| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1928287 = | 180 (0.940) | 25 (0.150) | 13/140 | NT | 14.0% | intergenic (‑241/+60) | USA300HOU_RS09565/USA300HOU_RS09575 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1928329 = | 151 (0.910) | intergenic (‑283/+18) | USA300HOU_RS09565/USA300HOU_RS09575 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
ATTTGATTGACGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGCCGAATATATA > USA300TCH1516_ALE/1928239‑1928419 | tatatatttttaggaattttaaagaaatgacatgaaacaaattaggatTGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCaa > 2:938282‑M1/49‑91 (MQ=255)attCGATTGACGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCaa < 1:3496801/91‑1 (MQ=255) ttgattgaCGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATg < 1:489671/91‑1 (MQ=255) ttgattgaCGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATg > 1:1816502/1‑91 (MQ=255) atatttttaggaattttaaagaaatgacatgaaacaaattagcatTGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGc > 2:212921‑M1/46‑91 (MQ=255) gattgaCGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCt > 2:2767010/1‑91 (MQ=255) gattgaCGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCt < 2:60729/91‑1 (MQ=255) atttttaggaattttaaagaaatgacatgaaacaaattagcatTGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTa > 2:896430‑M1/44‑91 (MQ=255) attgaCGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTa > 1:1730277/1‑91 (MQ=255) ttgaCGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTaa < 1:2891985/91‑1 (MQ=255) tgaCGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAAt < 2:2769616/91‑1 (MQ=255) tgaCGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAAt < 1:155199/91‑1 (MQ=255) gaCGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAAtt < 1:3293551/91‑1 (MQ=255) aCGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAAttt < 2:398556/91‑1 (MQ=255) ccAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATg < 2:245219/91‑1 (MQ=255) aaTTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCGTAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTc < 2:3218012/91‑1 (MQ=255) aTTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCa > 2:1901053/1‑91 (MQ=255) ttACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCt < 1:642648/91‑1 (MQ=255) ttACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCt < 2:2899324/91‑1 (MQ=255) tACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCtt > 1:1468912/1‑91 (MQ=255) aCTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCttt < 1:3571260/91‑1 (MQ=255) aCTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCttt < 2:3776847/91‑1 (MQ=255) cTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCttaa < 1:287602/91‑3 (MQ=255) cTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTa > 2:944987/1‑91 (MQ=255) cTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTa > 1:2667649/1‑91 (MQ=255) cTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTa > 1:997238/1‑91 (MQ=255) ttCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTaa > 2:1145146/1‑91 (MQ=255) tCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTaaa > 2:107025/1‑91 (MQ=255) cATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTaaaa > 1:1869000/1‑91 (MQ=255) tGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAAtt > 2:2875425/1‑91 (MQ=255) tGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAAtt < 1:3682872/91‑1 (MQ=255) gCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGGCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTc < 1:3273566/91‑1 (MQ=255) gCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTc < 1:3147269/91‑1 (MQ=255) gCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAACGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTc > 1:3442739/1‑91 (MQ=255) ctctTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTCGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTcc < 2:2222097/91‑1 (MQ=255) tctTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCt < 1:132102/91‑1 (MQ=255) tctTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCt < 1:2477196/91‑1 (MQ=255) ttttAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTaa < 2:1730277/91‑1 (MQ=255) tttAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTaaa < 1:1894314/91‑1 (MQ=255) tttAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTaaa < 1:403156/91‑1 (MQ=255) ttAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTaaaa < 1:1188405/91‑1 (MQ=255) tAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTaaaaa > 2:2538077/1‑91 (MQ=255) tAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTaaaaa < 2:1468912/91‑1 (MQ=255) tAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTaaaaa > 2:3169205/1‑91 (MQ=255) tAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTaaaaa > 2:576992/1‑91 (MQ=255) tagcattggctatgaagaaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAat > 2:78762‑M2/49‑91 (MQ=255) tagcattggctatgaagaaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAat > 1:3215256‑M2/49‑91 (MQ=255) gcattggctatgaagaaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAatat > 1:225329‑M2/47‑91 (MQ=255) cattggctatgaagaaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAatata > 1:3818023‑M2/46‑91 (MQ=255) aTGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAAtatata < 2:2906897/91‑1 (MQ=255) TGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATaa > 1:2767010‑M1/1‑91 (MQ=255) ggctatgaagaaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATaaa > 2:3607321‑M2/42‑91 (MQ=255) GGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATaaa < 2:829949‑M1/91‑1 (MQ=255) GGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATaaa < 1:878710‑M1/91‑1 (MQ=255) tatgaagaaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTa > 1:1247269‑M2/39‑91 (MQ=255) tatgaagaaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTa > 1:1242489‑M2/39‑91 (MQ=255) TATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTa < 2:3514992‑M1/91‑1 (MQ=255) TATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTa < 2:731031‑M1/91‑1 (MQ=255) atgaagaaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTaa > 2:666690‑M2/38‑91 (MQ=255) atgaagaaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTaa > 1:691977‑M2/38‑91 (MQ=255) atgaagaaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTaa > 1:3701800‑M2/38‑91 (MQ=255) ATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTaa < 1:3764209‑M1/91‑1 (MQ=255) ATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTaa > 1:1996584‑M1/1‑91 (MQ=255) TGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAGACTaaa > 2:2296360‑M1/1‑91 (MQ=255) TGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTaaa < 1:2584872‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGACAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTATTTAAAATAAATAAAAATATATAAACTAAAAg > 2:311191‑M1/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCa < 1:196375/91‑1 (MQ=255) aaaTTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCa < 1:2134454/91‑1 (MQ=255) aaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCAt > 1:589145‑M2/32‑91 (MQ=255) aaatctatggggatagaatttttcatagccaATGCTAATTTGCTTCATGTCATTTCTTTAAAAATCCTAAAAATATATAAACTAAAAGcaa > 2:454995‑M2/32‑90 (MQ=255) ttCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATaa > 2:1241675/1‑91 (MQ=255) tCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAg < 1:851777/91‑1 (MQ=255) tATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTa < 2:1821789/91‑1 (MQ=255) tATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTa > 1:2815142/1‑91 (MQ=255) aTCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTaa < 1:2753354/91‑1 (MQ=255) tCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTaa < 2:3278070/78‑1 (MQ=255) ccccATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAaca < 1:1531745/91‑1 (MQ=255) cccATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAacac < 2:1364182/91‑1 (MQ=255) cccATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAacac < 1:240134/91‑1 (MQ=255) cccATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAacac < 1:240149/91‑1 (MQ=255) ccATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAAcaca < 1:165082/91‑1 (MQ=255) ccATAGATGTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAGATATATAAACTAAAAGCATAAGTAAcaca < 2:3375758/91‑1 (MQ=255) tAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCa < 1:1286646/91‑1 (MQ=255) aGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATAAATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCaa < 2:3257253/91‑1 (MQ=255) gATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCaaa > 2:2956617/1‑91 (MQ=255) aTTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCaaaa < 1:933417/91‑1 (MQ=255) ttcttcATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAAt < 1:2260390/91‑1 (MQ=255) tcttcATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAAtt > 2:782716/1‑91 (MQ=255) tcttcATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAAtt > 2:857012/1‑91 (MQ=255) ttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGc < 2:1997320‑M2/81‑1 (MQ=255) ttcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGc > 2:866202‑M2/11‑91 (MQ=255) tcatagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGcc > 2:1673577‑M2/10‑91 (MQ=255) catagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGCCg > 1:3812103‑M2/9‑91 (MQ=255) catagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGCCg < 1:2679055‑M2/83‑1 (MQ=255) tagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGCCGaa < 1:1017551‑M2/85‑1 (MQ=255) tagccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGCCGaa < 1:121676‑M2/85‑1 (MQ=255) gccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGCCGAata < 1:663578‑M2/87‑1 (MQ=255) gccaATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGCCGAata > 2:1057949‑M2/5‑91 (MQ=255) caATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGCCGAatata > 2:972958‑M2/3‑91 (MQ=255) aTGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGCCGAAtatata > 1:780569/1‑91 (MQ=255) | ATTTGATTGACGGTTTTCCAATTTTTTACTTCATGCTCTTTTAAAAAATGGCTATGAAAAATTCTATCCCCATAGATTTCTTCATAGCCAATGCTAATTTGTTTCATGTCATTTCTTTAAAATTCCTAAAAATATATAAACTAAAAGCATAAGTAACACAGCAAAAATTGCCGAATATATA > USA300TCH1516_ALE/1928239‑1928419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |