New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2406948 = | 167 (1.380) | 8 (0.070) | 3/266 | 9.3 | 5.0% | coding (613/1716 nt) | ureC | Urease subunit alpha |
? | USA300TCH1516_ALE | 2406995 = | 144 (1.250) | coding (660/1716 nt) | ureC | Urease subunit alpha | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
GTAACTCCAGGTCCATGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACAATGGCTGCTGT > USA300TCH1516_ALE/2406855‑2407135 | gTAACTCCAGGTCCGTGGCCTATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTa > 1:749848/1‑141 (MQ=255) aGGTCCATGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGGTTAAAAGTACa > 1:235869/1‑141 (MQ=255) gTCCATGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATg < 2:305701/141‑1 (MQ=255) gTCCATGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATg < 1:660290/141‑1 (MQ=255) ccACGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTCACAAGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAACTGGATTAAAAGTACATGaa < 2:2135/141‑1 (MQ=255) cATGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAg < 1:559924/141‑1 (MQ=255) cATGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAg < 1:279285/141‑1 (MQ=255) aTGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGGGACATTGGAGTAAAAGTCCATGAAGa > 2:1105687/1‑141 (MQ=255) aTGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGa > 2:1001897/1‑141 (MQ=255) aTGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGa > 1:815194/1‑141 (MQ=255) aTGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGACGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATCGGATTACAAGTACATGAAGa > 2:1131688/1‑141 (MQ=255) tGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGAc < 2:171487/141‑1 (MQ=255) ggCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACt < 1:1162564/141‑1 (MQ=255) gCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTg < 1:626448/141‑1 (MQ=255) cATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAAATGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTgg < 2:996004/141‑1 (MQ=255) cATATTCATAGAATGTGAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTgg < 1:470534/141‑1 (MQ=255) atatTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTggg > 2:575185/1‑141 (MQ=255) tatTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTgggg < 1:1081945/141‑1 (MQ=255) cATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATTCCGGAGCAATTGGATTACAAGTACATGAAGACTGGGGTACa > 2:352222/1‑141 (MQ=255) cATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCAGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGAGCa > 2:411284/1‑141 (MQ=255) cATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGAAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCa > 2:683218/1‑141 (MQ=255) gTTAGACGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATc < 2:362263/141‑1 (MQ=255) tAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGAAACACCATATg > 1:1017177/1‑141 (MQ=255) tAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGAACAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTg > 1:116894/1‑141 (MQ=255) aGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCttt < 1:701445/141‑1 (MQ=255) aGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGAAAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCttt < 1:287614/141‑1 (MQ=255) aGCTGCCGAAGGTTGACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCttt < 1:273380/141‑1 (MQ=255) aGCTGCCGAAGGTGTACCGATTACTGTGGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACCAATCAATGCCGGAGCACTTGGATTAAAAGTACACGAAGACTGGGGTGCAACCCCATCTGCttt < 2:861233/141‑1 (MQ=255) tGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGACGACTGGGGTGCAACACCACATGCGTTGAg > 2:778716/1‑141 (MQ=255) tGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAg > 1:1248465/1‑141 (MQ=255) ccGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCACCACCATCTGCTTTGAgcc > 2:110087/1‑139 (MQ=255) cGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTACAGGACAACCAACGAATCCAACTACGCGCGGTGAACAAATCGATGCCGTAGCAATGGGATTCAAAGTCCATGAAAACAGGGGTGAGAAACCAGCGGCttgcggtaa > 2:342828/1‑134 (MQ=255) cGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCa < 1:1214199/141‑1 (MQ=255) cGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCa < 1:1174709/141‑1 (MQ=255) cGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCCTTGAGtaa > 2:1240864/1‑139 (MQ=255) gAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCCACTGCCCTCATTGAACAAATCAATGCGGGAGCAGTTGAGTTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGTGTGAt > 1:148763/1‑141 (MQ=255) gAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAAACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCAt > 1:14691/1‑141 (MQ=255) aGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCCACACCATCGTCTTTGAGACAtta > 2:863173/1‑139 (MQ=255) tAATGTCGGTTTGACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACACATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGc < 2:204223/141‑1 (MQ=255) aTGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCACCTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGAGTAAAAGTACATGAAGACTGTGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCtg < 2:1356212/141‑1 (MQ=255) aTGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGAGGTTGCtg > 2:1291490/1‑141 (MQ=255) tGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCtga < 1:166731/141‑1 (MQ=255) ggTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGaa > 1:1338753/1‑141 (MQ=255) ttACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTg > 1:809177/1‑141 (MQ=255) tACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAg > 1:735146/1‑122 (MQ=255) tACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAg < 2:735146/122‑1 (MQ=255) tACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGa < 1:991488/141‑1 (MQ=255) cAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAAATATACTCGGTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATg > 1:1359238/1‑141 (MQ=255) agctAAAGGAAAAGGAATAAATCCAACCGCACTCCTTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACGGGGGTGCAACACCATCTGCTCTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGt < 1:211780/138‑1 (MQ=255) aGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCACCTGCACTGATTGAACAAATGAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGt < 1:1142379/141‑1 (MQ=255) aGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATCTTGCTGATGAATTTGATGt < 1:725460/141‑1 (MQ=255) gTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATTAATTTGATGTTc < 1:706423/141‑1 (MQ=255) gTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTc < 2:809177/141‑1 (MQ=255) gTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAAAAAAACAAGGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACCGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTc < 1:229204/141‑1 (MQ=255) aaaGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCaa > 1:7240/1‑141 (MQ=255) aaaGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGAACAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGCTCaa < 1:933257/141‑1 (MQ=255) aGGACAAGCAACAAATTCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACTATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAAt < 2:1139236/141‑1 (MQ=255) ggACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACGCCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGTTGATAAATTTGATGTTCAAAtt > 1:806289/1‑141 (MQ=255) ggACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAAtt > 1:94395/1‑141 (MQ=255) gACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTg > 1:438603/1‑141 (MQ=255) aCAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGc < 2:504403/141‑1 (MQ=255) gCAACAAATCCAACTGCACTCAATGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTa > 2:1327783/1‑141 (MQ=255) gCAACAAATCCAAATGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTAAGTGGAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGCGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTa > 2:40192/1‑141 (MQ=255) tCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGa < 2:808321/141‑1 (MQ=255) ccAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGATCAAATTGCATTACATGCAGAt > 2:340507/1‑141 (MQ=255) aaCTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAGAGTACATGAATACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATAc < 2:618655/141‑1 (MQ=255) aaCTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATAc < 2:1252514/141‑1 (MQ=255) cTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACtt > 1:96328/1‑141 (MQ=255) tGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACttt > 1:1124806/1‑141 (MQ=255) cACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTaa > 1:882745/1‑141 (MQ=255) cATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCGAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGa > 1:370558/1‑141 (MQ=255) cATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGa > 2:1240785/1‑141 (MQ=255) cATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGa > 2:689647/1‑141 (MQ=255) cATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATATTCAAATTGCATTACATGCCGATACTTTAAAtaa > 1:337024/1‑139 (MQ=255) tGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGc < 1:449836/141‑1 (MQ=255) gAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCa < 1:1031897/141‑1 (MQ=255) aCAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAgg > 1:199946/1‑141 (MQ=255) aCAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAgg > 1:1201869/1‑141 (MQ=255) aCAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAgg < 2:958256/141‑1 (MQ=255) cAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACACGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTAt < 1:32019/141‑1 (MQ=255) aaTGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATg < 1:1065352/141‑1 (MQ=255) aaTGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATg > 2:503600/1‑141 (MQ=255) aaTGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATg < 1:1330203/141‑1 (MQ=255) tgtcGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGa < 2:609622/138‑1 (MQ=255) tGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGa < 2:565180/141‑1 (MQ=255) tGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGa < 2:135462/141‑1 (MQ=255) gactgAGCAATTCGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGACGAAGTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGaa < 1:133487/137‑1 (MQ=255) gCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGCTGTTCAAATTGCATTACATGCCGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGaa > 2:487947/1‑141 (MQ=255) gCCGGAGCAATGGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGaa < 1:618954/141‑1 (MQ=255) ggAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGCATTTATGGAAGaa > 2:420185/1‑140 (MQ=255) aaTTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACaag > 1:402520/1‑140 (MQ=255) tGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACAATGgc < 1:89162/141‑1 (MQ=255) tGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACAATGgc > 2:473133/1‑141 (MQ=255) tGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACAATGgc > 2:1130240/1‑141 (MQ=255) tGGATTAAAAGGACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACAATGgc < 2:953770/141‑1 (MQ=255) cttAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACAATGgctgc > 2:1187777/2‑141 (MQ=255) aTTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACAATGgctgc < 2:7240/141‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACAATGgctgc > 2:284036/1‑141 (MQ=255) aaaaGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACAAAGGCGGCGGt > 2:1183162/1‑141 (MQ=255) aaaaGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGAGGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACAATGGCTGCTGt > 2:617770/1‑141 (MQ=255) | GTAACTCCAGGTCCATGGCATATTCATAGAATGTTAGAAGCTGCCGAAGGTTTACCGATTAATGTCGGTTTTACAGGTAAAGGACAAGCAACAAATCCAACTGCACTCATTGAACAAATCAATGCCGGAGCAATTGGATTAAAAGTACATGAAGACTGGGGTGCAACACCATCTGCTTTGAGTCATGCATTAGATGTTGCTGATGAATTTGATGTTCAAATTGCATTACATGCAGATACTTTAAATGAAGCAGGATTTATGGAAGACACAATGGCTGCTGT > USA300TCH1516_ALE/2406855‑2407135 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |