| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2724829 | 146 (1.040) | 3 (0.020) | 3/246 | NT | 2.1% | coding (466/1107 nt) | USA300HOU_RS14015 | Baeyer‑Villiger flavin‑containing monooxygenase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2724865 | 134 (1.010) | coding (430/1107 nt) | USA300HOU_RS14015 | Baeyer‑Villiger flavin‑containing monooxygenase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
CATTTAAACCGGTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAA > USA300TCH1516_ALE/2724691‑2724969 | tAAACCGGTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACtata < 1:75604/141‑1 (MQ=255) aaCCGGTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAAt < 1:299552/141‑1 (MQ=255) cGGTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGaa > 2:789612/1‑141 (MQ=255) cGGTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGaa < 2:694575/141‑1 (MQ=255) cGGTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGaa < 1:311887/141‑1 (MQ=255) ggTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTTTTTTTTTTTATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAAt > 2:711160/1‑141 (MQ=255) ggTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAAt > 2:792696/1‑141 (MQ=255) gTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATa > 3:180556/1‑141 (MQ=255) gTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATa > 1:136966/1‑141 (MQ=255) gTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATa > 3:422184/1‑141 (MQ=255) gTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTCCAATTTCACTATAATGAATa > 2:237412/1‑141 (MQ=255) gtgCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCa > 2:421876/1‑141 (MQ=255) gCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCata < 2:649921/141‑1 (MQ=255) gCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCata < 2:239664/141‑1 (MQ=255) cTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGTCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCatat > 2:544240/1‑141 (MQ=255) cTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCatat > 2:1114379/1‑141 (MQ=255) gTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTa < 1:683507/141‑1 (MQ=255) gtaAAGTGCGATGTCAGAGGCATTTTTTGCAAGTGGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTTTTAAAGTTATCAAAGTCGTCAATTTCACTATGATGAATACCATATTTaaa < 2:214130/140‑1 (MQ=255) taAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAAt < 4:288610/141‑1 (MQ=255) taAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCACTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAAt < 1:212707/141‑1 (MQ=255) taAAGTGCGATCTCAGATCCATTTTTTACAAGTTAATATGTAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAACTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAAt < 2:875115/141‑1 (MQ=255) aaaGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTCCCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATg < 1:833925/141‑1 (MQ=255) aaaGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAGGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATg < 2:574343/141‑1 (MQ=255) aaaGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATg > 2:1155605/1‑141 (MQ=255) aaaGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATg < 2:492515/141‑1 (MQ=255) aaGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATgg > 3:245736/1‑141 (MQ=255) aaGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATgg < 2:152260/141‑1 (MQ=255) aGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGc > 1:331819/1‑141 (MQ=255) tGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCtt < 1:176550/141‑1 (MQ=255) tGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCtt > 4:389426/1‑141 (MQ=255) cGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCTCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCtttt > 1:269109/1‑141 (MQ=255) cGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCAGATTTAAATGGCtttt > 1:990066/1‑141 (MQ=255) aTGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTa < 1:752551/141‑1 (MQ=255) aTGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTa > 1:147844/1‑141 (MQ=255) tGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAg < 1:897204/141‑1 (MQ=255) tGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAg > 2:872641/1‑141 (MQ=255) tGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTGAg < 1:633447/141‑1 (MQ=255) agagCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGgaa < 1:86445‑M2/141‑4 (MQ=255) gagCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGgaaa < 1:331854‑M2/141‑5 (MQ=255) gCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGgaaatt < 2:196193‑M2/141‑7 (MQ=255) ccATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCcctaaaaagccatttaaatatggtattcattatagtgaaattg < 2:293828‑M1/141‑44 (MQ=255) aTTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATtata < 1:404956/141‑1 (MQ=255) ttttttGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATaa > 4:187074/1‑141 (MQ=255) gCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAAACACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCt > 3:417582/1‑141 (MQ=255) aaGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGt > 3:266142/1‑141 (MQ=255) aaGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGt < 3:11763/141‑1 (MQ=255) atGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACaa < 2:241655/141‑1 (MQ=255) tGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACaaa > 3:455673/1‑141 (MQ=255) tGCAGAATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACaaa > 1:335447/1‑141 (MQ=255) cagcaTCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTATTTCGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGa > 2:858380/1‑141 (MQ=255) caTCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGatat > 4:397196/1‑141 (MQ=255) aaGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCATTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATcc > 1:631621/1‑141 (MQ=255) gCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCcgc > 3:382348/1‑141 (MQ=255) gCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACAGATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAAGTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCcgc < 2:668426/141‑1 (MQ=255) ccACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCcgcg < 1:154105/141‑1 (MQ=255) cACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGt < 3:452564/141‑1 (MQ=255) cTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGa < 2:331819/141‑1 (MQ=255) ttCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGata < 2:762164/141‑1 (MQ=255) tCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGatat > 2:329793/1‑141 (MQ=255) tCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGatat < 1:5889/141‑1 (MQ=255) tCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGatat < 1:978134/141‑1 (MQ=255) tCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTATTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGatat > 2:1091455/1‑141 (MQ=255) cATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGatata > 2:1169933/1‑141 (MQ=255) cATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGatata > 2:564539/1‑141 (MQ=255) ttACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATAtc > 4:299204/1‑141 (MQ=255) aCCTCCGATAAACACAAATTGCACCAAATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATAtctc > 4:124525/1‑141 (MQ=255) cTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCtg > 4:127911/1‑141 (MQ=255) cTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCtg < 1:1045823/141‑1 (MQ=255) gATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCtgttgt > 4:342598/1‑141 (MQ=255) aTAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTc < 3:40758/141‑1 (MQ=255) aCCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGtt > 1:514446/1‑141 (MQ=255) aCCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGtt < 1:1058866/141‑1 (MQ=255) cacaTATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGc < 1:476627/141‑1 (MQ=255) caTATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCaa > 2:937246/1‑141 (MQ=255) tatTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATc < 4:210446/141‑1 (MQ=255) atTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCg < 1:438299/141‑1 (MQ=255) atTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCg < 1:166520/141‑1 (MQ=255) gCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGtat > 1:104642/1‑141 (MQ=255) gCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGtat < 2:990066/141‑1 (MQ=255) gCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGtat > 1:495707/1‑141 (MQ=255) cccgTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTCGGGAAATTATAATCAACTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCCtata > 2:391497/1‑141 (MQ=255) ccccTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGtata > 4:427798/1‑141 (MQ=255) ccccTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGtata < 2:389823/141‑1 (MQ=255) attaAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGc < 4:500555/141‑1 (MQ=255) ttaAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGca < 2:315773/141‑1 (MQ=255) taAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGcat > 3:30633/1‑141 (MQ=255) taAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGcat > 3:470978/1‑141 (MQ=255) aaGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGcatca < 2:975415/141‑1 (MQ=255) tCAAAGTTTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGTTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACa < 4:168498/141‑1 (MQ=255) tCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGatata > 1:350687/1‑141 (MQ=255) cTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATATCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGatatat < 1:87255/141‑1 (MQ=255) cAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTTTTTTTTTTTTAATCACATGTTCAGACAAAGATATTATATGCGTTATATTTCTCTGTTGTCGTTGTATTCGTATAATATGAATCATCTACATAGAAATTtg > 2:1089179/1‑141 (MQ=255) cAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGgaaattgaagactttgataactttaataaggggcaatatgtggttatcggaggtaatgaaagtggctttgatgctgcatatcaacttgcaaaaaatgg < 2:293828‑M2/141‑99 (MQ=255) aaTTTCcctaaaaagccatttaaatatggtattcattatagtgaaattgaagactttgataactttaataaggggcaatatgtggttatcggaggtaatgaaagtggctttgatgctgcatatcaacttgcaaaaaatggc < 2:196193‑M1/141‑136 (MQ=255) aaTTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTtgt > 2:1077557/1‑141 (MQ=255) aaTTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTtgt > 2:925602/1‑141 (MQ=255) aTTTCcctaaaaagccatttaaatatggtattcattatagtgaaattgaagactttgataactttaataaggggcaatatgtggttatcggaggtaatgaaagtggctttgatgctgcatatcaacttgcaaaaaatggct > 2:414220‑M1/1‑5 (MQ=255) aTTTCcctaaaaagccatttaaatatggtattcattatagtgaaattgaagactttgataactttaataaggggcaatatgtggttatcggaggtaatgaaagtggctttgatgctgcatatcaacttgcaaaaaatggct > 2:665735‑M1/1‑5 (MQ=255) gcACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACa > 1:1132550/2‑141 (MQ=255) cACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACaa > 2:467841/1‑141 (MQ=255) | CATTTAAACCGGTTGTGCTAGTATAAAGTGCGATGTCAGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAA > USA300TCH1516_ALE/2724691‑2724969 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |