New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1671778 = | 208 (1.090) | 19 (0.110) | 10/146 | NT | 9.5% | intergenic (‑23/+108) | trmK/sigA | tRNA (adenine(22)‑N(1))‑methyltransferase/RNA polymerase sigma factor SigA |
? | USA300TCH1516_ALE | 1671809 = | 171 (0.980) | intergenic (‑54/+77) | trmK/sigA | tRNA (adenine(22)‑N(1))‑methyltransferase/RNA polymerase sigma factor SigA |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
GACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGT > USA300TCH1516_ALE/1671719‑1671899 | gACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctca > 1:3050589/1‑91 (MQ=255) aCTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctcac > 2:1902853/1‑91 (MQ=255) cTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctcact > 2:2542744/1‑91 (MQ=255) ttACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctcactc < 1:3855145/91‑1 (MQ=255) ttACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctcactc < 1:2917532/91‑1 (MQ=255) tACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctcactca < 1:766233/91‑1 (MQ=255) tACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACctcactca < 1:2012893/91‑1 (MQ=255) cgtcgtTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGt < 1:928462/91‑1 (MQ=255) cgtTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTaa < 2:1266442/91‑1 (MQ=255) gtTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTaaa < 2:775668/91‑1 (MQ=255) ttAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAAt > 2:875863/1‑91 (MQ=255) aTCAGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATcat < 2:2621605/91‑3 (MQ=255) cGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTaa < 1:3391398/91‑1 (MQ=255) ggTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAACTCTTAAt > 2:3450446/1‑91 (MQ=255) ttATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCt > 2:3650155/1‑91 (MQ=255) tttAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTaaa > 2:3316115/1‑91 (MQ=255) ttAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTaaaa > 2:1595331/1‑91 (MQ=255) aCGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCGATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaata > 2:3405815/1‑91 (MQ=255) aCGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaata < 1:1614229/91‑1 (MQ=255) aCGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaata > 2:2172936/1‑91 (MQ=255) aCGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaata > 2:3748593/1‑91 (MQ=255) aCGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaata < 1:2008296/91‑1 (MQ=255) aCGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaata < 2:1812887/91‑1 (MQ=255) gAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaataaa < 1:1834288/91‑1 (MQ=255) gAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAaaataaa < 2:2695391/91‑1 (MQ=255) aaTCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAaataaata > 2:1327324/1‑91 (MQ=255) aaTCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAaataaata < 1:3486108/91‑1 (MQ=255) aaTCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAaataaata < 1:2435653/91‑1 (MQ=255) aTCATTTTATTCTCCTTTATGAAATAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTAGCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAataaataa < 2:3599165/91‑1 (MQ=255) aTCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAataaataa < 2:3582371/91‑1 (MQ=255) aTCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAataaataa > 2:1434818/1‑91 (MQ=255) tCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAg < 2:2949740/91‑1 (MQ=255) tCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAg > 1:1377714/1‑91 (MQ=255) aTTTTATTCACATTTAAGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAgcg < 2:1441487/91‑1 (MQ=255) ttttATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAgcgc > 2:28918/1‑91 (MQ=255) tttATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCt > 2:911525/1‑91 (MQ=255) ttATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCtt > 1:400961/1‑91 (MQ=255) tattatCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAAAATCACTAAAGTTAAATATTAATATAAAAATAAATAAGCGCTTa > 2:361123/1‑91 (MQ=255) tATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTa < 1:652162/91‑1 (MQ=255) ttCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAATTAAGCGCTTAtt < 1:2981140/91‑1 (MQ=255) ttCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTAtt > 2:3553527/1‑91 (MQ=255) ttCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTAtt < 1:3643208/91‑1 (MQ=255) ttCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTAtt < 1:2341243/91‑1 (MQ=255) tctcCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTc > 2:644802/1‑91 (MQ=255) tctcCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTc < 2:3110472/91‑1 (MQ=255) ctcCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCa < 1:3577001/91‑1 (MQ=255) tcCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCAt < 2:1928682/91‑1 (MQ=255) ccTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATg < 2:2413820/91‑1 (MQ=255) cTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGt < 1:1680776/91‑1 (MQ=255) tttATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTc < 1:184503/91‑1 (MQ=255) tttATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTc < 2:2139473/91‑1 (MQ=255) gAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGt > 1:2949704/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTa > 2:3202387/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTa > 2:3743773/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTa > 1:755915/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGACTTGGTa > 2:2224453/1‑91 (MQ=255) aaaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTat < 2:2318197/91‑1 (MQ=255) aaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatc > 1:1742737/1‑91 (MQ=255) aaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatc > 1:1039839/1‑91 (MQ=255) aaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatc > 1:1497646/1‑91 (MQ=255) aaaaGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCATGGTatc > 1:1931391/1‑91 (MQ=255) agtgaggttggtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatca > 1:419962‑M2/35‑91 (MQ=255) agagGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatcaat < 2:402699/91‑1 (MQ=255) agagGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatcaat > 1:456857/1‑91 (MQ=255) AGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTatcaatca > 1:484143‑M1/1‑91 (MQ=255) ggttggtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCAt > 1:3534799‑M2/30‑91 (MQ=255) GGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCAt < 2:3035953‑M1/91‑1 (MQ=255) GGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCAt > 1:2893350‑M1/1‑91 (MQ=255) GGTTGAACATTATACAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCAt > 2:1696460‑M1/1‑91 (MQ=255) gtttgtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCAtt > 2:593861‑M2/29‑91 (MQ=255) GTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCAtt < 1:3750641‑M1/91‑1 (MQ=255) tggtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTaa > 2:121671‑M2/27‑91 (MQ=255) tggtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTaa > 2:2842966‑M2/27‑91 (MQ=255) ggtacattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTaaa > 1:1098811‑M2/26‑91 (MQ=255) aaCATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTaaaa < 1:3246726/91‑1 (MQ=255) cattgaataatgttcaacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTg > 2:2639910‑M2/22‑91 (MQ=255) attattCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAGTAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTg > 1:3080681/1‑91 (MQ=255) ttattCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATCAAAATTGa > 2:3373163/1‑91 (MQ=255) tattCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGat > 2:3671934/1‑91 (MQ=255) attCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGata < 2:2731599/91‑1 (MQ=255) ttCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGatat > 2:2097913/1‑91 (MQ=255) tCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGAtata > 1:2546186/1‑91 (MQ=255) cAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATaa > 1:2875488/1‑91 (MQ=255) aTGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAAt > 1:589010/1‑91 (MQ=255) aTGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAAt < 1:2197543/91‑1 (MQ=255) gTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTa > 1:657374/1‑91 (MQ=255) gTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTa > 1:2911802/1‑91 (MQ=255) tACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTaa < 1:2389395/91‑1 (MQ=255) ccAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATc > 1:2088074/1‑91 (MQ=255) ccAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATc < 1:2574915/91‑1 (MQ=255) aacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCa > 2:1067475‑M2/7‑91 (MQ=255) aacctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCa > 2:3701332‑M2/7‑91 (MQ=255) acctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCAt > 2:1000544‑M2/6‑91 (MQ=255) acctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCAt > 1:3600957‑M2/6‑91 (MQ=255) acctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCAt < 1:211049‑M2/86‑1 (MQ=255) acctcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCAt > 2:3692353‑M2/6‑91 (MQ=255) tcACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATACATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATaaa > 2:1153672‑M2/3‑91 (MQ=255) cACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAg < 2:2271054‑M2/90‑1 (MQ=255) actcaAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGt > 1:3153407/1‑91 (MQ=255) actcaAATTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAGAGt > 1:3012506/1‑91 (MQ=255) | GACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGT > USA300TCH1516_ALE/1671719‑1671899 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |