| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 72990 = | 134 (1.110) | 7 (0.060) | 3/254 | 9.0 | 5.6% | intergenic (‑17/+69) | arcD_1/arcA_1 | Arginine/ornithine antiporter/Arginine deiminase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 73054 = | 115 (1.050) | intergenic (‑81/+5) | arcD_1/arcA_1 | Arginine/ornithine antiporter/Arginine deiminase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
TAATTATTGCAAGTCCACCAGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACC > USA300TCH1516_ALE/72850‑73130 | tAATTATTGCAAGTCCACCAGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCtaata > 1:822120/1‑141 (MQ=255) agtattGCAAGTCCACCAGCTTGGCCCCCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATaaa < 2:1092116/139‑1 (MQ=255) ttattGCAAGTCCACCAGGTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCAATATTAATCTCCCCTAATAAAg > 2:535996/1‑141 (MQ=255) ttattGCAAGTCCACCAGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAg > 1:655301/1‑141 (MQ=255) ttGCAAGTCCACCAGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAggtg > 2:1349960/1‑141 (MQ=255) tGCAAGTCCACCAGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAggtgg < 2:165344/141‑1 (MQ=255) tGCAAGTCCACCAGCTTGGCCAACCGTCCCGGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTCAGGAAggtgg < 2:1313281/141‑1 (MQ=255) cAAGTCCACCAGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTa < 1:1028582/141‑1 (MQ=255) cAAGTCCACCAGCTTGGCCACCCAGATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTa < 1:1164137/141‑1 (MQ=255) cAAGTCCACCAGCTTGCCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTa < 1:1254498/141‑1 (MQ=255) tCCACCAGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTaaaaa > 1:1117182/1‑141 (MQ=255) caccaGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATCAAGGTGGTAAAAATc > 1:1044861/1‑141 (MQ=255) caccaGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATc > 1:1370555/1‑141 (MQ=255) caccaGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATc > 1:248151/1‑141 (MQ=255) caGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTg < 1:1231477/141‑1 (MQ=255) caGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTg > 2:942187/1‑141 (MQ=255) caGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGGTGTAAAAATCttt > 1:305152/1‑140 (MQ=255) cgactGGCCACACTTATTGCAGATGATATTGTATGTTCCACTGACTATCATAGAGCCTATGTCTAAACCATTTAACGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCTTATTATTCTCCCCTTATAAAGGTGGTAAAAATCTTGt < 2:1062894/137‑1 (MQ=255) cgCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGt < 1:714659/140‑1 (MQ=255) aGCTTGGCCCCCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGt < 2:1370653/141‑1 (MQ=255) aGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGt < 2:1014392/141‑1 (MQ=255) aGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGt < 1:203056/141‑1 (MQ=255) cctGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTa < 2:1359500/139‑1 (MQ=255) cccATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATGGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGAttt > 1:700389/1‑141 (MQ=255) ccATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTa > 2:1077217/1‑141 (MQ=255) cATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTaa > 1:1330689/1‑141 (MQ=255) tCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAGGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGTTAAAGATCTTGTTATTTGATTTgatgaa > 2:1250954/1‑141 (MQ=255) tCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGTTAAAAATCTTGTTATTTGATTTaatgaa > 2:549264/1‑141 (MQ=255) tCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTaatgaa > 2:1215480/1‑141 (MQ=255) tCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGGTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTaatgaa > 2:149216/1‑141 (MQ=255) cTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTaatgaat > 2:962899/1‑141 (MQ=255) agaTGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAGTCTTTTTATTTGATTTAAtgaatgaa > 1:581012/1‑141 (MQ=255) agaTGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGGGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTCAAtgaaagaa > 1:550792/1‑141 (MQ=255) gatgatATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATgaatgaat > 1:78546/1‑141 (MQ=255) gatgatATTGAATGCACCACCGCCCATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTATTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATgaatgaat > 2:25738/1‑141 (MQ=255) gatATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTAc > 2:845549/1‑141 (MQ=255) atTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTtg > 2:518587/1‑141 (MQ=255) gCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAAACTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACttt > 1:162194/1‑141 (MQ=255) ccaccGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTac < 1:132411/141‑1 (MQ=255) accGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTaccc > 2:160731/1‑140 (MQ=255) ccTATGCTAGAGCCTAATACTAAACCAATTAAGGATGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAACGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCtt < 1:1147790/141‑1 (MQ=255) ccTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCtt < 2:1113843/141‑1 (MQ=255) cTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCCCCttg < 2:232058/141‑2 (MQ=255) gCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTTACTTTTACCACCTTTCACATTTaaa > 2:703174/1‑141 (MQ=255) gCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGATGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACATGGGACTTTTACCACCTATCAAAATTaaa > 2:1236877/1‑141 (MQ=255) ttGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATAtc < 2:680484/140‑1 (MQ=255) aTGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATAtc > 1:485237/1‑141 (MQ=255) aTGACTAAAACAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATAtc < 1:519693/141‑1 (MQ=255) aTGACCAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATAtc < 1:239354/141‑1 (MQ=255) tGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTAAAATTTAGATAtct > 1:1365/1‑141 (MQ=255) gACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATAtctt < 1:62740/141‑1 (MQ=255) aaaCCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTctct < 2:208838/141‑1 (MQ=255) aTTAAGGAATTGTTACCGAAGTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCCCCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATaa < 2:693674/141‑1 (MQ=255) aTTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATac > 2:1127150/1‑140 (MQ=255) ttAAGTAAGTTTTACCGAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCTCCTAATGAAGTTGTTAAAAATCTTGTTAGTTGATTTAATGAATGAATTCCTTGTGACTTGTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAAc < 2:173044/141‑1 (MQ=255) ttAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAATTAAc > 2:921156/1‑141 (MQ=255) ttAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAAc < 1:1077217/141‑1 (MQ=255) ttAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTACAATTTAAATATCTTCTCTAATTAAc > 2:887221/1‑141 (MQ=255) aaGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACgg < 2:330263/141‑1 (MQ=255) ggAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCt < 2:986855/141‑1 (MQ=255) aaGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGa > 1:1203451/1‑141 (MQ=255) aaGTTTTACCTAATTTATTTACATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCCCTAAATAACGGCTGa > 1:829824/1‑141 (MQ=255) tttttACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACt < 2:1370555/140‑1 (MQ=255) tttACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCa < 2:82254/141‑1 (MQ=255) tttACCTAAGTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCa < 2:828258/141‑1 (MQ=255) aCCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATAc > 2:119230/1‑141 (MQ=255) aCCTAATTTACTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATAc > 2:630819/1‑141 (MQ=255) aaTTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAAGAACGGCTGACTCTTACATCt < 1:857460/141‑1 (MQ=255) ttCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTTGGCCTc > 2:875937/1‑141 (MQ=255) ttCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTc > 2:1044232/1‑141 (MQ=255) cATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTccc > 1:486100/1‑140 (MQ=255) tatTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACCTCTTGGGCCTCCGCGTccc > 1:900723/1‑140 (MQ=255) aaTCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTa > 1:526493/1‑141 (MQ=255) aaTCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGCTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTa < 1:703634/141‑1 (MQ=255) agctcCCCTAAGAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTAc < 2:1288022/139‑1 (MQ=255) acctcCCCTAATAAAGCTGGTAAACATCGTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTCACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGCGCCTCCGCGTCCACGTAc < 1:350210/139‑1 (MQ=255) aTCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTATAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCTTCCCCGTCCACGtcc > 1:13714/1‑139 (MQ=255) aTCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTGTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTAc < 2:992959/141‑1 (MQ=255) tctcCCCTTATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACa < 2:305152/141‑1 (MQ=255) tctcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACa < 1:942187/141‑1 (MQ=255) ctcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGCCTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTTGGCCTCCGCGTCCACGTCCaa > 2:825863/1‑141 (MQ=255) ctcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTCCCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACaa > 1:102559/1‑141 (MQ=255) ctcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGCCTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACaa > 2:273700/1‑141 (MQ=255) ctcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTCACTCATACATCTTGGGCCTCTGCGTCCACGTACaa > 1:515605/1‑141 (MQ=255) tcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAg > 1:802772/1‑141 (MQ=255) tcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAg < 1:1182762/141‑1 (MQ=255) cccccTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAg < 2:105647/140‑1 (MQ=255) ccccTTATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGt < 1:152996/141‑1 (MQ=255) ccccTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGt < 1:1104654/141‑1 (MQ=255) ccccTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGt < 1:330522/141‑1 (MQ=255) ccccTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCGCCGCGTCCACGTACAAGt < 2:332365/141‑1 (MQ=255) ccTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTc < 1:642024/141‑1 (MQ=255) cTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATGTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAAAATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTcc > 1:883225/1‑140 (MQ=255) taataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGttagc > 1:671988/1‑138 (MQ=255) aataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTCCAAGTCCACt > 1:625319/1‑141 (MQ=255) aataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACt < 1:535996/141‑1 (MQ=255) aataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACt > 1:777308/1‑141 (MQ=255) aataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACt < 2:655301/141‑1 (MQ=255) aataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACACCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAGGTTCCCt > 1:476020/1‑141 (MQ=255) aaaGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTACAAATTTATATATCTTATCTAAATAACGGCTGACCCATACATCTTGGGCTTCCGCGTCGACGTACAAGTTCACTAcc > 2:104758/1‑141 (MQ=255) | TAATTATTGCAAGTCCACCAGCTTGGCCACCCATATCTGAGATGATATTGAATGCACCACCGCCTATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACC > USA300TCH1516_ALE/72850‑73130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |