New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
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tcattaactgataagcAGAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGTGAATTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGATGTTATGTTTTTAAGACGCTTATCATAAGTAATGAg < 2:248483‑M1/125‑1 (MQ=255) aaGATTATGCGAGGAGAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTCAGCCGCTTCATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTTATCATAAGTAATGAGGt < 3:237273/141‑1 (MQ=255) gATTATGCGAGGAGAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTCAGCCGCTTCATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTTATCATAAGTAATGAGGTTc > 4:103708/1‑141 (MQ=255) aTTATGCGAGGAGAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTCAGCCGCTTCATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTTATCATAAGTAATGAGGTTCa < 1:962968/141‑1 (MQ=255) ttATGCGAGGAGAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTCAGCCGCTTCATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTTATCATAAGTAATGAGGTTCAt > 2:387111/1‑141 (MQ=255) ttATGCGAGGAGAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTCAGCCGCTTCATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTAATCATAAGTAATGAGGTTCAt < 4:483029/141‑1 (MQ=255) tGCGAGGAGAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTCAGCCGCTTCATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTTATCATAAGTAATGAGGTTCATGAt > 3:59721/1‑141 (MQ=255) tGCGAGGAGAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTCAGCCGCTTCATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTTATCATAAGTAATGAGGTTCATGAt > 1:739381/1‑141 (MQ=255) gaggagAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTCAGCCGCTTCATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTTATCATAAGTAATGAGGTTCATGGtttt < 2:693108/141‑1 (MQ=255) aggagAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTCATCCGCTTAATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGGTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTTATCATAAGTAATGAGGTTCATGAttttt > 1:1024770/1‑141 (MQ=255) ggagAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTCAGCCGCTTCATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTTATCATAAGTAATGAGGTTCATGATTTTTg > 1:193996/1‑141 (MQ=255) AGAAGAATATCATAAATGTTGTTGTTGTTTCAGCCGCTTCATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTTATCATAAGTAATGAGGTTCCTCACTTTTGAc > 4:18754‑M1/1‑141 (MQ=255) | GGCGGATCAAACGGCCTGCACAAGGACGTCTTACAACGCAGTAACTACGCACTATCATTCAGCAAAATGACATTCCCACATCAAATGATGCGGGTTGTGTTAATTGAACAAGTGTACAGAGCATTTAAGATTATGCGAGGAGAAGCATATCATAAATGATGCGGTTTTTTCAGCCGCTTCATAAAGGGATTTTGAATGTATCAGAACATATGAGGTTTATGTGAATTGCTGTTATGTTTTTAAGAAGCTTATCATAAGTAATGAGGTTCATGATTTTTGAC > USA300TCH1516_ALE/34033‑34313 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |