| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2724829 | 146 (1.040) | 3 (0.020) | 3/246 | NT | 2.1% | coding (466/1107 nt) | USA300HOU_RS14015 | Baeyer‑Villiger flavin‑containing monooxygenase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2724865 | 134 (1.010) | coding (430/1107 nt) | USA300HOU_RS14015 | Baeyer‑Villiger flavin‑containing monooxygenase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
AGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCGTAATGGTTGG > USA300TCH1516_ALE/2724728‑2725005 | gagCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGgaaa < 1:331854‑M2/141‑5 (MQ=255) aTTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATtata < 1:404956/141‑1 (MQ=255) ttttttGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATaa < 2:1034871/141‑1 (MQ=255) ttttttGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATaa > 4:187074/1‑141 (MQ=255) ttttGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTCGGGAAATTATAATc > 2:675407/1‑141 (MQ=255) ttGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCAc > 4:186079/1‑141 (MQ=255) gCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCt > 1:158239/1‑141 (MQ=255) aaGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGt < 3:11763/141‑1 (MQ=255) aaGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGt > 3:266142/1‑141 (MQ=255) aGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGtt > 4:134821/1‑141 (MQ=255) gATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGa > 1:491635/1‑141 (MQ=255) atatGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGAc > 2:123497/1‑141 (MQ=255) tGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACaaa > 3:455673/1‑141 (MQ=255) tGCAGAATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACaaa > 1:335447/1‑141 (MQ=255) cagcaTCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTATTTCGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGa > 2:858380/1‑141 (MQ=255) agcaTCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGACATCAAAGACTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCAACACAGat > 2:240799/1‑141 (MQ=255) caTCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGatat < 2:60674/141‑1 (MQ=255) caTCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGatat < 4:256926/141‑1 (MQ=255) caTCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGatat > 4:397196/1‑141 (MQ=255) cAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAAt < 4:473785/141‑1 (MQ=255) aaGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCATTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATcc > 1:631621/1‑141 (MQ=255) aGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCcg > 1:682091/1‑141 (MQ=255) gCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCcgc > 3:382348/1‑141 (MQ=255) gCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACAGATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAAGTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCcgc < 2:668426/141‑1 (MQ=255) ccACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATCTTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAACGATATAATCcgcg > 4:296956/1‑141 (MQ=255) ccACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCcgcg < 1:154105/141‑1 (MQ=255) ccACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCcgcg > 4:383651/1‑141 (MQ=255) cACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGt < 3:452564/141‑1 (MQ=255) cTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGa < 2:331819/141‑1 (MQ=255) cTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGa < 1:454718/141‑1 (MQ=255) cTTTCATTACCTCCGATAACCAAATAGTGCCCCTAATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGa < 1:531746/141‑1 (MQ=255) ttCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGata < 2:762164/141‑1 (MQ=255) tCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGatat > 2:329793/1‑141 (MQ=255) tCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGatat < 1:5889/141‑1 (MQ=255) tCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGatat < 1:978134/141‑1 (MQ=255) tCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTATTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGatat > 2:1091455/1‑141 (MQ=255) cATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGatata > 2:564539/1‑141 (MQ=255) ccTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATctct < 3:230285/141‑1 (MQ=255) ccTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATctct < 2:181190/141‑1 (MQ=255) ccTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATctct < 2:262892/141‑1 (MQ=255) cTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCtg < 1:1045823/141‑1 (MQ=255) cTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCtg > 4:127911/1‑141 (MQ=255) gATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCtgttgt > 4:342598/1‑141 (MQ=255) aTAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTc < 3:40758/141‑1 (MQ=255) tAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCg > 2:778336/1‑141 (MQ=255) aCCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGtt < 1:1058866/141‑1 (MQ=255) ccACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTg > 1:783417/1‑141 (MQ=255) acaTATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCa > 1:958042/1‑141 (MQ=255) caTATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCaa > 2:937246/1‑141 (MQ=255) atTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCg < 1:438299/141‑1 (MQ=255) gCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGtat > 1:495707/1‑141 (MQ=255) gCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGtat < 2:990066/141‑1 (MQ=255) gCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGtat > 1:104642/1‑141 (MQ=255) cccgTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTCGGGAAATTATAATCAACTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCCtata > 2:391497/1‑141 (MQ=255) cccTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTataa > 3:421442/1‑141 (MQ=255) cctcattaAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTataat < 2:1078384/137‑1 (MQ=255) ccTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTataat < 2:919866/141‑1 (MQ=255) attaAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGc < 4:500555/141‑1 (MQ=255) ttaAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGca < 2:315773/141‑1 (MQ=255) ttaAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGca < 2:304803/141‑1 (MQ=255) taAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGcat > 3:470978/1‑141 (MQ=255) taAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGcat > 3:30633/1‑141 (MQ=255) aaaGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATGTAAAGTGCTTGTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGcatc > 1:174981/1‑141 (MQ=255) aaGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGcatca < 2:975419/141‑1 (MQ=255) gTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCatcatc > 1:282806/1‑141 (MQ=255) aaaGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGa < 3:247947/141‑1 (MQ=255) tCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGatata > 1:350687/1‑141 (MQ=255) cTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATATCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGatatat < 1:87255/141‑1 (MQ=255) ttCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGCTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATAtt > 2:401092/1‑141 (MQ=255) aaTTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTtgt > 2:925602/1‑141 (MQ=255) aaTTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTtgt > 2:1077557/1‑141 (MQ=255) gcACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACa > 1:1132550/2‑141 (MQ=255) cACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACaa > 2:467841/1‑141 (MQ=255) cACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACaa < 2:1099400/141‑1 (MQ=255) aCTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAAc > 1:1085227/1‑141 (MQ=255) cTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACt > 1:286042/1‑141 (MQ=255) tataATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTg < 2:647812/141‑1 (MQ=255) tataATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTg > 2:22378/1‑141 (MQ=255) tataATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTg < 3:78766/141‑1 (MQ=255) ataATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGt < 2:454242/141‑1 (MQ=255) ataATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGt < 4:164824/141‑1 (MQ=255) tACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTTaa > 2:165162/1‑141 (MQ=255) aCCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCaaa > 4:101746/1‑141 (MQ=255) ccATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAg > 2:137854/1‑141 (MQ=255) atatTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGat < 1:214521/141‑1 (MQ=255) tttAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATAtt > 3:400896/1‑141 (MQ=255) tttAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACATGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGAATTTTCAAAGATAtt > 1:356274/1‑141 (MQ=255) tGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTc < 3:389426/141‑1 (MQ=255) tGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTc < 4:164455/141‑1 (MQ=255) tGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGAGATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTc > 1:415514/1‑141 (MQ=255) ggCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCg < 1:808700/141‑1 (MQ=255) ggCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCg < 4:422184/141‑1 (MQ=255) gCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCGt < 2:282806/141‑1 (MQ=255) tttttAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCGTaa < 1:868323/141‑1 (MQ=255) tttAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCGTAATg < 3:124525/141‑1 (MQ=255) tttAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCGTAATg > 1:1152661/1‑141 (MQ=255) tttAGGGAAATTATAATCAACTGTTGCGACCAACAAATAATCCTCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCGTAATg > 2:950739/1‑141 (MQ=255) aGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCGTAATGGtt > 2:517829/1‑141 (MQ=255) ggAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCGTAATGGTTgg < 2:86445/141‑1 (MQ=255) ggAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCGTAATGGTTgg < 1:898243/141‑1 (MQ=255) | AGAGCCATTTTTTGCAAGTTGATATGCAGCATCAAAGCCACTTTCATTACCTCCGATAACCACATATTGCCCCTTATTAAAGTTATCAAAGTCTTCAATTTCACTATAATGAATACCATATTTAAATGGCTTTTTAGGGAAATTATAATCACCTGTTGCGACAAAGATATAATCCGCGTGATATATCTCTGTTGTCGTTGCAATCGTATAATATGCATCATCTACAGATATATTTGTGACAACTGTATTTTCAAAGATATTCAGCTCGTAATGGTTGG > USA300TCH1516_ALE/2724728‑2725005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |