New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 72990 = | 134 (1.110) | 7 (0.060) | 3/254 | 9.0 | 5.6% | intergenic (‑17/+69) | arcD_1/arcA_1 | Arginine/ornithine antiporter/Arginine deiminase |
? | USA300TCH1516_ALE | 73054 = | 115 (1.050) | intergenic (‑81/+5) | arcD_1/arcA_1 | Arginine/ornithine antiporter/Arginine deiminase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATACATAGTTGCGATC > USA300TCH1516_ALE/72914‑73193 | tATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTc < 1:1137331/141‑1 (MQ=255) tATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTc < 2:165899/141‑1 (MQ=255) aTAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTATTCTTCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAAt < 1:1350191/141‑1 (MQ=255) gCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTTACTTTTACCACCTTTCACATTTaaa > 2:703174/1‑141 (MQ=255) gCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGATGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACATGGGACTTTTACCACCTATCAAAATTaaa > 2:1236877/1‑141 (MQ=255) ttGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATAtc < 2:680484/140‑1 (MQ=255) aTGACTAAACCATTTATGGAAGTTTTACCTAACTTATTTTCAGCCATATGAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTATTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATAtc < 1:125835/141‑1 (MQ=255) aTGACCAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATAtc < 1:239354/141‑1 (MQ=255) tGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTAAAATTTAGATAtct > 1:1365/1‑141 (MQ=255) tAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTtctc > 1:330263/1‑141 (MQ=255) aaaCCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTctct > 1:494470/1‑141 (MQ=255) aaaCCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTctct < 2:208838/141‑1 (MQ=255) aTTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATaa < 1:726192/141‑1 (MQ=255) aTTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATaa < 2:1117182/141‑1 (MQ=255) ttAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTCCTTGAGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAAc < 2:898690/141‑1 (MQ=255) ttAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTTACTTTTACCACCGTTCATCGTTAAACATCTTCTCTAAATAAc > 2:216623/1‑141 (MQ=255) ttAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCCTCTCTAAATAAc > 1:531529/1‑141 (MQ=255) ttAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTACAATTTAAATATCTTCTCTAATTAAc > 2:887221/1‑141 (MQ=255) aaGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACgg < 2:330263/141‑1 (MQ=255) ggAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCt < 2:986855/141‑1 (MQ=255) aaGTTTTACCTAATTTATTTACATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCCCTAAATAACGGCTGa > 1:829824/1‑141 (MQ=255) tttttACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACt < 2:1370555/140‑1 (MQ=255) gTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACt < 2:1044861/141‑1 (MQ=255) tttACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCa < 2:82254/141‑1 (MQ=255) tttACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCa < 1:234277/141‑1 (MQ=255) ttACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGCATGACTcct > 2:576990/1‑139 (MQ=255) aCCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATAc > 2:119230/1‑141 (MQ=255) aCCTAATTTACTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATAc > 2:630819/1‑141 (MQ=255) aaTTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAAGAACGGCTGACTCTTACATCt < 1:857460/141‑1 (MQ=255) ttCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTc > 2:1044232/1‑141 (MQ=255) cATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTccc > 1:486100/1‑140 (MQ=255) tCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCcgcc > 1:1193852/1‑140 (MQ=255) aaTCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTa > 1:526493/1‑141 (MQ=255) aaTCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGCTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTa < 1:703634/141‑1 (MQ=255) agctcCCCTAAGAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTAc < 2:1288022/139‑1 (MQ=255) aTCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTGTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTAc < 2:992959/141‑1 (MQ=255) tctcCCCTTATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACa < 2:305152/141‑1 (MQ=255) tctcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACa < 1:942187/141‑1 (MQ=255) ctcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGCCTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTTGGCCTCCGCGTCCACGTCCaa > 2:825863/1‑141 (MQ=255) ctcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTCCCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACaa > 1:102559/1‑141 (MQ=255) ctcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGCCTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACaa > 2:273700/1‑141 (MQ=255) ctcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTCACTCATACATCTTGGGCCTCTGCGTCCACGTACaa > 1:515605/1‑141 (MQ=255) tcCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAg > 1:802772/1‑141 (MQ=255) cccccTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAg < 2:105647/140‑1 (MQ=255) ccccTTATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGt < 1:152996/141‑1 (MQ=255) ccccTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGt < 1:330522/141‑1 (MQ=255) ccccTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGt < 1:1104654/141‑1 (MQ=255) ccTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTc < 1:642024/141‑1 (MQ=255) gtaataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCCTCTCTAAATAACGGCTAACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCa < 2:832703/140‑1 (MQ=255) cTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATGTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAAAATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTcc > 1:883225/1‑140 (MQ=255) taataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCAc > 1:1376310/1‑141 (MQ=255) aataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTCCAAGTCCACt > 1:625319/1‑141 (MQ=255) aataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACt < 1:535996/141‑1 (MQ=255) aataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACt < 2:655301/141‑1 (MQ=255) aataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACt > 1:777308/1‑141 (MQ=255) aataaAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACACCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAGGTTCCCt > 1:476020/1‑141 (MQ=255) aaaGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACATTTAAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTAcc > 2:346192/1‑141 (MQ=255) ggtggtAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGt < 1:962899/141‑1 (MQ=255) ggtAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAAt > 2:1021358/1‑141 (MQ=255) ggtAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAAt > 1:47355/1‑141 (MQ=255) ggtAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCAACGTACAAGTCCACTACCAGTAAt > 1:123824/1‑141 (MQ=255) tAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAAttt < 2:1242058/141‑1 (MQ=255) tAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATCACTGAATTCATATTGACTTTTACCACCTTTCAAATGTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGTCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAAttt < 2:1142005/141‑1 (MQ=255) aaaaaTCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTc < 2:494470/141‑1 (MQ=255) aaaaaTCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTc < 2:1193194/141‑1 (MQ=255) aaaaTCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCa > 2:1086028/1‑141 (MQ=255) tCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCa < 1:399005/141‑1 (MQ=255) cTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCTCCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCAc < 1:1056476/141‑1 (MQ=255) atgaatgaATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTcg > 1:616415/1‑141 (MQ=255) tgaatgaaTTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTcgc > 2:1125366/1‑141 (MQ=255) atgaatTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCGCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCATCCGCGTCCACGTACAATTTAACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCTCGTa > 2:873784/1‑141 (MQ=255) aatTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCAACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTaaag > 2:344932/1‑140 (MQ=255) atTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAACTATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAg > 1:456133/1‑141 (MQ=255) atTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTTACTACCAGTAATTCAAATCCCTTTAATTCCTTTGTCGCCTAACAg > 2:550887/1‑141 (MQ=255) atTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAg < 1:119230/141‑1 (MQ=255) atTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAg < 1:630819/141‑1 (MQ=255) ttACTTGTGACTTTTACCCCCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGt < 1:1371065/141‑1 (MQ=255) ttACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGt < 1:1306293/141‑1 (MQ=255) ttGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGt > 1:153617/1‑141 (MQ=255) gtgACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCGTACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCGCTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGttt > 1:912839/1‑141 (MQ=255) gtgACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTCAAAGTTGGttt > 1:362174/1‑141 (MQ=255) gtgACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGttt > 1:1333011/1‑141 (MQ=255) gtgACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGttt > 1:734516/1‑141 (MQ=255) aCTTTTACCCCCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGAt < 2:700389/141‑1 (MQ=255) aCTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAGCGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGAt < 2:695841/141‑1 (MQ=255) tACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATACATa > 2:908738/1‑141 (MQ=255) tACCACCTTCCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATACATa > 1:1004717/1‑141 (MQ=255) ttcaccTTTCAAATTTAAATGTCTTCTCTAATTTACGGCTGACTTATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATACATAg < 1:25738/139‑1 (MQ=255) accaccTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATACATAg < 2:594771/141‑1 (MQ=255) accaccTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATACATAg < 2:78546/141‑1 (MQ=255) ccaccTTTCTAAGTGTAATATCTTCTCTAAATAACGGCCTACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTATAAGTTGGTTTGATACATAGt < 2:550792/141‑1 (MQ=255) ccaccTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGCTAACTAGt > 1:903099/1‑141 (MQ=255) ccaccTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGCCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTATAAATGCACCAATTTCAATCACTCTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATACATAgc > 1:995570/1‑140 (MQ=255) ccaccTTCCAAATTTAAATATCATCCCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATACATAGt < 1:1274493/141‑1 (MQ=255) accTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATCCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATCCATAGTTg > 2:520330/1‑141 (MQ=255) accTTTCAAATTTAAATATCTTCTATAATAAACAGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATCCATAGTTg > 1:657772/1‑141 (MQ=255) cTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCCCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCCATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTCGTTTGATACAGAGTTACg > 1:1087512/1‑141 (MQ=255) cTTTCAAATTTAAATATCTTCGCTAAATAACGGCTAAATCATACGTCTTTGGCACCAGAGTCAACGTACACGTTCACTACCAGAACTTTAGATGACTTGATTTCCTTCGTCGCGTAAAAGTAGATTTAATACAGATTTGCg > 2:372560/1‑141 (MQ=255) tCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTCAAAGTTGGTTTGATACATAGTTGAGATc > 2:678330/1‑141 (MQ=255) tCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATACATAGTTGCGATc > 2:1047824/1‑141 (MQ=255) | TATCATAGAGCCTATGACTAAACCAATTAAGGAAGTTTTACCTAATTTATTTTCATCCATATTAATCTCCCCTAATAAAGGTGGTAAAAATCTTGTTATTTGATTTAATGAATGAATTACTTGTGACTTTTACCACCTTTCAAATTTAAATATCTTCTCTAAATAACGGCTGACTCATACATCTTGGGCCTCCGCGTCCACGTACAAGTTCACTACCAGTAATTTCAATCACTTTAATTCCTTTGTCGCGTAAAAGTTGGTTTGATACATAGTTGCGATC > USA300TCH1516_ALE/72914‑73193 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |