| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012417 | = 1575 | 1589 (0.830) | 5 (0.000) | 5/268 | 71.5 | 0.33% | intergenic (‑381/‑4) | USA300HOU_RS15665/USA300HOU_RS14895 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_012417 | = 1586 | 1515 (0.830) | coding (8/189 nt) | USA300HOU_RS14895 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1594 total aligned reads displayed.
TTTAAGAGCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGTATGTTATTTTGATGGGAAT > NC_012417/1435‑1715 | ttAAGATCTTGTATATAATTTTAAGTTAAAAACCTAGATGATACCCACTAAAGCTTTAAATTTCCCCCTTAAAACTCAAAATAATGGTAGTTATAATTGGAGTAGGGCTTGTGTTAAAGTTTTTTAAAATAGGAGTGTTTa < 2:791510/141‑1 (MQ=255) ttAAGAGCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTa > 1:304102/1‑141 (MQ=255) aaGAGCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTAtt < 1:950543/141‑1 (MQ=255) aagCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAACCCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATAACCCCATAAAACTAACAATAAAGGTATCTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATACAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTAtttt < 2:355320/140‑1 (MQ=255) agCTTGTATATATTGTTAAGTTAAAAACCTATACGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTg < 1:328797/141‑1 (MQ=255) gCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGa > 1:40273/1‑141 (MQ=255) cTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGaa > 1:635564/1‑141 (MQ=255) cTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGaa > 1:176187/1‑141 (MQ=255) tatataTTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATaaa < 2:454623/141‑1 (MQ=255) attatatTATTTAGTGAATAGCCGGTATGCTACCACCTAAACATTTGAAATAACCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGGGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATaaa < 2:644510/139‑1 (MQ=255) atatatTTTTTAGTTAAAAACCTATATGACACCACCTAAACCTTTAAAATACCCCCTAAAACCTCAAAATAAAAGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATaaaa < 2:72833/141‑1 (MQ=255) atatTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAac > 1:757405/1‑141 (MQ=255) atagTTTTAAGTTAAAACCCTATATGATACCCCCTAAACGTTTACAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAATTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAac < 1:622940/141‑1 (MQ=255) tatTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAaca < 1:349888/141‑1 (MQ=255) tatTTGTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAaca < 1:582867/141‑1 (MQ=255) ttttAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAg > 1:484446/1‑141 (MQ=255) taatatAAAAACCTATATAATACAACCAAAACCTTTAGAATACCCCCTTAAAACGCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAgtgt < 2:10632/136‑1 (MQ=255) tAAGTTAAAAACCTATATGATCCCCCCCAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAgtgt < 1:368467/141‑1 (MQ=255) aaGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTTTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGtt > 2:744850/1‑141 (MQ=255) aaGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGtt > 2:931329/1‑141 (MQ=255) gTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAg > 1:279457/1‑141 (MQ=255) gTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAg > 2:19988/1‑141 (MQ=255) tAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTTATATATGTGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGAt > 2:518091/1‑141 (MQ=255) aaaaaCCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAACTGCGCCTGTCAGAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATg < 1:472636/141‑1 (MQ=255) aaaaaCCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACGCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATg < 2:596360/141‑1 (MQ=255) aaaaCCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGa > 2:286462/1‑141 (MQ=255) aaaaCCTATATGAAACCCGCTAAAGCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGa < 2:185373/141‑1 (MQ=255) aaaCCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTCTTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGaa < 1:833772/141‑1 (MQ=255) aaaCCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGaa < 2:375930/141‑1 (MQ=255) aaaCCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGaa < 1:564338/141‑1 (MQ=255) aaaCCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGaa > 1:896857/1‑141 (MQ=255) aaaCCTATATGATACCCCATAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAATAATAAAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGaa < 2:123732/141‑1 (MQ=255) aaCCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAg > 1:263566/1‑141 (MQ=255) aaCCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAg > 1:967190/1‑141 (MQ=255) aaCCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAg < 2:764653/141‑1 (MQ=255) ccTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGt > 1:293469/1‑141 (MQ=255) atGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGt < 1:217501/141‑1 (MQ=255) atGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGt < 1:989864/141‑1 (MQ=255) gATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTta < 1:980645/141‑1 (MQ=255) cccccTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGc < 1:878288/141‑1 (MQ=255) cTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACt > 1:688486/1‑141 (MQ=255) tAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGACTAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTa > 2:670197/1‑141 (MQ=255) aaCCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGATATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGCGATTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTATATGACGGATACGTTATAGCAACAAtt > 2:434631/1‑141 (MQ=255) aCCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTAttt > 2:945658/1‑141 (MQ=255) tttAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTaa < 1:806275/141‑1 (MQ=255) tttAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTaa < 1:317044/141‑1 (MQ=255) ttAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTaaa > 2:709617/1‑141 (MQ=255) tAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAAt < 1:935124/141‑1 (MQ=255) aaaaTACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTCGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATg < 1:381759/141‑1 (MQ=255) aaaTACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAAGTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTAAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGt < 2:2505/141‑1 (MQ=255) aaTACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGtt > 1:155219/1‑141 (MQ=255) aCCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTATTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGGTTTTTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTc < 2:141674/141‑1 (MQ=255) cccccTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCt < 2:878860/141‑1 (MQ=255) cccccTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCt > 2:82108/1‑141 (MQ=255) cccTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCttt < 1:653206/141‑1 (MQ=255) ccTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGTTAAATTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCtttt > 1:435851/1‑141 (MQ=255) ccTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCtttt > 1:914605/1‑141 (MQ=255) ttAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTGTTTTGTATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTa > 1:723971/1‑141 (MQ=255) aaaCTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACtt > 1:817144/1‑141 (MQ=255) cacAAAATGAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTTTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGa < 2:807861/139‑1 (MQ=255) cTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGa < 1:850736/141‑1 (MQ=255) tCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTGTTTTTACTTggtt > 1:866483/1‑139 (MQ=255) tCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGAt < 1:199159/141‑1 (MQ=255) aaaGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAAtttt < 2:165017/141‑1 (MQ=255) ggTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTtat < 2:393669/141‑1 (MQ=255) ggTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTtat < 2:958660/141‑1 (MQ=255) gTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTtatt > 1:784002/1‑140 (MQ=255) gTATTTATAATTTGAGTAAGTCGTGTGATAAAGTTTATTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTATATAAAAAAACAGTGTTAGATAAAGACTACGTTGTAGCAACTATTTTAAATGTTTTATTTTTTCTGGCATTAAtttttttt > 2:344666/1‑138 (MQ=255) tttATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTGGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATAtct < 1:117197/141‑1 (MQ=255) tataATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCa < 1:602484/141‑1 (MQ=255) tataATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCa < 1:708327/141‑1 (MQ=255) tataATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTGTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAATAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCa > 1:520592/1‑141 (MQ=255) tGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGaa > 1:456731/1‑141 (MQ=255) aGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAGAtttt > 2:476504/1‑140 (MQ=255) aGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAAtttt > 1:502439/1‑140 (MQ=255) aGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTta < 2:296716/141‑1 (MQ=255) aGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTta > 2:266571/1‑141 (MQ=255) gTCTTGTGATAAAGTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTATGTTGAATAAAAACACAGTGTTAAATGAAGGTTACGTTATAGCAACTAATTTAAATGTTTACTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATATCATTTGGAAAAttatt > 2:226011/1‑138 (MQ=255) gTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTtat > 2:912899/1‑141 (MQ=255) gTCTTGTGATAAAGATTTTGAAAAAGGGAGTGTTTATTTTGAATCAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTtat > 1:545632/1‑141 (MQ=255) tCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTtata < 1:740589/141‑1 (MQ=255) tgtgATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGATAATTtatatat > 2:578550/1‑141 (MQ=255) tgtaTAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATCAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTtatatata < 2:97792/138‑1 (MQ=255) tgaaTAAAGTTATTTAAAAAAGGAGTGTTTAGTTTGAATCAAAACACAGGGTTACATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTtatatata < 2:424350/138‑1 (MQ=255) gtgATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAAGGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCTTTTGGAAAATTtatatatt > 1:139530/1‑140 (MQ=255) aGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTc < 2:313267/141‑1 (MQ=255) gTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATTACTTTTCCACAAAATTTATATATATTAATTcc < 1:238609/141‑1 (MQ=255) tttttAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGt < 1:423749/141‑1 (MQ=255) tgaaaaaaGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACTTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGTATg < 2:841116/139‑1 (MQ=255) tAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGTATGt < 1:100245/141‑1 (MQ=255) aaagaaGGTGTGTTTATGTTGAATAACAACACAGTTTTAGAAGAAGGGTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTCACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAACTTATATATATTAATTCCGTATGtt < 2:863083/141‑1 (MQ=255) aaaaaaGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGTATGtt > 2:56128/1‑141 (MQ=255) aaaaGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGTATGTTAt > 2:61839/1‑141 (MQ=255) aaaGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGTATGTTAtt < 2:899334/141‑1 (MQ=255) ggAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGCTGAAGGGTACGTTATAGCAACTATTTTCAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGTATGTTATTTTg > 2:497208/1‑141 (MQ=255) gtTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATTTATTAATGCCGTATGTTATTTTGAgggg > 2:658793/1‑141 (MQ=255) gtTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGTATGTTCTTTTGATggg > 2:691553/1‑141 (MQ=255) gtTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTCTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGTATGTTATTTTGATggg < 1:670197/141‑1 (MQ=255) tttATTTTAAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATCTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATCTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGTATGTTATTTTGATGGGa < 2:547784/141‑1 (MQ=255) tATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTGATTCCGTATGTTATTTTGATGGGAAt < 2:537577/141‑1 (MQ=255) | TTTAAGAGCTTGTATATATTTTTAAGTTAAAAACCTATATGATACCCCCTAAACCTTTAAAATACCCCCTTAAAACTCAAAATAAAGGTATTTATAATTTGAGTAAGTCTTGTGATAAAGTTTTTTAAAAAAGGAGTGTTTATTTTGAATAAAAACACAGTGTTAGATGAAGGTTACGTTATAGCAACTATTTTAAATGTTTTCTTTTTACTTGGATTAATTTTTATATCTCATTTGGAAAATTTATATATATTAATTCCGTATGTTATTTTGATGGGAAT > NC_012417/1435‑1715 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |