New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1870432 = | 192 (1.010) | 11 (0.060) | 7/150 | NT | 5.7% | coding (82/792 nt) | srkA | Stress response kinase A |
? | USA300TCH1516_ALE | 1870465 = | 183 (1.030) | coding (49/792 nt) | srkA | Stress response kinase A |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
CTGCTGATAATGCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTAGAAAT > USA300TCH1516_ALE/1870375‑1870554 | ctgctgATAATGCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGc < 1:3377330/91‑1 (MQ=255) tgctgATAATGCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGca > 2:448612/1‑91 (MQ=255) tgctgATAATGCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGca > 1:368773/1‑91 (MQ=255) tgATAATGCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGcacca < 1:627024/91‑1 (MQ=255) gATAATGCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGcaccac > 1:239605/1‑91 (MQ=255) aTAATGCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCaccacc > 1:835095/1‑91 (MQ=255) aTAATGCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCaccacc > 1:1728468/1‑91 (MQ=255) aTAATGCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCaccacc > 1:482375/1‑91 (MQ=255) aTGCCGCAAGAAATGGGTTTGAATTTCGTTTTATAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACctgc < 2:3237551/91‑1 (MQ=255) gCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACctgctg > 2:3589262/1‑91 (MQ=255) ccGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCNATCTTGTTCAGNCATANATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGa > 1:1417593/1‑91 (MQ=255) ccGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGa > 2:2489319/1‑91 (MQ=255) ccGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGa > 1:2095923/1‑91 (MQ=255) cGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGaa < 2:3519331/91‑1 (MQ=255) gCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAAt < 2:2527834/91‑1 (MQ=255) cAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATc > 2:1035247/1‑91 (MQ=255) aaTAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCa < 1:3706057/91‑1 (MQ=255) aTAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCaa < 1:810778/91‑1 (MQ=255) aTAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCaa > 2:1527943/1‑91 (MQ=255) tAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAg > 2:275887/1‑91 (MQ=255) tAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAg < 2:2088333/91‑1 (MQ=255) aTGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAgtgt > 1:1539127/1‑91 (MQ=255) aTGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAgtgt > 2:2720506/1‑91 (MQ=255) tGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTc < 2:2807605/91‑1 (MQ=255) ggATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTcc > 1:916584/1‑91 (MQ=255) gATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAAGTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCa < 1:3616977/91‑1 (MQ=255) gATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCa > 1:1880526/1‑91 (MQ=255) aTTTGAATTTCGGTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCAc < 2:1646168/91‑1 (MQ=255) tttGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCAcc > 2:2377307/1‑91 (MQ=255) tttGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCAcc > 1:2199758/1‑91 (MQ=255) tttGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCAcc < 2:369324/91‑1 (MQ=255) gAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTa > 2:2708001/1‑91 (MQ=255) aaTTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTaa > 1:1392254/1‑91 (MQ=255) aaTTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTaa < 1:2679198/91‑1 (MQ=255) aTTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAAt < 1:951520/91‑1 (MQ=255) aTTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAAt > 1:2146326/1‑91 (MQ=255) aTTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAAt < 2:1624513/91‑1 (MQ=255) aTTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAAt > 1:3549557/1‑91 (MQ=255) tCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGa < 1:3554543/91‑1 (MQ=255) tCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGa > 2:3396661/1‑91 (MQ=255) cGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGAt < 1:3191772/91‑1 (MQ=255) gTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACctgct < 2:1912267/65‑1 (MQ=255) gTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATa < 2:660601/91‑1 (MQ=255) gTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATa < 2:3266362/91‑1 (MQ=255) tttAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATaaa > 2:1301562/1‑91 (MQ=255) tttAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATaaa > 1:1986288/1‑91 (MQ=255) tttAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATaaa > 2:2746736/1‑91 (MQ=255) ttAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATaaaa < 1:2663854/91‑1 (MQ=255) ttAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATACGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATaaaa > 1:1448508/1‑91 (MQ=255) tAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAAc < 2:1165699/91‑1 (MQ=255) tAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAAc < 2:2897807/91‑1 (MQ=255) aaaaaCAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACt > 1:2055469/1‑91 (MQ=255) aaaaCAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAgtgt > 1:2485758/1‑70 (MQ=255) aaaaCAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTg < 2:735839/91‑1 (MQ=255) acaacTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTc > 1:3064889/1‑91 (MQ=255) caacTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTcc > 2:2826913/1‑91 (MQ=255) caacTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTcc < 1:2952128/91‑1 (MQ=255) caacTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTcc < 1:275887/91‑1 (MQ=255) cTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAAc > 1:2464382/1‑91 (MQ=255) ttttGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCACCt > 1:536297/1‑91 (MQ=255) ttttGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACt > 1:2892143/1‑91 (MQ=255) tGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGt < 2:188890/91‑1 (MQ=255) gtgcatctggtgaagcatatatggctgaacaagatgCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTc > 1:1924178‑M2/37‑91 (MQ=255) tCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTcc < 1:1888253/91‑1 (MQ=255) ccATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCa > 2:2268428/1‑91 (MQ=255) ATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCGCCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCGTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCAcc > 1:3448943‑M1/1‑91 (MQ=255) tggtgaagcatatatggctgaacaagatgGACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCa > 2:1661150‑M2/30‑91 (MQ=255) TTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCa > 2:835095‑M1/1‑91 (MQ=255) gtgaagcatatatggctgaacaagatgCACCACCTGCTGAATCAAGTTTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACt > 1:3882212‑M2/28‑91 (MQ=255) ttCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACtt > 1:2286478/1‑91 (MQ=255) tgaagcatatatggctgaacaagatgCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACtt > 2:1216362‑M2/27‑91 (MQ=255) tgaagcatatatggctgaacaagatgCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACtt > 1:552623‑M2/27‑91 (MQ=255) tCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACttt > 1:1913760/1‑91 (MQ=255) gaagcatatatggctgaacaagatgCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACttt > 2:1363376‑M2/26‑91 (MQ=255) cAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTc > 1:3413246/1‑91 (MQ=255) cAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTc > 1:325108/1‑91 (MQ=255) aagcatatatggctgaacaagatgCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTc > 2:546468‑M2/25‑91 (MQ=255) aGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCa > 1:100423/1‑91 (MQ=255) gCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCaa < 2:2236894/91‑1 (MQ=255) gCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCaa < 2:1941488/91‑1 (MQ=255) ccATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAAt > 1:3022434/1‑91 (MQ=255) atatGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGa < 2:211615/91‑1 (MQ=255) tatGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGaa < 2:3560005/91‑1 (MQ=255) atGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCGATTAGaaa < 2:3285276/91‑1 (MQ=255) atGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTCGaaa > 1:3231023/1‑91 (MQ=255) atGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGaaa < 2:3138434/91‑1 (MQ=255) tGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTCATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGaaaa > 2:2988525/1‑91 (MQ=255) tGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGaaaa > 2:549097/1‑91 (MQ=255) cACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGct > 2:2429702/1‑91 (MQ=255) cACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGcc > 2:2430206/1‑90 (MQ=255) ccAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGctct > 2:2631944/1‑91 (MQ=255) cAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTa > 1:2218398/1‑91 (MQ=255) agatgCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTAg < 1:1139240‑M2/86‑1 (MQ=255) atgCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTCGaa > 1:3006581‑M2/4‑91 (MQ=255) atgCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTAGaa < 1:2795459‑M2/88‑1 (MQ=255) atgCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTAGaa > 2:3818433‑M2/4‑91 (MQ=255) tgCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTTCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTAGaaa > 1:641119‑M2/3‑91 (MQ=255) tgCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTAGaaa > 1:2559065‑M2/3‑91 (MQ=255) gCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTAGAAAt < 1:1301383‑M2/90‑1 (MQ=255) gCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTAGAAAt < 1:392639‑M2/90‑1 (MQ=255) | CTGCTGATAATGCCGCAATAAATGGATTTGAATTTCGTTTTAAAAACAACTTTTGTCCATCTTGTTCAGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAAAATGGCTCTAGAAAT > USA300TCH1516_ALE/1870375‑1870554 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |