| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1676788 | 181 (0.950) | 24 (0.130) | 14/156 | NT | 11.7% | intergenic (‑344/‑75) | ccpN/glyQS | Transcriptional repressor CcpN/Glycine‑‑tRNA ligase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1676835 | 186 (1.000) | intergenic (‑391/‑28) | ccpN/glyQS | Transcriptional repressor CcpN/Glycine‑‑tRNA ligase | |||||
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
ACGTAACTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCTGG > USA300TCH1516_ALE/1676745‑1676924 | aCGTAACTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATgggg < 2:1039083/91‑1 (MQ=255)aCGTAACTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATgggg < 2:1870938/91‑1 (MQ=255)aCGTAACTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATgggg < 1:419316/91‑1 (MQ=255)aCGTAACTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATgggg < 2:1075866/91‑1 (MQ=255) cGTAACTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGc > 2:2911085‑M2/1‑90 (MQ=255) tAACTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGt > 1:52817/1‑91 (MQ=255) aCTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGttt > 1:1455108/1‑91 (MQ=255) ttATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTc > 2:3172919/1‑91 (MQ=255) aTTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCAt < 1:3691085/91‑1 (MQ=255) ttttGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTACCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATg > 2:843534/1‑91 (MQ=255) tttGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGt < 1:1785289/91‑1 (MQ=255) tGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTCATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTAt < 2:2207416/91‑1 (MQ=255) gTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATg < 2:914743/91‑1 (MQ=255) gTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATg > 1:586783/1‑91 (MQ=255) tattatATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATga > 2:3520945/1‑91 (MQ=255) attatATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATgag < 2:643383/91‑1 (MQ=255) atataCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATgaggag < 2:19550/91‑1 (MQ=255) ataCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGagag < 2:136679/91‑1 (MQ=255) ataCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGagag < 1:3067339/91‑1 (MQ=255) taCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAgg > 2:1106263/1‑91 (MQ=255) taCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAgg > 1:3810621/1‑91 (MQ=255) aCAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGt > 2:2452340/1‑91 (MQ=255) cAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGT‑ACTT‑CCATGGGAcgagttaatattttaaattgtatatc < 2:1184104‑M2/91‑27 (MQ=255) tttAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAAtt < 2:2535416/91‑1 (MQ=255) tttAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAAtt < 2:3260583/91‑1 (MQ=255) tAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTAt < 1:2931251/91‑1 (MQ=255) aaaTATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATgg > 1:785951/1‑91 (MQ=255) aaTATTAACTCGTCCCATGGAAGTAGAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGc < 2:3652395/91‑1 (MQ=255) aaTATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGc < 1:3343207/91‑1 (MQ=255) aaTATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGc < 1:931708/91‑1 (MQ=255) tatTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaa < 2:381245‑M2/91‑35 (MQ=255) atTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCaaa < 2:2818949/91‑1 (MQ=255) ttAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaata < 2:3636543‑M2/91‑37 (MQ=255) tAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAg < 1:2131260/91‑1 (MQ=255) aaCTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataag < 2:2323093‑M2/91‑39 (MQ=255) aCTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagt < 1:1686765‑M2/91‑40 (MQ=255) aCTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGat > 1:2809661/1‑91 (MQ=255) aCTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGat > 1:688608/1‑91 (MQ=255) cTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagtt < 1:2583306‑M2/91‑41 (MQ=255) tCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGatat > 1:1003353/1‑91 (MQ=255) tCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGatat > 1:3023966/1‑91 (MQ=255) cGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATg > 2:690176/1‑91 (MQ=255) tCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGa < 2:3123290/91‑1 (MQ=255) cccATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGAt < 2:3218525/91‑1 (MQ=255) cccATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGAt > 2:315000/1‑91 (MQ=255) cccATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGAt < 1:3385391/91‑1 (MQ=255) ccATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATa < 1:2353675/91‑1 (MQ=255) aTGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACa > 1:2604954/1‑91 (MQ=255) ggAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAAt < 1:2787935/91‑1 (MQ=255) ggAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGATATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaa < 2:2214174‑M2/91‑51 (MQ=255) aaGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaacc < 1:3131376‑M2/91‑53 (MQ=255) aaGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaacc < 2:866893‑M2/91‑53 (MQ=255) aaGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaacc < 2:1217122‑M2/91‑53 (MQ=255) aaGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTg > 2:2822450/1‑91 (MQ=255) aaGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTg < 1:96423/91‑1 (MQ=255) aaGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTg < 2:3547508/91‑1 (MQ=255) aaGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTg < 2:2349848/91‑1 (MQ=255) aGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGAcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaaccc < 2:2953934‑M2/91‑54 (MQ=255) gTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGtt > 2:109361/1‑91 (MQ=255) tAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGCGGAGAGGTACTTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGttt > 2:566517/1‑91 (MQ=255) tAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGttt > 2:1579035/1‑91 (MQ=255) tAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGttt > 1:2207591/1‑91 (MQ=255) aaGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCa > 1:2416902/1‑91 (MQ=255) aaGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGAcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaacccgcgg < 1:1247623‑M2/91‑58 (MQ=255) gCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCAtt < 1:3639024/91‑1 (MQ=255) atatTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATa > 1:2461121/1‑76 (MQ=255) tatTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGc < 1:548472/91‑1 (MQ=255) tatTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGc < 1:87751/91‑1 (MQ=255) atTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCa < 2:3022474/91‑1 (MQ=255) tttACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCaa < 1:1395127/91‑1 (MQ=255) taaatATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCaaa > 1:2314366/5‑91 (MQ=255) tACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCaaaa > 2:413636/1‑91 (MQ=255) cTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAaca > 2:2474697/1‑91 (MQ=255) cTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAaca > 1:465071/1‑91 (MQ=255) cTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAaca < 1:1073064/91‑1 (MQ=255) tATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAacac > 2:1205155/1‑91 (MQ=255) tATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAacac < 2:3406978/91‑1 (MQ=255) tATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTAATTAGCAAAacac < 2:517211/91‑1 (MQ=255) aTGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAAcaca < 1:2690546/91‑1 (MQ=255) tGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACag < 2:3045886/91‑1 (MQ=255) gCTGTTATTTACCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACaga < 2:2797696/91‑1 (MQ=255) tGTTATTTTCCATGGGGcgagttaatattttaaattgtatataatacaaaataagttacgtatttaacccgcggttccacccaaattagtg < 1:1546971‑M2/91‑75 (MQ=255) tGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAgg < 2:932635/91‑1 (MQ=255) gTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGt > 1:1037499/1‑91 (MQ=255) ttATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAggat > 2:1025608/1‑89 (MQ=255) ttATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGtt > 2:1820906/1‑91 (MQ=255) ttATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGtt > 2:1482292/1‑91 (MQ=255) ttATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGtt > 2:1375729/1‑91 (MQ=255) ttATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGtt > 2:2634150/1‑91 (MQ=255) ttATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGATAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGtt < 2:1670545/91‑1 (MQ=255) tttCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTtgt < 2:770350/91‑1 (MQ=255) tttCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTtgt > 1:1598383/1‑91 (MQ=255) tCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTgtgt < 1:2452340/91‑1 (MQ=255) ccATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGtt > 2:2857906/1‑91 (MQ=255) ccATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGtt < 1:829261/91‑1 (MQ=255) cATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTc > 2:2469882/1‑91 (MQ=255) aTGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTcc < 1:315000/91‑1 (MQ=255) gggCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCtc > 2:3848214/1‑90 (MQ=255) gggCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCTg > 1:2088732/1‑91 (MQ=255) ggCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCTgg < 1:3474958/91‑1 (MQ=255) | ACGTAACTTATTTTGTATTATATACAATTTAAAATATTAACTCGTCCCATGGAAGTAAAGCATATTTACTATGCTGTTATTTTCCATGGGGCGTTTTCATGTATGAGGAGAGGTAATTATGGCAAAAGATATGGATACAATTGTTTCATTAGCAAAACACAGAGGTTTTGTGTTCCCTGG > USA300TCH1516_ALE/1676745‑1676924 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |