New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CACTATCATAAACTTTTAGGAATGGGTAGTAAATAATAATATCTACAACAATCAAAGTAATAGCTAGTACGAATGACCATAAACCAAAACCTGTACCCATGATAATGCCCAATGGACCTGGTGTTGTCCAAGGTAAATTCACACTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAATTGGTTCGTTTACACCAAAGAATGTTGGT > USA300TCH1516_ALE/2328415‑2328707 | cACTATCATAAACTTTTAGGAAGGGGTAGTAAATAATAATATCTACAACAATCAAAGTAATAGCTAGTACGAATGACCATAAACCAAAACCTGTACCCATGATAATGCCCAATGGACCTGGTGTTGTCCAAGGTAAATTCACACTaaaa > 1:618135/1‑149 (MQ=255) aCTATCATAAACTTTTAGGAATGGGTAGTAAATAATAATATCTACAACAATCAAAGTAATAGCTAGTACGAATGACCATAAACCAAAACCTGTACCCATGATAATGCCCAATGGACCTGGTGTTGTCCAAGGTAAATTCACACTAAAAc < 1:280323/149‑1 (MQ=255) aCTATCATAAACTTTTAGGAATGGGTAGTAAATAATAATATCTACAACAATCAAAGTAATAGCTAGTACGAATGACCATAAACCAAAACCTGTACCCATGATAATGCCCAATGGACCTGGTGTTGTCCAAGGTAAATTCACACTAAAAc < 2:3953/149‑1 (MQ=255) 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ggACCTGGTGTTGTCCAAGGTAAATTCACACTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATaa > 2:876757/1‑149 (MQ=255) cTGGTGTTGTCCAAGGTAAATTCACACTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAGATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACGAGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAAtt > 2:625429/1‑149 (MQ=255) cTGGTGTTGTCCAAGGTAAATTCACACTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAAtt > 2:848158/1‑149 (MQ=255) gtgtTGTCCAAGGTAAATTCACACTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAATTGGt < 2:452101/149‑1 (MQ=255) tgttgtCCAAGGTAAATTTACACTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCATCGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAATTGGtt < 1:604355/149‑1 (MQ=255) tgtCCAAGGTAAATTCACACTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAATTGGTTCGt < 1:779673/149‑1 (MQ=255) tAAATTCACACTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACAAGTGGTGCACCAAATAAAATTGGTTCGTTTACACCaa > 1:206604/1‑149 (MQ=255) aTTCACACTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAATTGGTTCGTTTACACCAAAGa > 2:33729/1‑149 (MQ=255) aTTCACACTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAATTGGTTCGTTTACACCAAAGa < 1:271504/149‑1 (MQ=255) acacTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAATTGGTTCGTTTACACCAAAGAATGt > 2:935799/1‑149 (MQ=255) acacTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAATTGGTTCGTTTACACCAAAGAATGt > 2:392273/1‑149 (MQ=255) tAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTATCAAAAGTCAGACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAATTGGTTCGTTTACACCAAAGAATGTTGGt < 1:755752/149‑1 (MQ=255) | CACTATCATAAACTTTTAGGAATGGGTAGTAAATAATAATATCTACAACAATCAAAGTAATAGCTAGTACGAATGACCATAAACCAAAACCTGTACCCATGATAATGCCCAATGGACCTGGTGTTGTCCAAGGTAAATTCACACTAAAACTATTCATTCCTAACACTTCAACGAAAAGTTTGAAAATCCATACGTTAACAATTGGTGCTAATACAAATGGAATAAAGAACACAGGATTCAATACTAGTGGTGCACCAAATAAAATTGGTTCGTTTACACCAAAGAATGTTGGT > USA300TCH1516_ALE/2328415‑2328707 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |