| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2082368 = | 80 (1.240) | 3 (0.050) | 3/238 | NT | 4.0% | intergenic (+9/+315) | aspC/USA300HOU_RS10520 | Aspartate aminotransferase/65 kDa membrane protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2082406 = | 72 (1.220) | intergenic (+47/+277) | aspC/USA300HOU_RS10520 | Aspartate aminotransferase/65 kDa membrane protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGTTTTATACATCTCTC > USA300TCH1516_ALE/2082228‑2082504 | aTTGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCa < 2:293985/141‑1 (MQ=255) ttGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCaa > 1:217589/1‑141 (MQ=255) ttGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCaa > 1:201398/1‑141 (MQ=255) ttGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGAGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCaa > 1:501240/1‑141 (MQ=255) ttGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACATAATGCAACAGACAATCGTAGAGCGTTTAGCTGTATAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGGGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCaa > 2:151562/1‑141 (MQ=255) tGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAAc > 2:189274/1‑141 (MQ=255) ttttacttttcatctgtccgattttttgattttgttaggagagatgtataaaactaattaggtatagtgtttgacaagttgctgaataaaatatatcttatgatactttgaaagaaggaataattttaaaaaaaaaaAAcc < 1:710812‑M1/4‑1 (MQ=255) tttacttttcatctgtccgattttttgattttgttaggagagatgtataaacctaattaggtatagtgtttgacaagttgctgaataaaatatatcttttggtactttgaaggaaggaataatttttaaaataaaaAACCa < 1:65363‑M1/5‑1 (MQ=255) tttacttttcatctgtccgattttttgattttgttaggagagatgtataaaactaattaggtatagtgtttgacaagttgctgaataaaatatatcttatgatactttgaaagaaggaataattttaaaaataaaaAACCa < 1:354091‑M1/5‑1 (MQ=255) ttacttttcatctgtccgattttttgactttgttaggagtgatgtataaaactaattaggtatagtgtttgacaagtagctgaataaaatatatcttatgatactttgaaagaaggaataattttaaaaataaaaAACCaa < 2:231413‑M1/6‑1 (MQ=255) acttttcatctgtccgattttttgattttgttaggagagatgtataaaactaattaggtatagtgtttgacaagttgctgaataaaatatatcttatgatactttgaaagaaggaataattttaaaaataaaaAACCaata < 1:581802‑M1/8‑1 (MQ=255) acttttcatctgtccgattttttgattttgttaggagagatgtataaaactaattaggtatagtgtttgacaagttgctgaataaaatatatcttatgatactttgaaagaaggaataattttaaaaataaaaAACCaata < 2:75889‑M1/8‑1 (MQ=255) aaTATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCaata < 2:495292/141‑1 (MQ=255) atatTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCaataa > 1:82590/1‑141 (MQ=255) atTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATc > 1:74932/1‑141 (MQ=255) cAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCtga > 2:602215/1‑141 (MQ=255) aaTTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACATATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCtgat < 1:95129/141‑1 (MQ=255) aaTTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCtgat > 2:380686/1‑141 (MQ=255) aTTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCtgatg < 1:703275/141‑1 (MQ=255) tgtTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTGTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTAAAAAAGCGATCAGTATGGCGACGTGATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTAt < 1:370938/141‑1 (MQ=255) gtTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATg > 1:393239/1‑141 (MQ=255) tATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGAc < 1:3212/141‑1 (MQ=255) aTTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCTACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACt < 1:499177/141‑1 (MQ=255) tGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCg > 1:246861/1‑141 (MQ=255) tGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCg < 1:776080/141‑1 (MQ=255) cACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGa > 2:58499/1‑141 (MQ=255) ttAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGatta > 1:413487/1‑141 (MQ=255) ttAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGatta > 1:742704/1‑141 (MQ=255) tGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTACGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTgg > 1:210838/1‑141 (MQ=255) aaCAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGttt > 2:354091/1‑141 (MQ=255) agtgATATTCATCTTGAGTTAAGTTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGTCTCGGATTATTGGtttt < 2:749438/138‑1 (MQ=255) cAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAATCAATAATCTGATGAGTATTACGCGGATTATTGGttttt < 1:431784/141‑1 (MQ=255) atTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTtttttattt < 1:554767/141‑1 (MQ=255) atTCGTATTCCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTtttttattt > 2:733059/1‑141 (MQ=255) tCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATTCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTtttttattttt < 1:419448/141‑1 (MQ=255) tCGTAATTCGGTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACCTGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTtttttattttt < 1:52249/141‑1 (MQ=255) cGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTtttttattttta < 2:446332/141‑1 (MQ=255) gTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTaa < 1:445815/141‑1 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1:477275/141‑1 (MQ=255) tAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATCACTCGGATTATTGCTTTTTTATTTTTAAAATTATTCct < 1:496958/141‑1 (MQ=255) aGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCctt > 1:228322/1‑141 (MQ=255) gCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCATTAATCTGATGAGTATGGCTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCcttc > 1:225769/1‑141 (MQ=255) gCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCcttc > 1:262394/1‑141 (MQ=255) gCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCcttc < 1:88225/141‑1 (MQ=255) ggtatagtgtttgacaagttgctgaataaaatatatcttatgatcctttgaaagtaggaataattttaaaaatacaaAACCAATAATATGATGAGTTAGACATGGATGAAATGTTTTTAATTTTTAAAATTATTCcttctt < 2:644933‑M1/64‑1 (MQ=255) gtgtAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCttt > 1:419664/1‑141 (MQ=255) gtgtAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCttt > 1:665548/1‑141 (MQ=255) tgtAGAAAAAGAAGCTATCCCAAATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAAGAATCTGATGAGTATGCCTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTc < 1:202188/141‑1 (MQ=255) tgtAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTc < 1:36839/141‑1 (MQ=255) tggagtaaaaGAAGCTATGCCGCATGTATTTGATTCGATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCATTAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTc < 2:714364/135‑1 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1:253438/1‑137 (MQ=255) aaaGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCGACTTGTCAAacac > 1:290230/1‑141 (MQ=255) aaaGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAacat > 2:419819/1‑140 (MQ=255) aGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCGTCAACTTGTCAAAAACta > 2:376744/1‑141 (MQ=255) gaaagaagctattattttaaacataaaaTACTCATCATCTGATGAGTATGCCGCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCATTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACtata > 1:92474‑M1/29‑141 (MQ=255) cGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACtata < 2:393239/141‑1 (MQ=255) aaaagaaggaataattttaaaaataaaaAACCAATAATCCGAGTCATACTCATCAGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACtata > 2:92474‑M1/29‑141 (MQ=255) aTTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATAcc < 1:741621/141‑1 (MQ=255) ttGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCt > 1:674025/1‑141 (MQ=255) ttGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCt > 2:721251/1‑141 (MQ=255) tgatgaCTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTTTTCAACACTATACCTa > 2:392011/1‑141 (MQ=255) atgaCTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCATTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGGAACTTGTTAAAGATAATACCTAAt > 1:58462/1‑141 (MQ=255) tgaCTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAAtt < 2:742704/141‑1 (MQ=255) cTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGt < 1:512349/141‑1 (MQ=255) ttAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGTTTATTGGTTTTTTATTTTTATAATTATTTCTTCTTTCAAAGTATCATTAGATTTATTTTATTTTGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGtt > 2:65363/1‑141 (MQ=255) gATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGTTTtat < 2:79757/141‑1 (MQ=255) taattaatTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACATAATTAGTTTtattc > 2:773796/1‑139 (MQ=255) aattTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGTTTTATACAtctc > 2:639425/1‑141 (MQ=255) attTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGCTTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCTGCAACTTGTTAAACACTATACCTAATTAATTCTCTACAtccta > 2:125731/1‑138 (MQ=255) tttCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGTTTTATACAtctctc < 2:759531/141‑1 (MQ=255) tttCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGTTTTATACAtctctc > 2:494558/1‑141 (MQ=255) gagcAACCATTTACCTTATGAGTATGACTCTGATTATTGGTGTTTTATTGTTAAAATTATGCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGTTTTATACAtctctc < 2:379793/138‑1 (MQ=255) | ATTGAAAAATATTCAATTGGTGTTATTGCACTTAATGCAACAGATATTCGTATTGCGTTTAGCTGTGTAGAAAAAGAAGATATCCCACATGTATTTGATTCAATTGCTAAAGCGATTGATGACTTAAGATAATTAATTTCAACCAATAATCTGATGAGTATGACTCGGATTATTGGTTTTTTATTTTTAAAATTATTCCTTCTTTCAAAGTATCATAAGATATATTTTATTCAGCAACTTGTCAAACACTATACCTAATTAGTTTTATACATCTCTC > USA300TCH1516_ALE/2082228‑2082504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |