New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | USA300TCH1516_ALE | = 1998272 | 102 (1.120) | noncoding (1/76 nt) | USA300TCH1516_01882 | tRNA‑Val | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
AAGGTAAGGGATTCGAACCCTTGAGACGCTTGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACCTTCCTCAACAATAAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTCACTTCTGCTTGTATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGC > USA300TCH1516_ALE/1961372‑1961650 | aaGGTAAGGGATTCGAACCCTTGAGACGCTTGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACCTTCCTCAACAATAAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTCACTTCTGCTTGTAt > 1:423169/1‑141 (MQ=255) aGGTAAGGGATTCGAACCCTTGAGACGCTTGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACCTTCCTCAACAATAAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTCCCTTCTGCTGGTATg > 1:793967/1‑141 (MQ=255) gaaGGGGTTCGAACCCGCGAGACGCTGGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACCTTCCTCAACAATAAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTCACTTCTGCTTGTATGACt < 2:592352/140‑1 (MQ=255) aaGGGATTCGAACCCTTGAGACGCTTGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACCTTCCTCAACAATAAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTCACTTCTGCTTGTATCACTc > 1:295042/1‑141 (MQ=255) aGGGATTCGAACCCTTGAGACGCTTGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACCTTCCTCAACAATAAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTCACTTCTGCTTGTATGACTcc > 2:976543/1‑141 (MQ=255) ggATTCGAACCCTTGAGACGCTTGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACCTTCCTCAACAATAAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTCACTTCTGCTTGTCTGACTGCTa > 2:59598/1‑141 (MQ=255) aCCCTTGAGACGCTTGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACCTTCCTCAACAATAAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTCACTTCTGCTTGTATGACTCCTACGGGACTc < 1:300729/141‑1 (MQ=255) aCCCTTGAGACGCTTGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACCTTCCTCAACAATAAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTAACTTCTGCGTGTATGACTCCTACGGGACTc < 2:705082/141‑1 (MQ=255) aCCCGTGAGAGGCTTGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGGGCTCCTTCGTCCAGCTCGTACAACCTTCCGCAACAAATAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTCACTTCTGCTTGTATGACTCCTACGGGACTc < 2:225129/141‑1 (MQ=255) tGAGACGCTTGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACCTTCCTCAACAATAAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTCACTTCTGCTTGTATGACTCCTACGGGACTCGAAcc > 1:105972/1‑141 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tCACTTCTGCTTGTATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTCCGACCGATCGGTTAACAGCCGATTGc > 1:6500/1‑141 (MQ=255) cTTCTGCTTGTATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCTGATAGctct < 2:893889/141‑1 (MQ=38) cTTCTGCTTGTATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGctct < 2:423169/141‑1 (MQ=38) cTTCTGCTTGTACGACTCCTACGGGACCCGACCCCGTGTTACCACCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGctct < 1:333788/141‑1 (MQ=255) ttCTGCTTGTATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTa > 2:130959/1‑141 (MQ=38) cTGCTTGTATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTAcc > 1:949350/1‑141 (MQ=35) tGTATGCCTCCTCCGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGa < 1:59598/141‑1 (MQ=17) tGTATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGAGAAAGGGGGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCCCTGa > 1:193277/1‑141 (MQ=12) tGTATGACTCCTACGGGACGCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGCCCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTGCCACttg > 1:72758/1‑139 (MQ=12) tGTATGACTCCTACGGAACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGCTAGCTCTACCACTGa > 1:554918/1‑141 (MQ=17) tATGACTCCTACGGGACTCGCACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACCGGCAGGCCCCGCACCTACGACCGCTCGGTTAGCAGACGTTGGCTCTACCACTGacc > 2:646127/1‑139 (MQ=11) | AAGGTAAGGGATTCGAACCCTTGAGACGCTTGTGACGCCTACACACTTTCCAGGCGTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACCTTCCTCAACAATAAATATGTAATAAAAAAACAGAAGCGATATTTCACTTCTGCTTGTATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGC > USA300TCH1516_ALE/1961372‑1961650 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |