New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 34173 = | 131 (0.940) | 12 (0.090) | 12/246 | NT | 8.0% | coding (462/480 nt) | rlmH | Ribosomal RNA large subunit methyltransferase H |
? | USA300TCH1516_ALE | = 57858 | 151 (1.130) | intergenic (+304/+613) | USA300HOU_RS00240/USA300TCH1516_00049 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
ACTGTATTAGTTTAATCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTATGGCCACTAACTGCTTTTT > USA300TCH1516_ALE/57720‑57998 | aCTGTATTAGTTTAATCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTGCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCag > 3:102863‑M2/1‑139 (MQ=255) tGTATTAGTTTAATCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCagaa < 1:1112701‑M2/141‑5 (MQ=255) tATTAGTTTAATCAGAAGACGTGTCCACTATGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGGTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑ATAAACAGCATTATTAACTGATAAGCagaagc < 2:1129778‑M2/141‑7 (MQ=255) aTTAGTTTAATCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCg < 4:403534/141‑1 (MQ=255) aGTTTAATCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCagaagcatat > 3:480560‑M2/1‑131 (MQ=255) aGTTTAATCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTAt < 2:838605/141‑1 (MQ=255) aGTTTAATCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTAt < 3:161704/141‑1 (MQ=255) aGTTTAATCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTAt > 3:359154/1‑141 (MQ=255) gTTTAATCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATc < 2:164754/141‑1 (MQ=255) tttAATCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATca < 3:325108/141‑1 (MQ=255) aaTCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTCAAAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATcaca > 4:136736/1‑141 (MQ=255) aaTCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCagaagcatatcataa > 1:724‑M2/1‑126 (MQ=255) aaTCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACaa > 2:1015001/1‑141 (MQ=255) aaTCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACaa > 2:1085518/1‑141 (MQ=255) aaTCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACaa > 1:56196/1‑141 (MQ=255) aaTCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACaa > 2:452316/1‑141 (MQ=255) aaTCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTGTGTTGTGCGGCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACaa > 1:415561/1‑141 (MQ=255) aagaCGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATaaaa > 3:451600/1‑141 (MQ=255) agaCGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTCCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAAc < 2:111893/141‑1 (MQ=255) cgtgggtACTTTGTAAGCGGCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAGAACTaa > 4:240676/7‑141 (MQ=255) cGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTaa > 1:96459/1‑141 (MQ=255) aatgtCTACTTTTTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATATCGTTTGAGTTTTGTTGTTCATCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAAACGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCTTATAAAAAATAAAACTaa < 2:1192358/139‑1 (MQ=255) gtgtCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTaca > 4:422905/1‑139 (MQ=255) gtgtCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTA‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTaaa < 2:690333/141‑1 (MQ=255) gtCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTaaaaa < 2:153259/141‑1 (MQ=255) gtCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTaaaaa < 1:556367/141‑1 (MQ=255) tCTACTTTGTAAGCTTCTCAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTaaaaaa > 2:1193072/1‑141 (MQ=255) tCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTaaaaaa > 1:465307/1‑141 (MQ=255) tCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATAATATAGCCTTTGATTTTTTTTGTTCTTCTATAAATTTCTGAAAAAAAAAAAA‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTaaaaaa < 2:1147422/141‑1 (MQ=25) cTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAAt > 4:144214/1‑141 (MQ=255) tttGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGAt < 4:10559/141‑1 (MQ=255) tttGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGAt < 1:181223/141‑1 (MQ=255) gTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATtgt > 1:88281/1‑141 (MQ=255) gTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATtgt > 2:614622/1‑141 (MQ=255) gTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATtgt > 3:99238/1‑141 (MQ=255) tAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATtgtg > 2:477576/1‑141 (MQ=255) aGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGta > 4:161351/1‑141 (MQ=255) aGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGta > 4:66308/1‑141 (MQ=255) gCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCagaagcataacataattgaagcgtttttttcagccgcttca > 2:600570‑M2/1‑100 (MQ=255) gCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGtat < 2:729508/141‑1 (MQ=255) gCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGtat < 1:363070/141‑1 (MQ=255) gCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGtat < 4:327138/141‑1 (MQ=255) ttCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTT‑TTTTTTTTCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGtataa > 2:76802/1‑141 (MQ=255) cTAATAACTTATTATATGATATAGCTTTTGAGTTTTGTTTTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGtataata < 2:906519/141‑1 (MQ=255) cTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGtataata > 1:441177/1‑141 (MQ=255) aGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGtataatataa > 2:726539/1‑141 (MQ=255) aaCTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATaaaa < 1:1149947/141‑1 (MQ=255) aCTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAaag > 3:408792/1‑141 (MQ=255) ttattaTATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAaagga > 1:647337/1‑141 (MQ=255) tattatATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAaaggaa < 1:549534/141‑1 (MQ=255) ttatATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTATTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAaaggaagg < 1:747587/141‑1 (MQ=255) tataTGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTT‑TTTTTTTTTATCATTAACTGATAAGCACAAGATTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAaaggaaggt > 2:958595/1‑140 (MQ=255) tatGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGAt > 1:58789/1‑141 (MQ=255) gATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAACTAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTta > 2:65373/1‑141 (MQ=255) gATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTta > 3:173862/1‑141 (MQ=255) atatAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTtat > 1:956312/1‑141 (MQ=255) ataGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTatat < 2:778037/141‑1 (MQ=255) aGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTATTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTa < 1:125757/141‑1 (MQ=255) gCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTaa > 2:332117/1‑141 (MQ=255) gCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTaa > 1:227751/1‑141 (MQ=255) cGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTaaa > 2:582604/1‑141 (MQ=255) tttGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAAt > 1:790914/1‑141 (MQ=255) tttGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAAt > 3:404000/1‑141 (MQ=255) tGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTT‑TTTTTTTTTATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAAttt > 2:584936/1‑141 (MQ=255) tGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTG‑CAAAAGTGCATCATTAAATGATAAGCAGAAGAGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGCAAGGAATTTATATTAAAAttt > 4:295056/1‑141 (MQ=255) gTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATAATTAAAAAATAAAAAGAAGCGTAGGACAAATAAAGCTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTCTATTaaaaaaaaaa < 2:842732/141‑7 (MQ=255) tttGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAAt < 1:688300/141‑1 (MQ=255) ttgttgTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAAtt < 1:1063596/141‑1 (MQ=255) tgttgtTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTc > 2:1077628/1‑141 (MQ=255) tgttCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCaaa > 2:538385/1‑141 (MQ=255) tcttctATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCagaagcatatcataaatgatgcggttttttcagccgcttcataaagggattttgaatgtatcagaacatatgaggtttatgtgaat < 1:1004734‑M2/141‑87 (MQ=255) tcttctATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAat > 4:96431/1‑141 (MQ=255) tcttctATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGGATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAat > 2:389126/1‑141 (MQ=255) cttctATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAatt > 2:1044001/1‑141 (MQ=255) taAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGaa > 2:798363/1‑141 (MQ=255) taAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGaa > 3:277275/1‑141 (MQ=255) tttCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAggg > 2:359282/1‑141 (MQ=255) tCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGAATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGaa < 1:1023773/141‑1 (MQ=255) gTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTAcc < 2:385472/141‑1 (MQ=255) gTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTAcc < 1:482675/141‑1 (MQ=255) aTTTTTC‑AAAAACTGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTa > 4:178915/1‑141 (MQ=255) tC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAAt < 1:53468/141‑1 (MQ=255) aaaaaCCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTg < 3:116110/141‑1 (MQ=255) aaaaaCCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTg > 3:214615/1‑141 (MQ=255) aaaCCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGaa > 1:800922/1‑141 (MQ=255) aaaCCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGaa > 2:883526/1‑141 (MQ=255) cGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTa > 2:1105544/1‑141 (MQ=255) cGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTa > 2:403319/1‑141 (MQ=255) cGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTa > 2:725715/1‑141 (MQ=255) gCATCATTAACCGATACGCagaagcatatcataaatgatgcggttttttcagccgcttcataaagggattttgaatgtatcagaacatatgaggtttgtgtgaattgctgttatgtttttaagaagcttatcataagtaat < 1:938294‑M2/141‑123 (MQ=255) catcatTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTATg > 4:209329/1‑141 (MQ=255) atcatTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTATgg > 1:575039/1‑141 (MQ=255) tcatTAACTGATAAGCagaagcatatcataaatgatgcggttttttttttttttttttaaagtgaatttgaatgtatcagaacatatgaggtttatgtgaattgatgttatgtttttaagacgcttatcataagtaatgag < 2:248483‑M2/141‑126 (MQ=255) tcatTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTATGGc > 1:331378/1‑141 (MQ=255) ttAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAGAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTATGGCCAc < 1:1083771/141‑1 (MQ=255) ttAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTATGGCCAc < 1:407267/141‑1 (MQ=255) tGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTATGGCCACTAACt < 2:1048079/141‑1 (MQ=255) aaGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTATGGCCACTAACTGCtt < 1:97866/141‑1 (MQ=255) aaGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTATGGCCACTAACTGCtt > 1:1016369/1‑141 (MQ=255) cAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTATGGCCACTAACTGCttttt > 4:298730/1‑141 (MQ=255) | ACTGTATTAGTTTAATCAGAAGACGTGTCTACTTTGTAAGCTTCTAAGAACTTATTATATGATATAGCGTTTGAGTTTTGTTGTTCTTCTATAAATTTCTGTAGTTATTTTTC‑AAAAACCGCATCATTAACTGATAAGCAGAAGCGTATCACAAATAAAACTAAAAAATAGATTGTGTATAATATAAAAGGAAGGGATTTATATTAAAATTTTGAATTCAAAAATTATTGAAAGGGAAGCTACCTTAGAAATTGAATCTATGGCCACTAACTGCTTTTT > USA300TCH1516_ALE/57720‑57998 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |