New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2818806 = | 196 (1.030) | 8 (0.050) | 7/142 | NT | 4.8% | intergenic (‑478/+67) | sraP/USA300HOU_RS14425 | Serine‑rich adhesin for platelets/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 2818849 = | 143 (0.850) | intergenic (‑521/+24) | sraP/USA300HOU_RS14425 | Serine‑rich adhesin for platelets/hypothetical protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
TAAATACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCTTTAGAA > USA300TCH1516_ALE/2818759‑2818939 | taAATACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTa > 1:1009269/1‑91 (MQ=255) taAATACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTa > 2:3128254/1‑91 (MQ=255) taAATACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTa > 2:3128782/1‑91 (MQ=255) aaaTACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTaa > 2:1969543/1‑91 (MQ=255) aaaTACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTaa > 2:3483829/1‑91 (MQ=255) aaTACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAAt < 1:1415732/91‑1 (MQ=255) aTACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATACATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAAtt > 1:2801603/1‑91 (MQ=255) aCCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCa < 2:2473360/91‑1 (MQ=255) aCCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCa < 1:604878/91‑1 (MQ=255) aCCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCa > 2:2352816/1‑91 (MQ=255) ccACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCAc < 2:701795/91‑1 (MQ=255) ccACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCAc > 2:1596379/1‑91 (MQ=255) ccACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCAc < 2:2634422/91‑1 (MQ=255) cagatgaaaagatagaagtaatttaatcattttagtgaattAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCAc > 1:1679663‑M1/42‑91 (MQ=255) aCGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTa < 2:393015/91‑1 (MQ=255) gACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTaaa > 2:1089158/1‑91 (MQ=255) aCATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGGATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTCAGGATGCATTTGATTCACTaaaa > 2:2958386/1‑91 (MQ=255) aCATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTaaaa > 1:2211485/1‑91 (MQ=255) atatTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATg < 1:221544/91‑1 (MQ=255) atatTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATg > 1:2703920/1‑91 (MQ=255) atatTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATg > 1:3194436/1‑91 (MQ=255) atatTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATg < 2:1392759/91‑1 (MQ=255) atTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGAt < 1:2868417/91‑1 (MQ=255) ttGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTAGTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGAtt < 1:3073430/91‑1 (MQ=255) tttAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAAt < 1:1417062/91‑1 (MQ=255) tttAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAAt < 1:997497/91‑1 (MQ=255) aCATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACt < 2:2603467/91‑1 (MQ=255) aTTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTta < 1:3742063/91‑1 (MQ=255) aTTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAAGTCACTAAAATGATTAAATTACTta > 2:3606738/1‑91 (MQ=255) tttCATTTATAAAGAGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTtata > 2:3300771/1‑91 (MQ=255) ttCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTatat > 2:1256064/1‑91 (MQ=255) ttCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTatat > 2:855252/1‑91 (MQ=255) ttCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTatat < 1:1531562/91‑1 (MQ=255) ttCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTatat < 2:667079/91‑1 (MQ=255) tCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATc < 1:3423953/91‑1 (MQ=255) cATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCt > 2:274133/1‑91 (MQ=255) tttATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCttt < 2:3239824/91‑1 (MQ=255) tttATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCttt < 2:866884/91‑1 (MQ=255) tataAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTc < 2:1850272/91‑1 (MQ=255) ataAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCa < 1:1431060/91‑1 (MQ=255) gCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCtga > 1:1680082/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCtgattg > 2:1241455/1‑91 (MQ=255) AAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTgattgatt > 1:3785070‑M1/1‑91 (MQ=255) AATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTa < 2:2132799‑M1/91‑1 (MQ=255) AATGCATCGCTACTAAGTCGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTa < 2:3173065‑M1/91‑1 (MQ=255) ATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTAt < 2:155771‑M1/91‑1 (MQ=255) ATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTAt > 1:2731597‑M1/1‑91 (MQ=255) ATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTAt < 2:1358695‑M1/91‑1 (MQ=255) tgcatccttactaaacattcaacttagtagcgatgcatttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATc > 1:2247450‑M2/41‑91 (MQ=255) TGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTAt > 1:847819‑M1/1‑90 (MQ=255) TGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATc > 2:201925‑M1/1‑91 (MQ=255) TGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTGAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATc < 2:956973‑M1/91‑1 (MQ=255) GCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCg > 2:3347162‑M1/1‑91 (MQ=255) catccttactaaacattcaacttagtagcgatgcatttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGCTTGATTATCGa > 1:3516874‑M2/39‑91 (MQ=255) CATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGa < 2:1087579‑M1/91‑1 (MQ=255) CATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGa < 1:1921008‑M1/91‑1 (MQ=255) ATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGaa > 1:3209763‑M1/1‑91 (MQ=255) TCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGaaa < 1:2197226‑M1/91‑1 (MQ=255) CGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAAt < 1:840560‑M1/91‑1 (MQ=255) CGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAAt > 1:1151103‑M1/1‑91 (MQ=255) ctactaAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAAttt < 1:2353760/91‑1 (MQ=255) tactaAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATttc > 2:811292/1‑91 (MQ=255) ctaAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATttctt < 1:536447/91‑1 (MQ=255) taAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATttcttc < 2:3274617/91‑1 (MQ=255) taAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATttcttc < 2:537885/91‑1 (MQ=255) taAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATttcttc < 1:2778328/91‑1 (MQ=255) aaGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTcttcc > 2:1913650/1‑91 (MQ=255) aGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTcttcct > 2:3790935/1‑91 (MQ=255) aGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTcttcct < 2:2077988/91‑1 (MQ=255) aGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTcttcct < 1:2114466/91‑1 (MQ=255) gTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTcttcctt > 2:1963799/1‑91 (MQ=255) ttGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTcttccttc > 1:1293512/1‑91 (MQ=255) ttGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTcttccttc > 2:2792474/1‑91 (MQ=255) tGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCt > 2:423050/1‑91 (MQ=255) tGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCt > 1:1594456/1‑91 (MQ=255) tGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCt < 1:1765876/91‑1 (MQ=255) tGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCt < 2:1754911/91‑1 (MQ=255) tGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTACTTCCTTCt < 1:1954815/91‑1 (MQ=255) tGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTAATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCt < 1:3365684/91‑1 (MQ=255) aaTGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTaa < 1:3352196/91‑1 (MQ=255) tttAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCt > 1:2577151/1‑91 (MQ=255) ttAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTTAACCTg < 1:3024249/91‑1 (MQ=255) ttAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTg < 1:1251984/91‑1 (MQ=255) ttAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTg > 2:641761/1‑91 (MQ=255) aGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCt < 1:1788211/91‑1 (MQ=255) gTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTa > 2:3353236/1‑91 (MQ=255) aaGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAAc > 2:1774988/1‑91 (MQ=255) aaGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAAc > 1:2421181/1‑91 (MQ=255) aaGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCGAAACCTGCTAAc > 2:3233105/1‑91 (MQ=255) atgcatttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACtctt < 2:2707835‑M2/83‑1 (MQ=255) atgcatttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACtctt > 1:1358572‑M2/9‑91 (MQ=255) atgcatttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACtctt < 2:2544170‑M2/83‑1 (MQ=255) tgcatttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACtcttc < 1:2079093‑M2/84‑1 (MQ=255) catttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTCTCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTcttctt < 1:3281750‑M2/86‑1 (MQ=255) catttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTcttctt < 1:1546140‑M2/86‑1 (MQ=255) atttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCttt > 1:1873472‑M2/5‑91 (MQ=255) atttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCttt > 2:1808654‑M2/5‑91 (MQ=255) ttAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCTTTAg < 2:445740‑M2/89‑1 (MQ=255) aaTTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCTTTAGaa < 2:590394/91‑1 (MQ=255) aaTTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCTTTAGaa < 2:368431/91‑1 (MQ=255) | TAAATACCACGACATATTGCTTTAACATTTTCATTTATAAAGCGAAAAAATGCATCGCTACTAAGTTGAATGTTTAGTAAGGATGCATTTAATTCACTAAAATGATTAAATTACTTATATCTTTTCATCTGATTGATTATCGAAATTTCTTCCTTCTAAACCTGCTAACTCTTCTTTAGAA > USA300TCH1516_ALE/2818759‑2818939 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |