| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 895785 = | 51 (0.670) | 10 (0.150) | 8/226 | NT | 18.1% | coding (806/822 nt) | USA300HOU_0849 | ABC superfamily ATP binding cassette transporter, binding protein |
| ? | CP000730 | = 909740 | 46 (0.690) | intergenic (‑663/‑371) | ear/USA300HOU_0868 | Ear protein/hypothetical protein | |||||
AAGTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACAAAAAAATA > CP000730/895645‑895925 | ggttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtctggataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaat > 1:673269‑M1/141‑141 (MQ=255)ggttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaat > 1:46440‑M1/141‑141 (MQ=255)aaGTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGt < 1:136334/141‑1 (MQ=255) gttgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaggggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaatt < 2:216657‑M1/2‑1 (MQ=255) aGTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGtt < 2:426196/141‑1 (MQ=255) ttgttttcaagtgcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccgtgaacttccttgataatctggctaatta < 1:816473‑M1/3‑1 (MQ=255) ctgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaatta > 2:860351‑M1/139‑141 (MQ=255) tgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaatagtagattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttaattgcccttgaacttccttgatagtctggctaatgat < 1:759223‑M1/4‑4 (MQ=255) tgttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaattat < 1:382326‑M1/4‑1 (MQ=255) tGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGAAGTTAt > 2:714762/1‑141 (MQ=255) tttttcaagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaattatt > 1:636640‑M1/137‑141 (MQ=255) tttcaagggcaaaaaaagggcataattgtgagacaaaggggaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTcc > 2:570787‑M1/135‑141 (MQ=255) ttcaagggcaaaaaaagggcaaaattatgaaacaaagggcaagggtataaataatagattagcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttcattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCt > 1:117228‑M1/134‑141 (MQ=255) aaaGAGTATCCTTAAGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCt < 2:733733/141‑1 (MQ=255) aaGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTg < 1:278703/141‑1 (MQ=255) aagggcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtaggaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCt < 1:515630‑M1/11‑1 (MQ=255) agggcaaaaaaagggcataatcttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTa < 1:466642‑M1/12‑1 (MQ=255) gcaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAaat < 1:54300‑M1/15‑1 (MQ=255) gcaaaaaaagggcataattatgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAaat > 1:844754‑M1/127‑141 (MQ=255) caaaaaaaaggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttcataatctggctaaTTATTCCTGCTAaata > 2:837429‑M1/126‑141 (MQ=255) aaaaaaaagggcataattttgaaacaaagggcaagggtatgaataataaattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAaata > 2:795801‑M1/126‑141 (MQ=255) cTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCACTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAaataat < 1:623243/141‑1 (MQ=255) gCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCaa < 1:82446/141‑1 (MQ=255) aaCTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATta < 2:487949/141‑1 (MQ=255) aaCATAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATta < 2:312537/141‑1 (MQ=255) aCTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaa < 1:8091/141‑1 (MQ=255) tAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATtaaata < 1:511167/141‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTTTTCCTGCTAAATAATACCAATacaataa > 1:319073/1‑141 (MQ=255) ttGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTCATGAAAAATACAATGGTCCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATaaaa > 2:865483/1‑141 (MQ=255) ttGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATaaaa < 2:142818/141‑1 (MQ=255) aaaGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATAACAATTAAATAAAAATACCCtt < 1:715302/141‑1 (MQ=255) aagaagGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCttt < 2:243774/141‑1 (MQ=255) gaagGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTtaa > 1:219639/1‑141 (MQ=255) gaagGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTtaa < 1:504711/141‑1 (MQ=255) ggACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATCAAAATACCCTTtaataa > 1:421728/1‑141 (MQ=255) ggACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTtaataa > 2:888805/1‑141 (MQ=255) aTCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCCATTAAATAAAAATACCCTTTAATaacaac > 1:148403/1‑141 (MQ=255) aTCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATaacaac > 2:303078/1‑141 (MQ=255) tCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACg > 2:181022/1‑141 (MQ=255) aaGAAAATCAAAGCATTACTTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAAACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAAAAACGATTAATGGGt > 2:56872/1‑141 (MQ=255) aaGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCACGACTACATTAATAAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGt > 2:327412/1‑141 (MQ=255) aaGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGt < 2:782908/141‑1 (MQ=255) aGAAAAACAAAGCATTAATAGAAGAATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGtt < 1:869073/141‑1 (MQ=255) aattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCGATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACACCGATTAAGGGGTTa < 1:81497‑M1/64‑1 (MQ=255) aattatcttgaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTa > 1:480600‑M1/78‑141 (MQ=255) attatttttaaaattttataaatgcatatataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTAt > 2:37825‑M1/77‑141 (MQ=255) aTTGAAGTATTACAACCTAAAGATATGCAAGACTGCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCTATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGAGTTATTTTTGTGGTATTGaa < 1:550868/141‑1 (MQ=255) ataacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCACTTAAATAAAAATACCCTTTAATAATAACGATTAAGGGGTTATTTTTTTGGTATTGAAACAAAAAAAGAGca < 1:832159‑M1/94‑1 (MQ=255) cTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGcaca < 1:148750/141‑1 (MQ=255) aacaatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGcaca < 2:663795‑M1/96‑1 (MQ=255) aatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACaaaa > 2:466642‑M1/43‑141 (MQ=255) aatgttttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGGGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACaaaa > 2:382326‑M1/43‑141 (MQ=255) aatattttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaGTATTCCTGCTAAATAATACGAATTAAATAAAAATACCCTTTAACAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACaaaa > 2:759223‑M1/43‑141 (MQ=255) atatTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAggg < 1:513519/141‑1 (MQ=255) atTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATACCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACAATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGAGCACAAAAGGGGc > 2:862868/1‑141 (MQ=255) ttgattgcccttgaacttccttgataatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCa < 2:787413‑M1/105‑1 (MQ=255) cAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAACAAGGGCACAAAAGGGGCAGt > 1:533823/1‑141 (MQ=255) cAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGt > 2:606597/1‑141 (MQ=255) aaGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGta > 2:342108/1‑141 (MQ=255) aaGACTTCATAAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGta > 2:615951/1‑141 (MQ=255) aGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAGATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTCAGGGGTTATGTTTGTGGTATTGAAAATAAAAACGGGCACAAATGGGGCAGttt > 1:548252/1‑139 (MQ=255) aGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCCGtat > 2:57497/1‑141 (MQ=255) aGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATAGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGtat > 1:800314/1‑141 (MQ=255) cTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATg < 1:659800/141‑1 (MQ=255) cTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATg < 1:311713/141‑1 (MQ=255) cTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATg < 1:869917/141‑1 (MQ=255) attgaTTAATGAAAAATAGAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACAAATTAAATAAAAATATTAGTTAAGAAGCACGTGTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATg < 2:780450/137‑1 (MQ=255) ttCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATTCCTATTAAATAAGAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGc < 2:152591/141‑1 (MQ=255) aTTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCaaa > 2:814087/1‑141 (MQ=255) ttAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAAt > 1:181714/1‑141 (MQ=255) aTGAAAAATACAATAGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATAAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTAt < 1:736187/141‑1 (MQ=255) gAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCg < 1:816649/141‑1 (MQ=255) gAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCg < 1:354881/141‑1 (MQ=255) gAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCg < 1:199981/141‑1 (MQ=255) caaaatggtaaTGGTGCGGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAGATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCg < 2:224932/132‑1 (MQ=255) aaaaaaTACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCg < 1:200232/140‑1 (MQ=255) aTACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAACAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAAttt > 1:624555/1‑141 (MQ=255) aTACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGCATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAGttt > 1:62757/1‑141 (MQ=255) taatctggctaaTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTa < 2:350327‑M1/129‑1 (MQ=255) tGGTTCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAACACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACa < 1:54083/141‑1 (MQ=255) tggctaattATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATAACCTTTAATAACATCTAGTAAGGGTCTTTTTTTATGCTCTCATGAGGAAAAAAGATGACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTAAAGAATTTTAAACaa > 2:642171/8‑141 (MQ=255) tGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTaaaacaaa > 2:627378/1‑136 (MQ=255) aGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACaaaaaaa > 2:318826/1‑141 (MQ=255) aGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAAATATCGAATTTTAAACaaaaaaa > 2:659119/1‑141 (MQ=255) aGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGGTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAACGGCACAAAAGGCCCACTATATGCAAATGACAGAAATTTAAACaaaaaaa > 1:195610/1‑141 (MQ=255) TTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACAAAAAAATa < 1:347532‑M1/141‑1 (MQ=255) | AAGTGCGAAAGATAATCCTTATGCAAACTTAATTGCTGTTAAAGAAGGACATCAAGATGATAAGAAAATCAAAGCATTAATTGAAGTATTACAATCTAAAGATATTCAAGACTTCATTAATGAAAAATACAATGGTGCAGTTATTCCTGCTAAATAATACCAATTAAATAAAAATACCCTTTAATAACAACGATTAAGGGGTTATTTTTGTGGTATTGAAAATAAAAAAGGGCACAAAAGGGGCAGTATATGCAAATTATCGAATTTTAAACAAAAAAATA > CP000730/895645‑895925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |