| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1555332 = | 194 (1.020) | 20 (0.120) | 13/140 | NT | 11.5% | intergenic (+28/+78) | USA300HOU_RS07605/ribU | Ferredoxin/Riboflavin transporter RibU |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1555376 = | 139 (0.840) | intergenic (+72/+34) | USA300HOU_RS07605/ribU | Ferredoxin/Riboflavin transporter RibU | |||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
GCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGA > USA300TCH1516_ALE/1555287‑1555466 | gCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttat > 2:1932927/1‑91 (MQ=255)aaagaatttaatcaaattaaagcaaaataatatacacataataatAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttat > 1:3136967‑M1/46‑91 (MQ=255) tAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttattatt < 1:1798013/91‑1 (MQ=255) aaaaTTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTttattatta > 2:2663995/1‑91 (MQ=255) aaaTTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTtattattat < 2:3113078/91‑1 (MQ=255) ttaatcaaattaaagcaaaataatatacacataataataaaaagcaggtgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTAtg > 1:712935‑M2/83‑91 (MQ=255) aaTTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTAtg < 1:1289109/91‑1 (MQ=255) tttGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTAtgtg < 1:2429167/91‑1 (MQ=255) tttGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTAtgtg > 1:1985500/1‑91 (MQ=255) ttGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATgtgt < 2:1385603/91‑1 (MQ=255) ttGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATgtgt < 1:157518/91‑1 (MQ=255) tGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGta < 1:255968/91‑1 (MQ=255) gAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGtat < 2:707531/91‑1 (MQ=255) gAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGtat > 1:1142741/1‑91 (MQ=255) aataatTGATTTTTTAGATAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGtata < 2:2264367/91‑1 (MQ=255) aataatTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGtata > 1:10246/1‑91 (MQ=255) ataatTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTatat < 1:381213/91‑1 (MQ=255) taatTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTAGTATGTGTAtatt > 2:3220141/1‑91 (MQ=255) aatTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTAtatta < 2:2870578/91‑1 (MQ=255) atTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTAtattat < 1:1406850/91‑1 (MQ=255) atTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTAtattat > 1:1262094/1‑91 (MQ=255) atTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTAtattat > 1:3339740/1‑91 (MQ=255) ttGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATattatt > 1:1983709/1‑91 (MQ=255) tGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTAttt < 2:1506120/91‑1 (MQ=255) gATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTAtttt < 2:3772551/91‑1 (MQ=255) ttttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGc > 2:1739923/1‑91 (MQ=255) ttttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGc > 1:70022/1‑91 (MQ=255) tttttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCt > 2:1681045/1‑91 (MQ=255) ttAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTa > 2:3623530/1‑91 (MQ=255) tAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTaa > 1:2924815/1‑91 (MQ=255) tAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTaa > 1:213846/1‑91 (MQ=255) aGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAAt > 2:2481350/1‑91 (MQ=255) atatacacataataataaaaagcaggtgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAAtt > 1:926724‑M2/61‑91 (MQ=255) aCAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAAttt > 2:1992287/1‑91 (MQ=255) cAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAAtttt < 2:279438/91‑2 (MQ=255) gTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTGTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTaa < 2:3194122/91‑1 (MQ=255) ttCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTaaa > 2:2936767/1‑91 (MQ=255) cTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAAtt > 1:1099380/1‑91 (MQ=255) ataGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCt > 1:3141483/1‑91 (MQ=255) ataaaaagcaggtgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCttt > 1:894733‑M2/47‑91 (MQ=255) AAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCa > 2:2752033‑M1/1‑91 (MQ=255) AAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTCCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCa < 1:3599608‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCaa > 1:1853506‑M1/1‑91 (MQ=255) aagcaggtgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAg > 2:639650‑M2/42‑91 (MQ=255) aagcaggtgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAg > 2:636016‑M2/42‑91 (MQ=255) AAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAg < 1:605350‑M1/91‑1 (MQ=255) agcaggtgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGa > 2:448723‑M2/41‑91 (MQ=255) AGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGa > 1:227430‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGa > 1:227231‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGa > 1:994929‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGAGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTATATTCTTTTCAAGa < 2:2608207‑M1/91‑1 (MQ=255) tAGGCAATTTATTGTTTATTGTTAGTCAGCTTTTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGaaa > 2:3851221‑M1/2‑91 (MQ=255) CAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGaaa > 1:1057835‑M1/1‑91 (MQ=255) CAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGaaa < 1:3434748‑M1/91‑1 (MQ=255) AGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAAt < 1:146905‑M1/91‑1 (MQ=255) AGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAAt > 1:3711715‑M1/1‑91 (MQ=255) GGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAAtt < 1:1068121‑M1/91‑1 (MQ=255) GGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAAtt < 1:2711292‑M1/91‑1 (MQ=255) gtgactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTc > 1:566571‑M2/36‑91 (MQ=255) GCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTc < 1:1151208‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTc < 2:3042202‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTc < 1:2759002‑M1/91‑1 (MQ=255) GCAAGCTATCGTTTATTGATAGCCACCTGCTTTTTATTACTATCTGCATGTTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTGTCAAGAAattt < 2:2985558‑M1/91‑2 (MQ=255) cAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCg < 2:3734061/91‑1 (MQ=255) gactatcaataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGc > 1:855827‑M2/34‑91 (MQ=255) aaGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAg > 2:391135/1‑83 (MQ=255) aaGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGc < 2:2173947/91‑1 (MQ=255) aaGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTCTTCAAGAAATTCGc < 2:3293541/91‑1 (MQ=255) aGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCa > 2:255599/1‑91 (MQ=255) gCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCaa < 1:1529935/91‑1 (MQ=255) tATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGc > 1:452108/1‑91 (MQ=255) tATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGc > 1:892962/1‑91 (MQ=255) tATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGc < 1:2846130/91‑1 (MQ=255) aTCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGcc > 2:2508644/1‑91 (MQ=255) cGTTTATTGATAGACACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCtt < 2:881690/91‑1 (MQ=255) aataaacgatagcttgcctgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCt > 1:912606‑M2/27‑90 (MQ=255) gTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTc < 2:3071715/91‑1 (MQ=255) ttATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCta > 2:1749021/1‑91 (MQ=255) aTTGATAGTCACCTGCTTTTTATCCTTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCATTCtata < 2:3613601/91‑1 (MQ=255) gATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAg < 2:126529/91‑1 (MQ=255) gATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAg < 1:2893318/91‑1 (MQ=255) gATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAg < 2:3540425/91‑1 (MQ=255) aTAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGt < 1:1189626/91‑1 (MQ=255) tAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCg > 1:228889/1‑73 (MQ=255) tAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCg < 2:228889/73‑1 (MQ=255) tAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTa < 2:1894715/91‑1 (MQ=255) tAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTa > 2:1418934/1‑91 (MQ=255) tAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTa < 2:860390/91‑1 (MQ=255) aGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTaa > 2:239882/1‑91 (MQ=255) tCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTaaaa > 2:1969811/1‑91 (MQ=255) cACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAaaat < 1:1775251/91‑1 (MQ=255) aCCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAaaata > 2:1481603/1‑91 (MQ=255) tgctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAaaataaat > 2:538041‑M2/9‑91 (MQ=255) gctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAaataaata < 2:1078582‑M2/84‑1 (MQ=255) ctttttATTTTTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATAc > 2:574974‑M2/7‑91 (MQ=255) ctttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATAc > 1:3500211‑M2/7‑91 (MQ=255) tttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACa < 1:2489057‑M2/86‑1 (MQ=255) ttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACaa > 1:3188162‑M2/5‑91 (MQ=255) ttttATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTGCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACaa > 2:3413027‑M2/5‑91 (MQ=255) tATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAg < 1:3287259‑M2/90‑1 (MQ=255) | GCTTTAAAATTTGAATAATTGATTTTTTAGACAAATGTTCTATAGAAAAAGCAGGCAAGCTATCGTTTATTGATAGTCACCTGCTTTTTATTATTATGTGTATATTATTTTGCTTTAATTTGATTAAATTCTTTTCAAGAAATTCGCAAGCCTTCTATATAGTAAAATAAATACAATAGA > USA300TCH1516_ALE/1555287‑1555466 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |