| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 399691 = | 119 (0.910) | 5 (0.040) | 4/272 | 9.1 | 4.4% | coding (1712/1713 nt) | efeU | Ferrous iron permease EfeU |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 399718 = | 108 (0.900) | intergenic (+26/+66) | efeU/tatC2 | Ferrous iron permease EfeU/Sec‑independent protein translocase protein TatCy | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TACAATTATTAGGTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTAACGATGAACATACTGAAC > USA300TCH1516_ALE/399544‑399838 | tACAATTATTAGGTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTtaaaaaata > 1:1119253/1‑148 (MQ=255) cAATTAATAGGTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTGACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCACTGATAGCAAAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTATATTtaaaaaataaa < 2:886331/148‑1 (MQ=255) taGGTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTgacaaaataaaaaagatg > 1:1156905/1‑144 (MQ=255) taGGTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAgg > 2:1078507/1‑148 (MQ=255) taGGTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAgg > 2:509346/1‑148 (MQ=255) ggTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGcc > 1:1218763/1‑148 (MQ=255) ggTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGcc > 1:472117/1‑148 (MQ=255) ggTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATACCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGcc > 2:1139355/1‑148 (MQ=255) gTGCGATGCCCAGACAGGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGATATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCg > 2:26567/1‑148 (MQ=255) gTGCGATGCCAAGACATGTTATTTAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGGAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAAAAGGCCg > 2:710094/1‑148 (MQ=255) gTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGGTTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTATTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAGAAGAGGcag > 2:929212/1‑146 (MQ=255) gTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATCTTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCg > 2:771171/1‑148 (MQ=255) gTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCg > 2:1317201/1‑148 (MQ=255) gATGCCAAGACATGTTATGGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTg < 2:1085762/148‑1 (MQ=255) gCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCt < 1:302374/148‑1 (MQ=255) aCATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGttttt < 1:418832/148‑1 (MQ=255) tGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTttg < 2:1070941/148‑1 (MQ=255) tGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTttg < 1:1242817/148‑1 (MQ=255) tGTTATTGAAGGAATCCCAACGATTAACTGGTTGCGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATAGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAAGCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGGGCCTGTTTTTttg < 1:1242740/148‑1 (MQ=255) ttattaAATGATTCTCAACGATTAACTGGTTGGGCTTCTATGCAAGTTAGCAACCATTGATATCACAAAGTGCTTAAATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTttgtt < 2:920923/148‑1 (MQ=255) tATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAATAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTttgttg < 1:859982/148‑1 (MQ=255) tATTGAAGAATGACCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAAGTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTttgttg < 2:146867/148‑1 (MQ=255) aTTGAAGGATTCCCAACTATTAACTGGTTGGGCGTTTATAAAAGTGCTAAATCCTTGATCGCACAAGCTGCTTATATTAGAGGAGTTTCTATCTTAATATTTAATTTTAAAAAATAAAAAACAGTCCTACTGCCTGTTTTTTTGTTGc < 2:539296/148‑1 (MQ=255) aTTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGc < 2:1226324/148‑1 (MQ=255) aTTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGc < 1:1243947/148‑1 (MQ=255) aTTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGc < 1:370670/148‑1 (MQ=255) ttGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCt < 1:1305285/148‑1 (MQ=255) aGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTatat > 1:839342/1‑148 (MQ=255) aGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTAACCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTatat > 2:613760/1‑148 (MQ=255) gATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGAGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTg > 1:927374/1‑148 (MQ=255) tCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTACCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGaa < 1:450118/148‑1 (MQ=255) ggccACCGATCAACGGGGTGGGCTGATATCGAGTGGATGGACCAGTGATAGTACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCCATCTTCATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGaa < 1:1239759/146‑1 (MQ=255) cAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGaaaga > 1:427764/1‑146 (MQ=255) aaCGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAatat > 1:1387971/1‑148 (MQ=255) aaCGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAAT‑AAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATAtt > 1:1388219/1‑148 (MQ=255) cGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTc < 1:467610/148‑1 (MQ=255) cGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTc < 1:997502/148‑1 (MQ=255) gATTTACCGGTTTGGCTTTTATCCAAGTTATTAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCg < 1:239419/148‑1 (MQ=255) gATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTTGAAATATTCg < 2:513784/148‑1 (MQ=255) aTTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCgg < 1:385834/148‑1 (MQ=255) aTTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCgg < 1:941816/148‑1 (MQ=255) aaCTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTAAGCAATCTAGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGGTGTTTTGTTGCTATATTTGAAATATTCTGTAt > 1:337038/1‑148 (MQ=255) ggTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCa > 2:848463/1‑148 (MQ=255) ggTTGGGCTTTTAGCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCa < 1:945141/148‑1 (MQ=255) ggTTGGGCCTTTATCCAAGGTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACATGCCGAGGGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCa < 1:578197/148‑1 (MQ=255) gTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAg < 1:52688/148‑1 (MQ=255) gTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATCGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTATTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAg < 2:877449/148‑1 (MQ=255) ttGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAATTATTCGGTATTGCAGt > 2:479158/1‑148 (MQ=255) ttGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGt > 2:621797/1‑148 (MQ=255) tGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGtc > 1:783426/1‑147 (MQ=255) tCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAAt > 1:1212943/1‑148 (MQ=255) tGAAGCATGGAAAGCAAAAGTCGGTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTATAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTTTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCAtt < 2:657804/148‑1 (MQ=255) tGAACCATGTATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCAtt < 1:488572/148‑1 (MQ=255) 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cATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTc < 1:634606/148‑1 (MQ=255) aTAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGtata > 1:799169/1‑148 (MQ=255) aTAGCAAAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCAGAGTGCCTGTTTTTTAGATTCTATAATGGAAAACTTAGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATACGtaca > 2:699304/1‑146 (MQ=255) aGCACAAGGTGCGTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAg < 2:1158194/148‑1 (MQ=255) gCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGCTTCGTATAAgg > 2:644757/1‑148 (MQ=255) 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attatGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCgg > 1:315877/1‑148 (MQ=255) atGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGttt > 2:447932/1‑148 (MQ=255) atGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGGATAGTGTTAATGTGTTGGCGGttt > 2:219479/1‑148 (MQ=255) tgatAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTg > 1:755405/4‑148 (MQ=255) tGGTAGTTGCTATCTTAATCATTCCATATAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTGGGCGGTTTg > 1:684058/1‑148 (MQ=255) 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cTTTATCTTTAAGTTTAAAAAATAAAAAACTGGCCGGGGGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTAGAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGa < 1:710094/148‑1 (MQ=255) ttAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGaa < 1:1317201/148‑1 (MQ=255) ttAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAAGCCGAGTGAATGTTTTTGTGTTGGTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGaa < 1:457280/148‑1 (MQ=255) tAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCAGCATCTGAAc > 1:1350336/1‑148 (MQ=255) tCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTa > 1:33280/1‑148 (MQ=255) tCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTa > 2:1002849/1‑148 (MQ=255) tCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTa > 2:519607/1‑148 (MQ=255) tCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTa > 1:1295180/1‑148 (MQ=255) cTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTaa < 1:886901/148‑1 (MQ=255) tttaaatttaaaAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTAAc < 1:501576/148‑1 (MQ=255) taaatttaaaAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTAACGa > 1:1351800/1‑148 (MQ=255) aatttaaaAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTAACGATg > 2:1033925/1‑148 (MQ=255) aatttaaaAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTAACGATg > 2:1033802/1‑148 (MQ=255) atttaaaAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTAACGATGa < 1:1078507/148‑1 (MQ=255) tttaaaAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTCACGATGaa > 2:1196540/1‑148 (MQ=255) ataaaaaaCAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTAACGATGAACATACTGa < 1:555363/148‑1 (MQ=255) aaaaaaCAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGATGCTCATCAGGTGATAGTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTAACGATGAACATACTGAAc < 1:1314804/148‑1 (MQ=255) | TACAATTATTAGGTGCGATGCCAAGACATGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTAACGATGAACATACTGAAC > USA300TCH1516_ALE/399544‑399838 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |