| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2670076 | 147 (1.050) | 3 (0.020) | 3/234 | NT | 2.2% | intergenic (+13/+69) | yicL/lipR | putative inner membrane transporter YicL/Putative acetyl‑hydrolase LipR |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2670127 | 139 (1.100) | intergenic (+64/+18) | yicL/lipR | putative inner membrane transporter YicL/Putative acetyl‑hydrolase LipR | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
CGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTCAA > USA300TCH1516_ALE/2669988‑2670267 | cGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAATGTTGTTACCTTATAGGTGAt > 3:115781‑M2/1‑140 (MQ=255) gTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAta < 4:354832‑M2/141‑3 (MQ=255) gTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAta < 2:923715‑M2/141‑3 (MQ=255) gTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAta < 3:419292‑M2/141‑3 (MQ=255) tAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtat < 2:526648‑M2/141‑4 (MQ=255) ggCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatca > 4:371905‑M2/1‑136 (MQ=255) gCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatcag > 3:139203‑M2/1‑135 (MQ=255) gCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatcag > 2:763270‑M2/1‑135 (MQ=255) tcatTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatcagagt > 3:431308‑M2/1‑132 (MQ=255) tattatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttat > 2:206106/1‑141 (MQ=255) attatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttatt > 2:517886/1‑141 (MQ=255) attatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttatt > 2:552979/1‑141 (MQ=255) ttatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttattt < 2:215012/141‑1 (MQ=255) tatGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttatttt > 2:972257/1‑141 (MQ=255) tatGATTTTAATTTTATGACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTttttatttt < 3:230119/141‑1 (MQ=255) attttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGtt < 1:630211/141‑1 (MQ=255) ttttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑a > 1:553660/1‑141 (MQ=255) ttttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑a > 4:222243/1‑141 (MQ=255) ttttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑a < 4:339126/141‑1 (MQ=255) tttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtat < 1:301743‑M2/119‑4 (MQ=255) tttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtat > 2:301743‑M2/1‑116 (MQ=255) tttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑aa > 2:808749/1‑141 (MQ=255) ttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑aat < 1:370890/141‑1 (MQ=255) ttaattttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTt‑aat > 2:885364/1‑141 (MQ=255) attttaTTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTCATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑aataat > 2:1178588/1‑141 (MQ=255) ttattaCTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATAtt > 3:34578/1‑141 (MQ=255) ctattaCCATCACTTAAAAGACACCCTGAAACATTAGATGACTACGAACAGAAAGATAGTCTTTCTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAACAtt > 2:1134556/2‑141 (MQ=255) aCTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCa > 1:747354/1‑141 (MQ=255) tCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTg < 1:1051490/141‑1 (MQ=255) cTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGta > 3:331991/1‑141 (MQ=255) aaaGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATaaa > 1:530098/1‑141 (MQ=255) aaaGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCACAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAAAATTTTTCACTTGGAATaaa > 2:591831/1‑141 (MQ=255) aGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATaaaaa < 1:319049/141‑1 (MQ=255) aaCCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGcgt > 2:877807/1‑141 (MQ=255) aCCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGcgtc < 1:98653/141‑1 (MQ=255) cTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGcgtcgt < 2:790812/141‑1 (MQ=255) aaaCATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGc > 1:497373/1‑141 (MQ=255) aaCATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGct < 4:101578/141‑1 (MQ=255) aCATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGctc < 1:802879/141‑1 (MQ=255) aCATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGctc < 1:962598/141‑1 (MQ=255) aTTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTg < 1:1115782/141‑1 (MQ=255) ttAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCAAAAAATATAAAAAGCGTCGTCGCTCTgg < 2:758886/141‑1 (MQ=255) ttAGATGAATAAGAAAACACTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTgg < 1:170629/141‑1 (MQ=255) tAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGt > 3:53696/1‑141 (MQ=255) gATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGAAAAATAAT‑TTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTAt < 1:871083/141‑1 (MQ=255) gATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAAAGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTAt < 1:596400/141‑1 (MQ=255) aTGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATc < 4:481396/141‑1 (MQ=255) aTGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGGTGTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGGCGTCGCTCTGGTATc > 1:414345/1‑141 (MQ=255) aaTAAGAAAACTCTGATAATCTCTTTAGCAATTTACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATTGTTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTGTCACTTGTTATAAAAAGCGTCGTCGTTCTGGTATCGGa < 2:358680/141‑1 (MQ=255) aaTAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGa > 1:1007990/1‑141 (MQ=255) aaTAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGa < 1:1071910/141‑1 (MQ=255) aaTAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGa < 3:257865/141‑1 (MQ=255) aGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTTGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCTTCGCTCTGGTATCTGAAATa > 2:444529/1‑141 (MQ=255) gAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATACAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATAc > 2:388728/1‑141 (MQ=255) gAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATAc > 3:265493/1‑141 (MQ=255) aaaaCTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACt > 1:132772/1‑141 (MQ=255) aaaCTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTg < 3:222243/141‑1 (MQ=255) aaCTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatcagagttttcttattcatctaatgtttcaggttgtcttttaagtgatagtaataaaattaaaatcataataagaatg < 2:259606‑M2/141‑81 (MQ=255) tctGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATa < 1:899846/141‑1 (MQ=255) ctGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATaa < 2:577813/141‑1 (MQ=255) gATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAat < 2:1020554/141‑1 (MQ=255) gATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAat < 2:664687/141‑1 (MQ=255) aTAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGAtatcagagttttcttattcatctaatgtttcaggttgtcttttaagtgatagtaataaaattaaaatcatactaagaatgatgccta < 1:811520‑M2/141‑88 (MQ=255) aTAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAata < 1:818210/141‑1 (MQ=255) aTAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAata < 3:162346/141‑1 (MQ=255) aTAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGGATTTACCTTATAGGTGATATCAGATTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAata < 1:950301/141‑1 (MQ=255) aaaTCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAatat < 2:487304/140‑1 (MQ=255) cACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGaa > 2:196262/1‑141 (MQ=255) tAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGt < 1:581756/141‑1 (MQ=255) tAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGt < 1:793046/141‑1 (MQ=255) aGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAatat < 1:436883/141‑1 (MQ=255) aGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAatat > 2:1105009/1‑141 (MQ=255) gTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATc > 2:779518/1‑141 (MQ=255) tAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATcc > 1:688384/1‑141 (MQ=255) tAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTCGGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATcc < 3:362365/141‑1 (MQ=255) cTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAgg > 4:135321/1‑141 (MQ=255) attagtTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑GATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGta < 4:437532/141‑1 (MQ=255) tAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTATTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGt > 4:232365/1‑141 (MQ=255) aacaacGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTc > 1:1139915/1‑141 (MQ=255) aacaacGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTc > 2:996593/1‑141 (MQ=255) acGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTTTCTTTTTTTAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAATTCTTGt > 2:1084290/1‑141 (MQ=255) cGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGtt > 1:424424/1‑141 (MQ=255) gTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTc < 4:480167/141‑1 (MQ=255) gTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTc > 1:71464/1‑141 (MQ=255) gTAGTTACCTTATAGGGGATATCAGAGGTTTTTACTTTAGTT‑AATAATATTTTGCACTTGTTATAAAAAGCTGCGTCGCTCTTGGGTCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATAGCCAGGTATAAAGTCATGTTc > 3:20659/1‑141 (MQ=255) tAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCg < 4:17491/141‑1 (MQ=255) gTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGAt > 3:463742/1‑141 (MQ=255) gTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCAAGGTATAAAGTCATGTTCGAt > 2:481537/1‑141 (MQ=255) ttATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCttt < 2:328556/141‑1 (MQ=255) taGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATAGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGc < 4:265493/141‑1 (MQ=255) ggTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCAc < 2:17450/141‑1 (MQ=255) gTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACt > 2:61772/1‑141 (MQ=255) gTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACt < 1:923715/141‑1 (MQ=255) tGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTc < 2:870967/141‑1 (MQ=255) tGATATCAGAGTTTTTTATTTTAATT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTc < 3:42344/141‑1 (MQ=255) gATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTca < 1:980893/141‑1 (MQ=255) gATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTca < 3:396014/141‑1 (MQ=255) gATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTca > 1:1091111/1‑141 (MQ=255) atatCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTcaa > 1:258721/1‑141 (MQ=255) atatCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTcaa < 2:825180/141‑1 (MQ=255) | CGTAGGCATCATTCTTATTATGATTTTAATTTTATTACTATCACTTAAAAGACAACCTGAAACATTAGATGAATAAGAAAACTCTGATAATCACTTTAGCAAGTAACTATTATTTAACAACGTAGTTACCTTATAGGTGATATCAGAGTTTTTTATTTTAGTT‑AATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGTCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTCAA > USA300TCH1516_ALE/2669988‑2670267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |