| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 399691 = | 119 (0.910) | 5 (0.040) | 4/272 | 9.1 | 4.4% | coding (1712/1713 nt) | efeU | Ferrous iron permease EfeU |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 399718 = | 108 (0.900) | intergenic (+26/+66) | efeU/tatC2 | Ferrous iron permease EfeU/Sec‑independent protein translocase protein TatCy | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTAACGATGAACATACTGAACTCAAAGAGCAATATGAGTGGCAATGTG > USA300TCH1516_ALE/399572‑399865 | tGTTATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTttg < 2:1070941/148‑1 (MQ=255)tGTTATTGAAGGAATCCCAACGATTAACTGGTTGCGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATAGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAAGCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGGGCCTGTTTTTttg < 1:1242740/148‑1 (MQ=255) ttattaAATGATTCTCAACGATTAACTGGTTGGGCTTCTATGCAAGTTAGCAACCATTGATATCACAAAGTGCTTAAATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTttgtt < 2:920923/148‑1 (MQ=255) tATTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAATAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTttgttg < 1:859982/148‑1 (MQ=255) aTTGAAGGATTCCCAACTATTAACTGGTTGGGCGTTTATAAAAGTGCTAAATCCTTGATCGCACAAGCTGCTTATATTAGAGGAGTTTCTATCTTAATATTTAATTTTAAAAAATAAAAAACAGTCCTACTGCCTGTTTTTTTGTTGc < 2:539296/148‑1 (MQ=255) aTTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGc < 1:370670/148‑1 (MQ=255) aTTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGc < 2:1226324/148‑1 (MQ=255) aTTGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGc < 1:1243947/148‑1 (MQ=255) ttGAAGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCt < 1:1305285/148‑1 (MQ=255) aGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTGGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAAAAGCCCGAGTGACTGATTTTTTGTTGCTatat > 1:366263/1‑148 (MQ=255) aGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTatat > 1:839342/1‑148 (MQ=255) aGGATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTAACCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTatat > 2:613760/1‑148 (MQ=255) aGGATTCCCAACGATTAACTGGTGGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGGACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGACAGAGTGACTGTTGATTGGTTGGCatat > 2:144171/1‑148 (MQ=255) gATTCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGAGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTg > 1:927374/1‑148 (MQ=255) tCCCAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTACCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGaa < 1:450118/148‑1 (MQ=255) ggccACCGATCAACGGGGTGGGCTGATATCGAGTGGATGGACCAGTGATAGTACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCCATCTTCATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGaa < 1:1239759/146‑1 (MQ=255) cAACGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGaaaga > 1:427764/1‑146 (MQ=255) aaCGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAatat > 1:1387971/1‑148 (MQ=255) aaCGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAAT‑AAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATAtt > 1:1388219/1‑148 (MQ=255) cGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTc < 1:467610/148‑1 (MQ=255) cGATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTc < 1:997502/148‑1 (MQ=255) gATTTACCGGTTTGGCTTTTATCCAAGTTATTAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCg < 1:239419/148‑1 (MQ=255) gATTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTTGAAATATTCg < 2:513784/148‑1 (MQ=255) aTTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCgg < 1:941816/148‑1 (MQ=255) aTTAACTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCgg < 1:385834/148‑1 (MQ=255) aaCTGGTTGGGCTTTTATCCAAGTTAAGCAATCTAGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGGTGTTTTGTTGCTATATTTGAAATATTCTGTAt > 1:337038/1‑148 (MQ=255) ggTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCa > 2:848463/1‑148 (MQ=255) ggTTGGGCTTTTAGCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCa < 1:945141/148‑1 (MQ=255) ggTTGGGCCTTTATCCAAGGTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACATGCCGAGGGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCa < 1:578197/148‑1 (MQ=255) gTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAg < 1:52688/148‑1 (MQ=255) gTTGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATCGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTATTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAg < 2:877449/148‑1 (MQ=255) ttGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAATTATTCGGTATTGCAGt > 2:479158/1‑148 (MQ=255) ttGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGt > 2:621797/1‑148 (MQ=255) tGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGtc > 1:783426/1‑147 (MQ=255) tGGGCTTTTATCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGta > 1:1296414/1‑148 (MQ=255) tCCAAGTTATGAACCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAAt > 1:1212943/1‑148 (MQ=255) tGAAGCATGGAAAGCAAAAGTCGGTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTATAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTTTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCAtt < 2:657804/148‑1 (MQ=255) tGAACCATGTATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCAtt < 1:488572/148‑1 (MQ=255) aaCCATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCAAAGCATTGa > 2:624107/1‑148 (MQ=255) aCCATTGATAGCACAAGGTTCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGAt < 1:112862/148‑1 (MQ=255) ccATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGAtt > 2:593987/1‑148 (MQ=255) cATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTc < 1:634606/148‑1 (MQ=255) cATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTc < 2:254425/148‑1 (MQ=255) cATTGATAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTc < 2:527566/148‑1 (MQ=255) aTAGCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGtata > 1:799169/1‑148 (MQ=255) aTAGCAAAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCAGAGTGCCTGTTTTTTAGATTCTATAATGGAAAACTTAGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATACGtaca > 2:699304/1‑146 (MQ=255) aGCACAAGGTGCGTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAg < 2:1158194/148‑1 (MQ=255) gCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGCTTCGTATAAgg > 2:644757/1‑148 (MQ=255) gCACAAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAgg > 2:1269463/1‑148 (MQ=255) acaAGGTGCTTATATTATGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGtt > 1:1135457/1‑148 (MQ=255) attatGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCgg > 1:1149304/1‑148 (MQ=255) attatGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCgg > 1:315877/1‑148 (MQ=255) atGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGttt > 2:447932/1‑148 (MQ=255) atGGTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGGATAGTGTTAATGTGTTGGCGGttt > 2:219479/1‑148 (MQ=255) tgatAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTg > 1:755405/4‑148 (MQ=255) tGGTAGTTGCTATCTTAATCATTCCATATAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTGGGCGGTTTg > 1:684058/1‑148 (MQ=255) ggTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAATAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGc > 2:1027596/1‑148 (MQ=255) ggTAGTTGCTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCAGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGGATTGATTCGTATAGGGTTAATGTGTTGGCGGGTTGc > 1:1100914/1‑148 (MQ=255) 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cTATCTTAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCAt > 2:1161578/1‑148 (MQ=255) cTTTATCTTTAAGTTTAAAAAATAAAAAACTGGCCGGGGGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTAGAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGa < 1:710094/148‑1 (MQ=255) ttAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGaa < 1:771171/148‑1 (MQ=255) ttAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAAGCCGAGTGAATGTTTTTGTGTTGGTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGaa < 1:457280/148‑1 (MQ=255) ttAATCTGTAAACTTAAATAATAAAAAACAGGCCGAGTTCCTGTTTTTTTGTTGGTACATTGGAAATATTCGGTCGTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGaa < 1:26567/148‑1 (MQ=255) tAATCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCAGCATCTGAAc > 1:1350336/1‑148 (MQ=255) tCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTa > 1:1295180/1‑148 (MQ=255) tCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTa > 2:519607/1‑148 (MQ=255) tCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTa > 1:33280/1‑148 (MQ=255) tCTTTAAATTTAAAAAATAAAAAACAGGCCGAGTGCCTGTTTTTTTGTTGCTATATTGGAAATATTCGGTATTGCAGTATAACGATAATCACAGCATTGATTCGTATAAGGTTAATGTGTTGGCGGTTTGCCTCGGCATGTGAACTTa > 2:1002849/1‑148 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |