New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2525159 = | 214 (1.120) | 11 (0.060) | 7/148 | NT | 5.5% | coding (270/732 nt) | sirB | Sirohydrochlorin ferrochelatase |
? | USA300TCH1516_ALE | 2525195 = | 181 (1.030) | coding (234/732 nt) | sirB | Sirohydrochlorin ferrochelatase |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
TCTCATTAAAGGATGTGTGCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAATTTTAAAATGGTCAACCCCACTTTGAATCAACGTCGTCATTACCGTC > USA300TCH1516_ALE/2525105‑2525285 | tctcATTAAAGGATGTGTGCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGtata > 2:502874/1‑91 (MQ=255) tcATTAAAGGATGTGTGCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATc > 2:3058241/1‑91 (MQ=255) cATTAAAGGATGTGTGCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATcc < 1:74999/91‑1 (MQ=255) ttAAAGGATGTGTGCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCtt < 1:2150688/91‑1 (MQ=255) ttAAAGGATGTGTGCCAAGTGGCTCACTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCtt > 2:2628091/1‑91 (MQ=255) aaGGATGTGTGCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTgag > 2:2271740/1‑91 (MQ=255) ggATGTGTGCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGAt < 1:822749/91‑1 (MQ=255) ggACGTGTGCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTTAGAt < 1:3058241/91‑1 (MQ=255) gATGTGTGCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATa < 2:2732285/91‑1 (MQ=255) gATGTGTGCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATa < 2:599023/91‑1 (MQ=255) gATGTGTGCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATa < 1:3198464/91‑1 (MQ=255) tgtgtgCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAAt < 2:1616802/91‑1 (MQ=255) tgtgtgCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAAt > 2:653635/1‑91 (MQ=255) gtgtgCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATg > 2:2839135/1‑91 (MQ=255) gtgCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCa > 1:772727/1‑91 (MQ=255) gtgCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCa < 1:2563020/91‑1 (MQ=255) tgCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCAt < 2:2759623/91‑1 (MQ=255) tgCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCAt < 2:428743/91‑1 (MQ=255) tgCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCAt < 1:1744369/91‑1 (MQ=255) tgCCAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCAt > 1:214548/1‑91 (MQ=255) ccAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTg > 1:655353/1‑91 (MQ=255) cAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCtt > 1:3687810/1‑76 (MQ=255) cAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCtt < 2:3687810/76‑1 (MQ=255) cAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTgg > 2:3846424/1‑90 (MQ=255) cAAGTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGc < 1:123812/91‑1 (MQ=255) gTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACt < 1:2246593/91‑1 (MQ=255) gTGGCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACt < 1:636860/91‑1 (MQ=255) gCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTaaa < 2:3404157/91‑1 (MQ=255) gCTCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTaaa < 2:1953803/91‑1 (MQ=255) tCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGa > 1:2864716/1‑91 (MQ=255) tCGCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCAGTGCACTAAAGa > 1:3520947/1‑91 (MQ=255) gCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGAtt > 2:1303306/1‑91 (MQ=255) gCTTACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGAtt > 2:1032035/1‑91 (MQ=255) ttACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAg < 1:608160/91‑1 (MQ=255) tACTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGc < 1:2311287/91‑1 (MQ=255) cTTCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGA‑TAGCAAt < 2:2658108/91‑1 (MQ=255) ttCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTGAAGATTAGCAAt < 1:2981224/91‑1 (MQ=255) atgcattatctcaaggatataccgaatatcgttcatgaaatgaaacgacggtatATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAAt > 1:440970‑M2/55‑91 (MQ=255) tCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATg < 1:2928621/91‑1 (MQ=255) tCTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATg > 2:1961305/1‑91 (MQ=255) cTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATgg < 1:1126925/91‑1 (MQ=255) cTACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATgg < 2:560105/91‑1 (MQ=255) tACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGt < 1:2802432/91‑1 (MQ=255) tACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGt > 1:1819528/1‑91 (MQ=255) tACCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGt > 1:2487978/1‑91 (MQ=255) aCCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTa > 2:3530211/1‑91 (MQ=255) aCCTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTa < 1:2297681/91‑1 (MQ=255) ccTTTATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTAc > 2:1402379/1‑91 (MQ=255) ttATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAAt < 1:704059/91‑1 (MQ=255) ttATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAAt < 2:1488359/91‑1 (MQ=255) tATGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAAtt > 2:2936879/1‑91 (MQ=255) aTGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAAttt < 2:2609975/91‑1 (MQ=255) tGTCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAAtttt < 2:1836728/91‑1 (MQ=255) tCTGGATACCGTCGTTTCATTTCATGAACGATATTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAATTTTaa < 2:1102659/91‑1 (MQ=255) 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atTCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAATTTTAAAATGGTCAACCCCACTTTGAATCAACgtcgtc > 1:2047553/1‑91 (MQ=255) ttCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAATTTTAAAATGGTCAACCCCACTTTGAATCAACGTCGTCa < 1:1557697/91‑1 (MQ=255) tCGGTATATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAATTTTAAAATGGTCAACCCCACTTTGAATCAACGTCGTCAt > 1:2392330/1‑91 (MQ=255) cggtatATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAATTTTAAAATGGTCAACCCCACTTTGAATCAACGTCGTCAtt < 1:1141559‑M2/85‑1 (MQ=255) cggtatATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAATTTTAAAATGGTCAACCCCACTTTGAATCAACGTCGTCAtt < 2:3488875‑M2/85‑1 (MQ=255) cggtatATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAATTTTAAAATGGTCAACCCCACTTTGAATCAACGTCGTCAtt < 1:2529333‑M2/85‑1 (MQ=255) cggtatATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAATTTTAAAATGGTCAACCCCACTTTGAATCAACGTCGTCAtt < 2:2529500‑M2/85‑1 (MQ=255) cggtatATCCTTGAGATAATGCATTGCACTAAAGATTAGCAATGGTACAATTTTAAAATGGTCAACCCCACTTTGAATCAACGTCGTCAtt > 1:515618‑M2/7‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |