| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1268 total aligned reads displayed.
TTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTCACCGCTATTTTTGTAGTTCCCACCAACTGCTCTAGGTGATATTGAACTAGTTTTCTTTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTAT > NC_012417/2212‑2492 | ttttGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTCACCGCTATTTTTGTAGTTCCCACCAACTGCTCTAGGTGATATTGAACTAg < 1:310048/141‑1 (MQ=255) tttGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTCACCGCTATTTTTGTAGTTCCCACCAACTGCTCTAGGTGATATTGAACTAGt < 1:641131/141‑1 (MQ=255) tttGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTCACCGCTATTTTTGTAGTTCCCACCAACTGCTCTAGGTGATATTGAACTAGt < 1:268977/141‑1 (MQ=255) ggCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTCACCGCTATTTTTGTAGTTCCCACCAACTGCTCTAGGTGATATTGAACTAGtttt > 1:228110/1‑141 (MQ=255) 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ctAGGTGTTATTGAACTAGTTTTCTTTTTATTCTCTATGTCGGTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAaataata < 2:350078/141‑1 (MQ=255) ctAGGTGATATTGAACTAGTTTTCTTTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAaataata < 2:690483/141‑1 (MQ=255) ctAGGTGATATTGAACTAGTTTCCTTTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAaataata < 1:262766/141‑1 (MQ=255) aGGTGATATTGATCTTGTTTTCTTTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTCTTGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTAGCTAAaataataat < 2:165706/141‑1 (MQ=255) gtggATATTGAACCTGTTTTCTTTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAAtt < 2:322809/138‑1 (MQ=255) gTGATTTTGAACTAGTTTTCTTTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGGCTTTTTCTAAAATAATAAttt < 1:358172/141‑1 (MQ=255) gATATTGAATTAGTTTTCTCTTTATTCTCTTTGGCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTTGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTg < 2:364282/141‑1 (MQ=255) gATATTGAACTAGTTTTCTTTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTg < 1:563627/141‑1 (MQ=255) tGAACTAGTTTTCTTTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCATGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATTTAAAATAATAAtttttcatta > 2:612805/1‑135 (MQ=255) actaGTTTTCTTTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTTTTTTTATTTATCATTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTCGCTGTTCCGTCTTTATTTAAAATAATGTTTTtgtcatttct > 2:450809‑M2/5‑137 (MQ=255) actaGTTTTCTTTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCatatat > 1:152159‑M2/5‑141 (MQ=255) | TTTTGGCTTTAACATCTTCAAAAACTGCTGTGATTATGTTTCCAGTTAAAAGTTCTCCATATGAGTTTAAAACTTCAGAATAGAAACAGTCACCGCTATTTTTGTAGTTCCCACCAACTGCTCTAGGTGATATTGAACTAGTTTTCTTTTTATTCTCTATGTCGTTTTTTAGTTTTTGGAATCCTTCAGGAACATATCCATATCGAGATTTGGCATTTTCTAGATTAACATCTTTAGCTGTTCCGTCTTTATCTAAAATAATAATTTTGCCATATATGTAT > NC_012417/2212‑2492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |