgaaaatgaaattactagctatgcttcacca < 1:3169004‑M2/91‑55 (MQ=255) ttAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTg > 1:464583/1‑91 (MQ=255) ttAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTg > 1:963486/1‑91 (MQ=255) aaTTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTTAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGt > 2:2438254/1‑91 (MQ=255) aaTTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGt < 1:2511719/91‑1 (MQ=255) aTTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACcgtgaaattaatctatggtttaatgaaaatgaaattactagctatgcttcaccacgt < 1:2814610‑M2/91‑58 (MQ=255) aTTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTg < 1:2558309/91‑1 (MQ=255) tttCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACcgtgaaattaatctatggtttaatgaaaatgaaattactagctatgcttcaccacgtg < 2:2529434‑M2/91‑59 (MQ=255) ttCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACcgtgaaattaatctatggtttaatgaaaatgaaattactagctatgcttcaccacgtga < 1:2006221‑M2/91‑60 (MQ=255) ttCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGaa < 2:1258377/91‑1 (MQ=255) ttCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGaa < 1:2250836/91‑1 (MQ=255) aCGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCt > 1:1371207/1‑91 (MQ=255) ttCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCt < 1:3756699/91‑1 (MQ=255) ttCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCt < 2:1857215/91‑1 (MQ=255) ttCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCt < 1:3703347/91‑1 (MQ=255) tCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCAACTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTg > 2:450735/1‑91 (MQ=255) cagcagACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGa > 1:2831570/1‑91 (MQ=255) cagcagACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGa > 2:2171971/1‑91 (MQ=255) agcagACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGaa < 1:2665360/91‑1 (MQ=255) agcagACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGaa > 1:1774764/1‑91 (MQ=255) agcagACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGaa > 2:2342124/1‑91 (MQ=255) gcagACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAg < 2:40466/91‑1 (MQ=255) gcagACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAg > 2:1896642/1‑91 (MQ=255) gcagACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAg > 1:1878682/1‑91 (MQ=255) cagACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAgg < 2:1424747/91‑1 (MQ=255) gACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGAt < 2:1116159/91‑1 (MQ=255) gACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGAt < 1:3581613/91‑1 (MQ=255) aCTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGAtt > 2:3875819/1‑91 (MQ=255) ctctAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTg > 2:1314934/1‑91 (MQ=255) ctctAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTg > 1:1546043/1‑91 (MQ=255) ctctAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTg > 2:687782/1‑91 (MQ=255) ctctAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCGACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTg > 2:3803755/1‑91 (MQ=255) tctAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTgg < 1:589941/91‑1 (MQ=255) tctAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTgg < 1:402487/91‑1 (MQ=255) tctAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTgg < 2:246361/91‑1 (MQ=255) ctAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGt > 2:2619703/1‑91 (MQ=255) aaTGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGtgc > 1:490753/1‑91 (MQ=255) aaTGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGtgc < 1:3464579/91‑1 (MQ=255) aTGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCATCAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTGTGAAGGATTGGtgct < 1:3309831/91‑1 (MQ=255) aTGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTATTTGATCCTTGTTAAGCTTCTGAAGGATTGGtgct < 1:1714354/91‑1 (MQ=255) aTGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGtgct > 2:2686237/1‑91 (MQ=255) tCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCaa < 1:1660452/91‑1 (MQ=255) cTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTATAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCaat < 2:2997195/91‑1 (MQ=255) tGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCaata > 2:352686/1‑91 (MQ=255) tGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCaata < 2:3308099/91‑1 (MQ=255) gAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCaataa > 1:2374163/1‑91 (MQ=255) aaCCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCaataat < 2:3673431/91‑1 (MQ=255) aaCCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCaataat > 1:2941088/1‑91 (MQ=255) aCCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCAataata > 1:2360864/1‑91 (MQ=255) aCCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCAataata > 2:1741111/1‑91 (MQ=255) aCCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCAataata > 1:1010753/1‑91 (MQ=255) | ATGCATCACGTGGTGAAGCATAGCTAGTAATTTCATTTTCATTAAACCATAGATTAATTTCACGTTCAGCAGACTCTAATGAATCTGAACCGTGAATGATATTTCTACCAACAGTTAAACCTAAATCACCTCTAATTGATCCTGGTGAAGCTTCTGAAGGATTGGTGCTGCCAATAATAT > USA300TCH1516_ALE/1539710‑1539889 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |