New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2252663 | 137 (0.720) | 13 (0.070) | 7/148 | NT | 8.4% | intergenic (+99/+53) | luxS/USA300HOU_RS11525 | S‑ribosylhomocysteine lyase/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2252697 | 158 (0.900) | intergenic (+133/+19) | luxS/USA300HOU_RS11525 | S‑ribosylhomocysteine lyase/hypothetical protein |
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
TTTTACAATCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGTTGCCATGTTGGCAA > USA300TCH1516_ALE/2252608‑2252787 | ttttACAATCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTct > 2:3860653/1‑90 (MQ=255) ttttACAATCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCc > 1:2839760‑M2/1‑90 (MQ=255) ttttACAATCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCc > 1:842304‑M2/1‑90 (MQ=255) tttACAATCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCcg < 1:1358974‑M2/91‑3 (MQ=255) gttcaatCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCcga < 2:2858146‑M2/88‑4 (MQ=255) tACAATCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCcgat < 2:2560684‑M2/91‑5 (MQ=255) cAATCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCcgattt > 1:2473640‑M2/1‑85 (MQ=255) aaTCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGattta > 1:121798/1‑91 (MQ=255) aaTCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGattta < 2:3479578/91‑1 (MQ=255) aaTCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGattta > 2:3248058/1‑91 (MQ=255) tCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGatttatt > 1:1000446/1‑91 (MQ=255) tCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGatttatt < 1:575098/91‑1 (MQ=255) tGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAAc > 1:814618/1‑91 (MQ=255) tGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAAc > 1:3760107/1‑91 (MQ=255) tGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAAc < 1:1941536/91‑1 (MQ=255) gTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAAcc > 2:3554198/1‑91 (MQ=255) gTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAAcc < 1:704331/91‑1 (MQ=255) tCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCa < 1:610812/91‑1 (MQ=255) tCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCa < 1:1040902/91‑1 (MQ=255) ccAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCAc < 2:2083756/91‑1 (MQ=255) ccAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCAc < 1:1157184/91‑1 (MQ=255) ccAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCAc < 2:1214911/91‑1 (MQ=255) cAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACt < 2:3799154/91‑1 (MQ=255) aaCTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACta < 2:2749272/91‑1 (MQ=255) aaCTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACta > 2:2038445/1‑91 (MQ=255) aaCTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACta < 2:1988452/91‑1 (MQ=255) aaCTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACta > 1:1721124/1‑91 (MQ=255) actgcttttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACtat < 1:2625390‑M2/82‑1 (MQ=255) actgcttttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACtat < 1:912354‑M2/82‑1 (MQ=255) ctgcttttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACtata < 1:307643‑M2/83‑1 (MQ=255) tgcttttTATTATGCTTCAAAGTCACAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATaa < 1:3627807‑M2/84‑1 (MQ=255) cttttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCAAAAAAAAAAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAAtt < 2:2683922‑M2/86‑1 (MQ=255) cttttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAAGCGAAAAAAAAAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAAtt < 2:3622163‑M2/86‑1 (MQ=255) ttttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAAttt < 1:23660‑M2/87‑1 (MQ=255) ttttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAAttt < 2:1597537‑M2/87‑1 (MQ=255) ttttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAAttt > 1:3407052‑M2/5‑91 (MQ=255) tttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATTAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCActataaaatt < 2:3058766‑M2/88‑5 (MQ=255) tttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTc < 2:617993‑M2/88‑1 (MQ=255) ttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCt < 1:1327333‑M2/89‑1 (MQ=255) ttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCt < 2:1648969‑M2/89‑1 (MQ=255) ttTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCt < 1:137796‑M2/89‑1 (MQ=255) tTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCtt > 1:2960565‑M2/2‑91 (MQ=255) tTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCtt < 1:3017503‑M2/90‑1 (MQ=255) attatGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTaa > 2:501689/1‑91 (MQ=255) ttatGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAAt < 2:676873/91‑1 (MQ=255) tGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAg < 1:1053404/91‑1 (MQ=255) gCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGt > 2:905689/1‑91 (MQ=255) gCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGt < 1:1143810/91‑1 (MQ=255) aaGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCAtt < 2:412828/91‑1 (MQ=255) gTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTccc < 1:3812901/86‑1 (MQ=255) tCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAac < 1:3147804/91‑1 (MQ=255) cAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAaca < 1:3196161/91‑1 (MQ=255) cAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAaca < 2:1086744/91‑1 (MQ=255) cAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAaca < 1:3192514/91‑1 (MQ=255) cAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAaca < 2:2252716/91‑1 (MQ=255) cAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAaca > 2:213477/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCcgattttttgactttgaagcataataaaaagcagttggacaatggcga < 1:3283583‑M2/91‑49 (MQ=255) aaaaaaTCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCcgattttttgactttgaagcataataaaaagcagttggacaatggcga < 1:1494226‑M2/91‑49 (MQ=255) aaaaaaTCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAacac < 2:3681189/91‑1 (MQ=255) aaaaTCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACGCGa > 1:3010106/1‑91 (MQ=255) aaaTCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGaa > 2:396724/1‑91 (MQ=255) aaTCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCcgattttttgactttgaagcataataaaaagcagttggacaatggcgattgt < 1:3502146‑M2/91‑53 (MQ=255) aaTCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCcgattttttgactttgaagcataataaaaagcagttggacaatggcgattgt < 2:1953469‑M2/91‑53 (MQ=255) aaTCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAAc < 1:461661/91‑1 (MQ=255) aaTCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAAc > 2:1786866/1‑91 (MQ=255) aTCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCcgattttttaactttgaagcataataaaaagcagttggacaatggcgattgta < 1:3865864‑M2/91‑54 (MQ=255) tCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCcgattttttgactttgaagcataataaaaagcagttggacaatggcgattgtaa < 2:900384‑M2/91‑55 (MQ=255) tCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCAt < 2:852290/79‑1 (MQ=255) tCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTg > 2:3007300/1‑91 (MQ=255) tCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTg > 2:590017/1‑91 (MQ=255) cGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGc < 2:188586/91‑1 (MQ=255) aCAAATGAAAAAGTAATATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATa > 2:2507351/1‑91 (MQ=255) aCAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACCCGAACTGCATa > 2:2962911/1‑91 (MQ=255) aaaTGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATGAGTCCCATTAACACGAACTGCATAgg > 2:3085193/1‑91 (MQ=255) tGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTaa > 2:940492/1‑91 (MQ=255) gAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAAc < 1:3689555/91‑1 (MQ=255) aaaaGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCt > 2:2067678/1‑91 (MQ=255) aaaaGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATGTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCt < 2:3185786/91‑1 (MQ=255) aaaaGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGACAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCt > 2:2365805/1‑91 (MQ=255) aaGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTa < 1:3371607/91‑1 (MQ=255) aGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTaa > 1:2564871/1‑91 (MQ=255) aGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAAATAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTaa > 2:3834905/1‑91 (MQ=255) tAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAat < 2:1811861/91‑1 (MQ=255) tAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAat < 2:2804606/91‑1 (MQ=255) tAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAat < 2:3491201/91‑1 (MQ=255) aaaaTCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAata < 1:1865264/91‑1 (MQ=255) aaaTCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAatat < 2:1118494/91‑1 (MQ=255) aTCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAg < 2:1969405/91‑1 (MQ=255) aTCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAg < 2:3391324/91‑1 (MQ=255) aTCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAg > 1:1879576/1‑91 (MQ=255) tCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGt < 1:2184584/91‑1 (MQ=255) cTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGtt > 1:1772990/1‑91 (MQ=255) cTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGtt > 1:1771607/1‑91 (MQ=255) ttAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGTTGc < 1:309089/91‑1 (MQ=255) aaCATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGTTGCCa < 1:965974/91‑1 (MQ=255) ttGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGTTGCCATGTTg < 2:1850789/91‑1 (MQ=255) gTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGTTGCCATGTTGGc < 1:1591159/91‑1 (MQ=255) tCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGTTGCCATGTTGGCa < 2:3433036/91‑1 (MQ=255) tCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGTTGCCATGTTGGCa < 2:3432853/91‑1 (MQ=255) ccGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGTTGCCATGTTGGCaa < 1:2134021/91‑1 (MQ=255) | TTTTACAATCGCCATTGTCCAACTGCTTTTTATTATGCTTCAAAGTCAAAAAATCGAACAAATGAAAAAGTAAAATCTTTAACATTTGTCCGATTTATTTGAGAACCACTATAATTTCTTAATTAGTCCCATTAACACGAACTGCATAGGTAACCTTAAATATAGTTGCCATGTTGGCAA > USA300TCH1516_ALE/2252608‑2252787 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |